Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07949
- Subject:
- XM_017019144.2
- Aligned Length:
- 1548
- Identities:
- 1433
- Gaps:
- 114
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAGCGTCTTTCTTAAGACTTATCATTTGGAGCACTGGCTCAGGAGTCGAAATCACCAATGGCTCATCCAT 74
Query 1 ----------------------------------------ATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTG 34
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Sbjct 75 CAATCAACCAGAAGTGAAGACGAAAGCTTCAAAGAAGAGAATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTG 148
Query 35 AAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGAGAAAACGTTCTACAGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTC 108
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Sbjct 149 AAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGAGAAAACGTTCTACAGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTC 222
Query 109 CTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGGAAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCAC 182
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Sbjct 223 CTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGGAAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCAC 296
Query 183 ACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGTTCATACTTTCAAGGATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCA 256
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Sbjct 297 ACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGTTCATACTTTCAAGGATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCA 370
Query 257 CCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTTTACAAAGAAAGCGGTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGA 330
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Sbjct 371 CCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTTTACAAAGAAAGCGGTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGA 444
Query 331 AAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACAATTAAGTCAATTTTTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAAT 404
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Sbjct 445 AAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACAATTAAGTCAATTTTTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAAT 518
Query 405 TTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTTTAATTCTTCCTGGCGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAAT 478
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Sbjct 519 TTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTTTAATTCTTCCTGGCGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAAT 592
Query 479 TTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACATGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGC 552
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Sbjct 593 TTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACATGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGC 666
Query 553 CTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAAGATAGAGTCAAATTTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCT 626
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Sbjct 667 CTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAAGATAGAGTCAAATTTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCT 740
Query 627 GCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGACTATTATGTAATGCTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCT 700
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Sbjct 741 GCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGACTATTATGTAATGCTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCT 814
Query 701 TAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCATCCCTAGAAGGAACTTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGC 774
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Sbjct 815 TAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCATCCCTAGAAGGAACTTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGC 888
Query 775 TACATTGGTAAACTCTATCATTCTCATGATCTCCCACGTTTGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAAT 848
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Sbjct 889 TACATTGGTAAACTCTATCATTCTCATGATCTCCCACGTTTGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAAT 962
Query 849 GCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTTCCGTGGTCTGTTGGCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTC 922
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Sbjct 963 GCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTTCCGTGGTCTGTTGGCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTC 1036
Query 923 TCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCATCATACAAAGGGACGGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAG 996
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Sbjct 1037 TCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCATCATACAAAGGGACGGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAG 1110
Query 997 GAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCCCCTGCAAGTCTGTACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGC 1070
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Sbjct 1111 GAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCCCCTGCAAGTCTGTACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGC 1184
Query 1071 AAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTACTTTTGGGGGAAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTG 1144
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Sbjct 1185 AAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTACTTTTGGGGGAAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTG 1258
Query 1145 TATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAAAAATTAAAGTAAATACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTG 1218
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Sbjct 1259 TATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAAAAATTAAAGTAAATACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTG 1332
Query 1219 CATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAACGTTATGCCTAGCAAACAAAGGAGACAATGTTCTAGTTACTTAAG 1292
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Sbjct 1333 CATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAACGTTATGCCTAGCAAACAAAGGAGACAATGTTCTACTTACTTAAG 1406
Query 1293 ACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTTTGAAATGTCAGGTGTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTA 1366
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Sbjct 1407 ACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTTTGAAATGTCAGGTGTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTA 1480
Query 1367 TGAGGATATATGTCACCAAAACACAAAAGGAATGGCTAATTATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT 1434
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Sbjct 1481 TGAGGATATATGTCACCAAAACACAAAAGGAATGGCTAATTATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT 1548