Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07882
Subject:
XM_006514231.2
Aligned Length:
1191
Identities:
1027
Gaps:
121

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------MIAVSFKCRCQILRRLT  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  MTCSGPLHQPRGIKLCHSPLGLPFSWYVRKEFTCCRSPLQPPEQSPCVHFAREQRARMIAVSFKCRCQILRRLT  74

Query   18  KDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAAR  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  KDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAAR  148

Query   92  SDQLDVGDYIKAVNGINLAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSSVIFRTVEVTLHKEGNTFGFV  165
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  SDQLDVGDYIKAVNGINLAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSSVMFRTVEVTLHKEGNTFGFV  222

Query  166  IRGGAHDDRNKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQCGQEAALLIEYDVS  239
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  IRGGAHDDRNKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQCGQEATLLIEYDVS  296

Query  240  VMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSASIADRCGALHVGDHILSIDGTSMEYCT  313
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  VMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSVCCNKQVIVIDKIKSASIADRCGALHVGDHILSIDGTSMEYCT  370

Query  314  LAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPDHA---------------------------------------  348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.                                       
Sbjct  371  LAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPDHVKIQRSDRQHPWDAWASNQCGVHTNHHHNTYHPDHCRVPA  444

Query  349  -------------ALVSSSFSPTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGL  409
                         |.|.|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  LTFPKALPPNSPPAMVPSS-SPTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGL  517

Query  410  AGQVVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDS  483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  AGQVVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDS  591

Query  484  TFEEASQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGS  557
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  TFEEANQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHSVELGITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGS  665

Query  558  VAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDNSDEQESSGAIIYTVELKRYGGPL  631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  VAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDNSDEQESSGAIIYTVELKRYGGPL  739

Query  632  GITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDA  705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  GITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDA  813

Query  706  QSASSPKKFPISSHLSDLGDVEEDSSPAQKPGKLSDMYPSTVPSVDSAVDSWDGSAIDTSYGTEGTSFQASGYN  779
            |||||||||||..|..||||.|||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||.|||..|..||.||||
Sbjct  814  QSASSPKKFPIPGHSGDLGDGEEDPSPIQKPGKLSDAYPSTVPSVDSAVDSWDGSGIDASYGSQGSTFQTSGYN  887

Query  780  FNTYDWRSPKQRGSLSPVTKPRSQTYPDVGLSYEDWDRSTASGFAGAADSAETEQEENFWSQALEDLETCGQSG  853
            .|||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  888  YNTYDWRSPKQRTSLSPVPKPRSQTYPDVGLSNEDWDRSTASGFVGASDSADAEQEENFWSQALEDLETCGQSG  961

Query  854  ILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGSTMSLNHEAPTPRSQLGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGR  927
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  ILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGSTMSLNHEAPMARSQLGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGR  1035

Query  928  KSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSDMEDFGFSVADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQ  1001
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036  KSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSGMEDFGFSVADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDVGGLKPYDRLLQ  1109

Query 1002  VNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETREPTNT  1075
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||.|||||||||||||||||     .|..|
Sbjct 1110  VNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIEQPALPSDWSEQNSAFFQQPSHGG-----IPGDT  1178

Query 1076  L------  1076
            .      
Sbjct 1179  VYFWQSL  1185