Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07959
- Subject:
- NM_001199809.1
- Aligned Length:
- 2886
- Identities:
- 2738
- Gaps:
- 147
Alignment
Query 1 ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTGC 74
Query 75 CCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCCA 148
Query 149 GACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGTT 222
Query 223 GGAAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACCCAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAA 296
|
Sbjct 223 G------------------------------------------------------------------------- 223
Query 297 TGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCATAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCC 370
Sbjct 224 -------------------------------------------------------------------------- 223
Query 371 GGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGAAGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 GGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGAAGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGAT 297
Query 445 TCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCTGCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 TCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCTGCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGC 371
Query 519 TGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGGTTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 372 TGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGGTTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGA 445
Query 593 TACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGGCTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 TACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGGCTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTC 519
Query 667 ACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTGCACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 ACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTGCACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGT 593
Query 741 TGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTTGAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 TGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTTGAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTG 667
Query 815 CTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCACATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 CTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCACATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGT 741
Query 889 GAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTAGGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 GAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTAGGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGAC 815
Query 963 CATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAATGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 CATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAATGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCA 889
Query 1037 AATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCATTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 AATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCATTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATA 963
Query 1111 ACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAACAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 964 ACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAACAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGT 1037
Query 1185 ACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCACTTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038 ACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCACTTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGG 1111
Query 1259 CCAAGGGCAGGCCCCGTCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGACCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCT 1332
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 CCAAGGGCAGGCCCCATCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGACCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCT 1185
Query 1333 GCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCCATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186 GCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCCATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGG 1259
Query 1407 TGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGCCACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGCCACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGG 1333
Query 1481 CTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTGTGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334 CTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTGTGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAA 1407
Query 1555 AGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGACAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1408 AGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGACAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAA 1481
Query 1629 AGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGAACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 AGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGAACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGT 1555
Query 1703 TTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGGAAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 TTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGGAAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAA 1629
Query 1777 TCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACAGCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 TCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACAGCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCA 1703
Query 1851 GTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGCCTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 GTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGCCTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGA 1777
Query 1925 AGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCATGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1778 AGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCATGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGC 1851
Query 1999 ATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGAAGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 ATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGAAGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGC 1925
Query 2073 ATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGAACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926 ATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGAACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATG 1999
Query 2147 CAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTTTCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2000 CAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTTTCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCT 2073
Query 2221 GATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAATCATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2074 GATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAATCATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAA 2147
Query 2295 ATATACCCCTGTTTCTTATATGCACACAGCATGCCTCTGCAATGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 ATATACCCCTGTTTCTTATATGCACACAGCATGCCTCTGCAATGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTT 2221
Query 2369 CTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCAGCATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAAT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2222 CTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCAGCATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAAT 2295
Query 2443 CCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTGGCGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2296 CCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTGGCGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATC 2369
Query 2517 TAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCTGAATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGAC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2370 TAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCTGAATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGAC 2443
Query 2591 AAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGATGGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2444 AAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGATGGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTC 2517
Query 2665 AGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACACACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2518 AGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACACACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGC 2591
Query 2739 CAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCATATTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2592 CAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCATATTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGC 2665
Query 2813 AAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTACAGCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2666 AAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTACAGCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT 2739