Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08016
• Subject: NM_001114099.3
• Aligned Length: 923
• Identities: 726
• Gaps: 197

Alignment

Query   1  MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQGLPLKEEEILPEPGSETPTVASEALAELLHGALLRRGPEMGYLPGSDP  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct   1  MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQGLPLKEEEILPEPGSETPTVASEALAELLHGALLRRGPEMGYL-----  69

Query  75  DPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGVRGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEG  148
                                                                            |||||||||
Sbjct  70  -----------------------------------------------------------------PGPPLGPEG  78

Query 149  GEEETTTTIITTTTVTTTVTSP----------------------------------------------------  170
           ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct  79  GEEETTTTIITTTTVTTTVTSPVLCNNNISEGEGYVESPDLGSPVSRTLGLLDCTYSIHVYPGYGIEIQVQTLN  152

Query 171  --------------------------------------------------------------AYLLSCGFPPRP  182
                                                                         ||||||||||||
Sbjct 153  LSQEEELLVLAGGGSPGLAPRLLANSSMLGEGQVLRSPTNRLLLHFQSPRVPRGGGFRIHYQAYLLSCGFPPRP  226

Query 183  AHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAV  256
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 227  AHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAV  300

Query 257  GPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSE  330
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301  GPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSE  374

Query 331  TPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWND  404
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375  TPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWND  448

Query 405  TEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV  478
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449  TEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV  522

Query 479  LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGT  552
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523  LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGT  596

Query 553  VLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLE  626
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597  VLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLE  670

Query 627  GAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCV  700
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671  GAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCV  744

Query 701  PGHPSQWTSQPPLCKVAYEELLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSL  774
           |||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745  PGHPSQWTSQPPLCK-------------VTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSL  805

Query 775  FGFSGSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI  809
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806  FGFSGSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI  840