Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08016
- Subject:
- NM_001243333.1
- Aligned Length:
- 2769
- Identities:
- 2294
- Gaps:
- 474
Alignment
Query 1 ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT 74
Query 75 CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG 148
||||
Sbjct 75 CCAG---------------------------------------------------------------------- 78
Query 149 CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCCG 222
||||||||||.|
Sbjct 79 --------------------------------------------------------------GGATCTGATCGG 90
Query 223 GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG 164
Query 297 GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA 238
Query 371 CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA 312
Query 445 GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCA-------- 510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCAGTTCTGTG 386
Query 511 -------------------------------------------------------------------------- 510
Sbjct 387 TAATAACAACATCTCCGAGGGCGAAGGGTATGTGGAGTCTCCAGATCTGGGGAGCCCCGTCAGCCGCACCCTGG 460
Query 511 -------------------------------------------------------------------------- 510
Sbjct 461 GGCTCCTGGACTGCACTTACAGCATCCATGTCTACCCTGGCTACGGCATTGAGATCCAGGTGCAGACGCTGAAC 534
Query 511 -------------------------------------------------------------------------- 510
Sbjct 535 CTGTCACAGGAAGAGGAGCTCCTGGTGCTGGCTGGTGGGGGATCCCCAGGCCTGGCCCCCCGACTCCTGGCCAA 608
Query 511 -------------------------------------------------------------------------- 510
Sbjct 609 CTCATCCATGCTTGGAGAAGGACAAGTCCTTCGGAGCCCAACCAACCGGCTGCTTCTGCACTTCCAGAGCCCAC 682
Query 511 --------------------------------------GCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCG 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683 GGGTCCCAAGGGGCGGTGGCTTCAGGATCCACTATCAGGCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCG 756
Query 547 GCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCA 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 GCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCA 830
Query 621 GCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCA 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 GCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCA 904
Query 695 TGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTA 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 905 TGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTA 978
Query 769 GGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGT 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 GGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGT 1052
Query 843 CTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATT 916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053 CTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATT 1126
Query 917 CGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAG 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127 CGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAG 1200
Query 991 ACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCT 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 ACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCT 1274
Query 1065 GGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAG 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 GGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAG 1348
Query 1139 GATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGAC 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 GATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGAC 1422
Query 1213 ACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTG 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423 ACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTG 1496
Query 1287 GCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497 GCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC 1570
Query 1361 AAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTC 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571 AAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTC 1644
Query 1435 TTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCA 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645 TTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCA 1718
Query 1509 GGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACG 1582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1719 GGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACG 1792
Query 1583 ACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACG 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 ACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACG 1866
Query 1657 GTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTC 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867 GTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTC 1940
Query 1731 TTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACC 1804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941 TTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACC 2014
Query 1805 GCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAG 1878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 GCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAG 2088
Query 1879 GGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGC 1952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 GGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGC 2162
Query 1953 CTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACC 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163 CTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACC 2236
Query 2027 AGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTG 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237 AGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTG 2310
Query 2101 CCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCG 2174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2311 CCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCG 2384
Query 2175 AAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGC 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2385 AAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGC 2458
Query 2249 TGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTT 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 TGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTT 2532
Query 2323 TTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGC 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2533 TTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGC 2606
Query 2397 TGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC 2427
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2607 TGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC 2637