Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07882
Subject:
XM_006514234.2
Aligned Length:
3569
Identities:
2791
Gaps:
436

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACATGTAGCGGACCTCTGCATCAGCCAAGAGGAATTAAGCTTTGTCACTCCCCACTGGGACTACCTTTCTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGGTATGTGCGCAAGGAATTCACATGCTGCCGCTCGCCGCTGCAGCCACCAGAGCAGAGCCCCTGTGTACACT  148

Query    1  -----------------------ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACT  51
                                   ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  149  TTGCCAGAGAGCAGAGAGCAAGAATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACC  222

Query   52  AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACA  125
            ||                                                                        
Sbjct  223  AA------------------------------------------------------------------------  224

Query  126  GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGA  199
                     ||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct  225  ---------AGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGA  289

Query  200  CGGTATCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGA  273
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  290  CGGTATCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGA  363

Query  274  AGTGACCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGA  347
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  364  AGTGACCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGA  437

Query  348  GATCATCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG  421
            ||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  GATCATCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG  511

Query  422  TGCAAGGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTA  495
            |.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  512  TACAAGGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTC  585

Query  496  ATTCGAGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCC  569
            ||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  586  ATCCGAGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCC  659

Query  570  TGCTGACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTA  643
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  660  TGCTGACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCA  733

Query  644  CGCATGCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCA  717
            |.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  734  CCCATGCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCT  807

Query  718  GTAATGGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGG  791
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  808  GTGATGGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGG  881

Query  792  GGTTGCCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTG  865
            ||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  882  GGTTGCCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTG  955

Query  866  CAGACAGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACA  939
            |.||||||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct  956  CGGACAGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACC  1029

Query  940  CTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGAC  1013
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1030  CTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGAC  1103

Query 1014  CCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATG---------------------------------------------  1042
            |||.||||||||||||||.||.|||||||                                             
Sbjct 1104  CCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGG  1177

Query 1043  --------------------------------------------------------------------------  1042
                                                                                      
Sbjct 1178  CCAGCAACCAGTGCGGCGTTCATACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCC  1251

Query 1043  -------------------------------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCAT  1079
                                                 |.|||.|||||.|.|||||   .||||||||||||||
Sbjct 1252  CTGACTTTCCCGAAAGCGCTTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCAT  1322

Query 1080  GAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAA  1153
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1323  GAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAA  1396

Query 1154  CCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1397  CCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTG  1470

Query 1228  GCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCA  1301
            |||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1471  GCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCA  1544

Query 1302  ACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCC  1375
            ||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1545  ACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCC  1618

Query 1376  CAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGC  1449
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1619  CAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGC  1692

Query 1450  ACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGA  1523
            ||||||||.|||||||.|||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1693  ACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGA  1766

Query 1524  TGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTG  1597
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||
Sbjct 1767  TGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTG  1840

Query 1598  GAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGT  1671
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1841  GAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGT  1914

Query 1672  GTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTG  1745
            ||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1915  GTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTG  1988

Query 1746  TTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAG  1819
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989  TTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAG  2062

Query 1820  ATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTT  1893
            ||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2063  ATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTT  2136

Query 1894  GGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGC  1967
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137  GGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGC  2210

Query 1968  TGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTC  2041
            ||||||.|||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2211  TGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTC  2284

Query 2042  TGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCC  2115
            ||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285  TGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCC  2358

Query 2116  CAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTC  2189
            ||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.|
Sbjct 2359  CAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCC  2432

Query 2190  CTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGG  2263
            |||.|||..||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2433  CTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGG  2506

Query 2264  ATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAAT  2337
            |.||.|||||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.||||||||||||
Sbjct 2507  ACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAAT  2580

Query 2338  TTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGAC  2411
            |.||||||||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 2581  TACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGAC  2654

Query 2412  TTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATA  2485
            .||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.|
Sbjct 2655  GTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACA  2728

Query 2486  GTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGA  2559
            |||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 2729  GTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGG  2802

Query 2560  ATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCAT  2633
            ||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2803  ATCCTGAGAGAGCTTGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCAT  2876

Query 2634  GTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCC  2707
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877  GTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCC  2950

Query 2708  AGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGG  2781
            ||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 2951  AGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGA  3024

Query 2782  AAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAA  2855
            |||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 3025  AAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAA  3098

Query 2856  GGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAG  2929
            |||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|
Sbjct 3099  GGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCG  3172

Query 2930  TGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAG  3003
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3173  TGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAG  3246

Query 3004  GTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCT  3077
            ||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 3247  GTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCT  3320

Query 3078  GGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGA  3151
            |||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.||||
Sbjct 3321  GGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGA  3394

Query 3152  GTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAACCCACT-AAT  3222
            |.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||| .|||  ||||||          .||| .||
Sbjct 3395  GCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GATTCCTGGAGA----------TACTGTAT  3457

Query 3223  ACATTA-----------  3228
            ||.||.           
Sbjct 3458  ACTTTTGGCAAAGCCTC  3474