Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07882
- Subject:
- XM_006514239.2
- Aligned Length:
- 3448
- Identities:
- 2804
- Gaps:
- 287
Alignment
Query 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATG--CCG-----------TTGTCAA----ATTCTGAGGCGACTTA-CTA-AAG 55
||| ||| ||||||| ||||.||| | ||| .||
Sbjct 1 --------------------ATGGACCGCTTCCTGGGATTTGTCAAGCAGATTCGGAG-------ATCTAGGAG 47
Query 56 ATGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAG---CCGCCTGA-----------TGGAGCGTTGGCTG 115
|.||.|| ..||.|||| |.|||.|| .|||| ||||.
Sbjct 48 AAGAAAG----------------------GGGAAAAAGTACCGGCCGGAAGAGGACTACCAGGAG----GGCTA 95
Query 116 TGAGGA---------------GACAGAGCA--TCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGA 172
.||||| ..|.||||| |.|.|.||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||
Sbjct 96 CGAGGATGTCTATTACTATGCTTCGGAGCATTTTCGAAAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGA 169
Query 173 AGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAAT 246
|||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 170 AGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAAC 243
Query 247 CTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAAT 320
||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 244 CTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGAT 317
Query 321 CAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAG 394
||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 318 CAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGG 391
Query 395 TAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACAT 468
|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.
Sbjct 392 TCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCAC 465
Query 469 AAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGT 542
|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 466 AAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGT 539
Query 543 GATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTG 616
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 540 GATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCG 613
Query 617 TGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCA 690
||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 614 TGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCC 687
Query 691 GCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGT 764
.|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 688 ACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGT 761
Query 765 TGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCA 838
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 762 TGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCA 835
Query 839 TAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATC 912
||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 836 TAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATT 909
Query 913 GATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAA 986
||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 910 GACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAA 983
Query 987 GCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATG------------------ 1042
|||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 984 GCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCG 1057
Query 1043 -------------------------------------------------------------------------- 1042
Sbjct 1058 ACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGGCCAGCAACCAGTGCGGCGTTCATACCAACCATCACCATAACACGTAC 1131
Query 1043 ----------------------------------------------------------------CAGCTTTGGT 1052
|.|||.||||
Sbjct 1132 CACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCCCTGACTTTCCCGAAAGCGCTTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGT 1205
Query 1053 GTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAA 1126
|.|.||||| .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1206 GCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAA 1276
Query 1127 GCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTG 1200
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1277 GCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTG 1350
Query 1201 TCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGC 1274
||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 TCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGC 1424
Query 1275 AGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTC 1348
.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1425 TGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTC 1498
Query 1349 TGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCC 1422
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1499 TGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCC 1572
Query 1423 ATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAG 1496
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||..||||||||||.||||||||
Sbjct 1573 ATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAG 1646
Query 1497 CAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGC 1570
|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1647 CAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAAC 1720
Query 1571 TGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTC 1644
||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1721 TGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTT 1794
Query 1645 GTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGC 1718
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||
Sbjct 1795 GTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGC 1868
Query 1719 AATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGG 1792
.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1869 GATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGG 1942
Query 1793 TGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTG 1866
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1943 TGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTG 2016
Query 1867 GAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCAT 1940
|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2017 GAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCAT 2090
Query 1941 TTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCA 2014
.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||
Sbjct 2091 CTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCA 2164
Query 2015 ATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACC 2088
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2165 ATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACC 2238
Query 2089 TTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAG 2162
.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|
Sbjct 2239 CTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGG 2312
Query 2163 TGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCA 2236
.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||
Sbjct 2313 GGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCA 2386
Query 2237 CGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGC 2310
||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||
Sbjct 2387 CGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGC 2460
Query 2311 ACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTC 2384
.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.||||
Sbjct 2461 TCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTC 2534
Query 2385 CCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAG 2458
|||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2535 CCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAG 2608
Query 2459 CCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAG 2532
|||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||
Sbjct 2609 CCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAG 2682
Query 2533 GATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAG 2606
||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2683 GACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAG 2756
Query 2607 AAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCA 2680
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||...||||||
Sbjct 2757 AAACATGACCCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCA 2830
Query 2681 GTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGC 2754
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 2831 GTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGC 2904
Query 2755 AACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCAT 2828
|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2905 AACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCAT 2978
Query 2829 GTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTG 2902
|||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2979 GTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTG 3052
Query 2903 TAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGC 2976
|.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||
Sbjct 3053 TGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGC 3126
Query 2977 TTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCC 3050
||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 3127 TTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCC 3200
Query 3051 CCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAG 3124
.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 3201 TCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAG 3274
Query 3125 ACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAAT 3198
|.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||| .||
Sbjct 3275 AACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GAT 3347
Query 3199 T--TGGAGACACGAGAACCCACT-AATACATTA----------- 3228
| |||||| .||| .||||.||.
Sbjct 3348 TCCTGGAGA----------TACTGTATACTTTTGGCAAAGCCTC 3381