Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07882
- Subject:
- XM_006514238.2
- Aligned Length:
- 3430
- Identities:
- 2841
- Gaps:
- 245
Alignment
Query 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTC----------AAAT-----TCTGAGGCGACTTACTAA------ 53
|||||| |.| |.|| |||| ||||| ||
Sbjct 1 --------------------ATGCCG--GGCTGGAAGAAGAACATCCCCATCTG------CTTAC-AAGCGGAG 45
Query 54 -----------AGATGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGT 116
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 46 GAGCAGGAGAGAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGT 119
Query 117 GAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCC 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 120 GAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTC 193
Query 191 TGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATT 264
|.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct 194 TTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATC 267
Query 265 GCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCG 338
|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 268 GCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCG 341
Query 339 CCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCAC 412
|||.||.||||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 342 CCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCAC 415
Query 413 CGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTT 486
||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 416 CGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTT 489
Query 487 GGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCC 560
||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 490 GGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCC 563
Query 561 TGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTC 634
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 564 TGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCC 637
Query 635 TTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATAT 708
|.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.
Sbjct 638 TGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATAC 711
Query 709 GATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGC 782
||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 712 GATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGC 785
Query 783 CAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTG 856
|||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 CAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTG 859
Query 857 CAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAG 930
||||.|||||.||||||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||
Sbjct 860 CAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAG 933
Query 931 TACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCA 1004
||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 934 TACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACA 1007
Query 1005 TCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATG------------------------------------ 1042
.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1008 CCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGG 1081
Query 1043 -------------------------------------------------------------------------- 1042
Sbjct 1082 ATGCCTGGGCCAGCAACCAGTGCGGCGTTCATACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGA 1155
Query 1043 ----------------------------------------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCC 1070
|.|||.|||||.|.||||| .|||||
Sbjct 1156 GTGCCAGCCCTGACTTTCCCGAAAGCGCTTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCC 1226
Query 1071 TACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCC 1144
|||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227 TACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCC 1300
Query 1145 CACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACA 1218
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.
Sbjct 1301 CACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACT 1374
Query 1219 GTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATT 1292
||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1375 GTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTT 1448
Query 1293 TGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAG 1366
.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1449 CGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAG 1522
Query 1367 CTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACA 1440
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1523 CTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACA 1596
Query 1441 GAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAAT 1514
|||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1597 GAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAAT 1670
Query 1515 CGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATG 1588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct 1671 CGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCG 1744
Query 1589 TGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAG 1662
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1745 TGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAG 1818
Query 1663 AAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCT 1736
|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1819 AAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCT 1892
Query 1737 GGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCA 1810
|||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 GGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCA 1966
Query 1811 AAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGG 1884
|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1967 AAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGG 2040
Query 1885 GGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGG 1958
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2041 GGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGG 2114
Query 1959 GGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAG 2032
|||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2115 GGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGG 2188
Query 2033 GGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAG 2106
|||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2189 GGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAG 2262
Query 2107 ACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGA 2180
|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..||
Sbjct 2263 ACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGA 2336
Query 2181 GGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACA 2254
|||||||.||||.|||..||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2337 GGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACA 2410
Query 2255 GTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCA 2328
||||||||||.||.|||||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||
Sbjct 2411 GTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCA 2484
Query 2329 GGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCG 2402
||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.||||||||
Sbjct 2485 GGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCG 2558
Query 2403 AAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGG 2476
|||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 2559 AAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGG 2632
Query 2477 CTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGA 2550
||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.
Sbjct 2633 CTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGC 2706
Query 2551 CAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGC 2624
|||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2707 CAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGC 2780
Query 2625 AACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGG 2698
||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2781 AACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGG 2854
Query 2699 CCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGAT 2772
|||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2855 CCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGAC 2928
Query 2773 GTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGA 2846
|||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 2929 GTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGA 3002
Query 2847 GCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGG 2920
|||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||
Sbjct 3003 GCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGG 3076
Query 2921 AGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGG 2994
|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 3077 AGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGG 3150
Query 2995 CTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGG 3068
|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 3151 CTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGG 3224
Query 3069 GAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAG 3142
.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..
Sbjct 3225 CAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCA 3298
Query 3143 GAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAAC 3214
|.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||| .||| ||||||
Sbjct 3299 GCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GATTCCTGGAGA--------- 3362
Query 3215 CCACT-AATACATTA----------- 3228
.||| .||||.||.
Sbjct 3363 -TACTGTATACTTTTGGCAAAGCCTC 3387