Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08016
• Subject: NM_001114100.3
• Aligned Length: 2427
• Identities: 2426
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT  74

Query   75  CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG  148

Query  149  CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  149  CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCGG  222

Query  223  GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG  296

Query  297  GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA  370

Query  371  CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA  444

Query  445  GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCAGCCTACCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCAGCCTACCT  518

Query  519  CCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCGGCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCGGCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTG  592

Query  593  CCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCAGCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCAGCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCA  666

Query  667  TCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCATGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCATGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCAT  740

Query  741  CGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTAGGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTAGGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGC  814

Query  815  GCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGTCTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGTCTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGC  888

Query  889  AGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATTCGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATTCGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCA  962

Query  963  GTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAGACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAGACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTG  1036

Query 1037  AGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCTGGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCTGGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGG  1110

Query 1111  GCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAGGATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAGGATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGT  1184

Query 1185  GGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGACACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGACACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAAC  1258

Query 1259  CAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTGGCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTGGCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCAC  1332

Query 1333  GTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCCAAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCCAAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTT  1406

Query 1407  CGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTCTTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTCTTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCT  1480

Query 1481  CTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCAGGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCAGGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTA  1554

Query 1555  TTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACGACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACGACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGC  1628

Query 1629  ATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACGGTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACGGTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCG  1702

Query 1703  ACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTCTTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTCTTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCT  1776

Query 1777  GACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACCGCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACCGCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTA  1850

Query 1851  CCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAGGGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAGGGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCA  1924

Query 1925  AGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGCCTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGCCTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGC  1998

Query 1999  TACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACCAGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACCAGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCT  2072

Query 2073  TATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTGCCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTGCCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAG  2146

Query 2147  TTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCGAAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCGAAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAA  2220

Query 2221  GGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGCTGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGCTGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTA  2294

Query 2295  CTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTTTTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTTTTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGT  2368

Query 2369  CGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGCTGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2427
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGCTGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2427