Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07959
• Subject: NR_037667.1
• Aligned Length: 4589
• Identities: 2885
• Gaps: 1703

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  CTTTTCTCCCAGCCGCGGGAACCTGGAGTCCAAGAGCTCCTTGAGCGCCTGCGCAGGGGGTAGCAGAGGCGCGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACAAACCGCGGGGTGACCAGGGCGCATGCGTAACAGGGCTTGACAGCGCGCGGAAGAAAAACCAGCAAGAAGGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGCGGGGGAAGATGGCGGTCCTGGGGTAGAGTTTGCAAGCTTTCTGACTAGGCTAGTCGAGTAACTATTCGGGT  222

Query    1  -ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTG  73
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTG  296

Query   74  CCCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCC  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCC  370

Query  148  AGACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGT  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGT  444

Query  222  TGG----------------------------------AAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACC  261
            |||                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGCATGAGATGCATGTCTGTGAAGTACCTGAAACATAAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACC  518

Query  262  CAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAATGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCA  335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAATGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCA  592

Query  336  TAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCCGGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGA  409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCCGGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGA  666

Query  410  AGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGATTCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCT  483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGATTCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCT  740

Query  484  GCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGCTGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGG  557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGCTGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGG  814

Query  558  TTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGATACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGG  631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGATACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGG  888

Query  632  CTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTCACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTG  705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTCACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTG  962

Query  706  CACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGTTGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTT  779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGTTGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTT  1036

Query  780  GAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTGCTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCAC  853
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTGCTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCAC  1110

Query  854  ATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGTGAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTA  927
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGTGAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTA  1184

Query  928  GGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGACCATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAA  1001
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGACCATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAA  1258

Query 1002  TGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCAAATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCA  1075
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCAAATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCA  1332

Query 1076  TTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATAACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAA  1149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATAACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAA  1406

Query 1150  CAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGTACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCAC  1223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGTACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCAC  1480

Query 1224  TTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGGCCAAGGGCAGGCCCCGTCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGA  1297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGGCCAAGGGCAGGCCCCATCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGA  1554

Query 1298  CCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCTGCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCC  1371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCTGCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCC  1628

Query 1372  ATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGGTGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGC  1445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGGTGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGC  1702

Query 1446  CACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGGCTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTG  1519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGGCTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTG  1776

Query 1520  TGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAAAGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGA  1593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAAAGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGA  1850

Query 1594  CAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAAAGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGA  1667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAAAGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGA  1924

Query 1668  ACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGTTTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGG  1741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGTTTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGG  1998

Query 1742  AAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAATCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACA  1815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAATCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACA  2072

Query 1816  GCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCAGTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGC  1889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCAGTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGC  2146

Query 1890  CTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGAAGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCA  1963
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGAAGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCA  2220

Query 1964  TGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGCATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGA  2037
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGCATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGA  2294

Query 2038  AGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGCATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGA  2111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGCATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGA  2368

Query 2112  ACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATGCAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTT  2185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATGCAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTT  2442

Query 2186  TCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCTGATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAAT  2259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCTGATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAAT  2516

Query 2260  CATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAAATATACCCCTGTTTCTTATATGCACACAGCATGCCTCTG  2333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAAATATACCCCTGTTTCTTATATGCACACAGCATGCCTCTG  2590

Query 2334  CAATGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTTCTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCA  2407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CAATGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTTCTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCA  2664

Query 2408  GCATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAATCCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTG  2481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GCATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAATCCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTG  2738

Query 2482  GCGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATCTAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCT  2555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GCGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATCTAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCT  2812

Query 2556  GAATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGACAAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGA  2629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GAATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGACAAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGA  2886

Query 2630  TGGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTCAGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACA  2703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TGGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTCAGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACA  2960

Query 2704  CACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGCCAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCAT  2777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGCCAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCAT  3034

Query 2778  ATTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGCAAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTAC  2851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ATTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGCAAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTAC  3108

Query 2852  AGCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT---------------------------------------  2886
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct 3109  AGCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTTTAACCATGGAATGAATGCACTGCAGACTCTCAAGAGATC  3182

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3183  AATCAAATTGCCAGAAACAGTTTGGTTTTTCATATGGAATAAGTATTAAAGTTACAGTGTAGTTCATTTATTCA  3256

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3257  TTGATTTTTGTAATGTAATATTCTGGAAAAAATTTTGTTTTCTTAAAAATTTTGTCTGACAGCTGGGCGTGGTT  3330

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3331  GCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGCTCACGAGGAGATCAAGACCATCCTGGCT  3404

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3405  AACACAGTGAAACCCCGTCTCCACTAAAAAATACAAAAAAATTAGCCAAGCATGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCC  3478

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3479  CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGACTGTG  3552

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3553  CTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAATAAATAAATACATTTTGTCTGAAAAATAACTGG  3626

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3627  GATCCTGGCCAGAAAGATTGTTCTTTCTTGTTTTATTATTAGTTTTTTCTGTTGCCAAGCTTTTTTTTCTTTCA  3700

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3701  AGAATAGTCACATGTTGAGATCACTGAATTGGTAAATTTGACCGCTACTCTTCCAAAATACATCATTTGCTGCC  3774

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3775  TGACTTAGACCTAGGATTCTGAGTTGTTCATTGGGAGGTTCTGACCAGTCACTACAAGGTTTATCCATGGTAGC  3848

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3849  AGAACCTGAGTCCTTCTGTAGATGGACTTGAAAGTGTTCCGTGCAACATCCAGCCTTCTGGATTATGAAAGCCC  3922

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3923  ACAGTCTAACAGTATTGAAACATCCTGCTGTATTAGTTCAACCACATATTTATCTCTTCCTGTGCTAAAGCAGT  3996

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 3997  CTTTATTATTTTCATATTTAATTGAAACAAAGAGCAGCTAGCAATTTCATAGAAAATTAATTTGTTTTTTCTGA  4070

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 4071  TGTGTCTGCAACTGTGTATAATACAGACATTTCACATTGTTTCCAAAAGTGAAGAACACTCATTTAATATCTTC  4144

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 4145  AATGTTTTAAGTTAGAAGGGGTGGATCTTTTCCTTTGGTTGGTGATTGGTTTGGTTTATACTTGATGAGTTATG  4218

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 4219  CTAGACTGATTGTTTAGAGAGAGCAGTCTCTTTATTACACAGGCTCAGTTTGTTGGGATGCTCAGGGAACAGAG  4292

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 4293  TTTTCTGGTTAGCCAGAAAACCCCCTTTTTTCCTATTTTAATTCTGGTTGAAAACCATGATAAAATAGACTTTC  4366

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 4367  TTAGCACAGTATGGTAGATATAACTTAACTGCTTTTTGATTGGGGATCATTTAGGGCTTCAGGATCACGATTTC  4440

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 4441  TAAACATCAGGGATCATATGGTTGCAGATGCCGATGCTATAAGTAATTTGGCCGGATGCAGCTCCTAAGGTAAA  4514

Query 2887  --------------------------------------------------------------------------  2886
                                                                                      
Sbjct 4515  GCAGGGTACTTTCCCTGGAATTTCCTTTTTAAATAAATATCTGTTTCTTTGCTTGTGAAAAAAAAAAAAAAAAA  4588

Query 2887  -  2886
             
Sbjct 4589  A  4589