Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07929
• Subject: XM_011530041.3
• Aligned Length: 1849
• Identities: 1578
• Gaps: 269

Alignment

Query    1  ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA  74

Query   75  GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG  148

Query  149  TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG  222

Query  223  ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG  296

Query  297  GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA  370

Query  371  ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG  444

Query  445  CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA  518

Query  519  TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA  592

Query  593  AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA  666

Query  667  GCCACCATGAAGGCCCCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAATGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCACCATGAAGGCCCCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAACGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCAG  740

Query  741  CGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTGC  814

Query  815  GCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCAC  888

Query  889  TGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCTT  962

Query  963  CCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATACT  1036

Query 1037  GGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAAC  1110

Query 1111  TCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTCTTCATCACGTTTCGCTCCTGTGCCTACCTGGACAAGAAGCATAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTCTTCATCACGTTTCGCTCCTGTGCCTACCTGGACAAGAAGCATAC  1184

Query 1185  CATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACGTACTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCCAAAACTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACGTACTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCCAAAACTG  1258

Query 1259  ACCGCCCTAAGGAGGAGATCCGCATTGATGCCACTACAGTGTTCGTGGACCCCTATGAGGAGGCCGATGCCCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCGCCCTAAGGAGGAGATCCGCATTGATGCCACTACAGTGTTCGTGGACCCCTATGAGGAGGCCGATGCCCAG  1332

Query 1333  ATTGCGCAGGAGCGGAAGACACAGCTCAAGGTAGCCCCGGAGACCAAAGTGAAGAGCAGCCAGCCCCAGGCAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTGCGCAGGAGCGGAAGACACAGCTCAAGGTAGCCCCGGAGACCAAAGTGAAGAGCAGCCAGCCCCAGGCAGG  1406

Query 1407  GAGCCAGGGCCCCCAGACCTTCCGCCAGGGCGTGGGCAAGTACATCAACCCAGCAGCCACCGAGCAGCAGAGGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCCAGGGCCCCCAGACCTTCCGCCAGGGCGTGGGCAAGTACATCAACCCAGCAGCCACCGAGCAGCAGAGGA  1480

Query 1481  AGAGCCCTCAACCAGTGCCACTGTCCCCATGTCCAAGAAGAAGCCCAGTCGGGGTTTTGGGGACTTCAGCTCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAGCCCTCAACCAGTGCCACTGTCCCCATGTCCAAGAAGAAGCCCAGTCGGGGTTTTGGGGACTTCAGCTCCT  1554

Query 1555  GGTAGCAGCAGGCTGCC------------TGAT-------------------GACCAC----------------  1581
            |||||||||||||| ||            ||||                   ||||.|                
Sbjct 1555  GGTAGCAGCAGGCT-CCAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTCACTGCAGCCTCGACCTCCTGGGCTCAAGCAATC  1627

Query 1582  --------------------------------------------------------------------------  1581
                                                                                      
Sbjct 1628  CTCCTGCCTCAGCCTCGCAAGTAGCTGGGACTACAGCCGTGCACCACTACATCCAGCTGTATATGTCTGGTTTT  1701

Query 1582  --------------------------------------------------------------------------  1581
                                                                                      
Sbjct 1702  CTTACCCCTACTTCTGTCATCTTCTCAGGGACAGCCTATTTATACAACCAGTGTGGTCCCCTGACCAACGCCAT  1775

Query 1582  -------------------------------------------------------------------------  1581
                                                                                     
Sbjct 1776  TACCTGGGACAAGTTTTCAGACCCCAGACTTACTGAGCCTAAGCCTCTGCAGGGTGGGCTTCTCGGTCTGTTT  1848