Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08016
Subject:
NM_001243333.1
Aligned Length:
923
Identities:
764
Gaps:
158

Alignment

Query   1  MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQGLPLKEEEILPEPGSETPTVASEALAELLHGALLRRGPEMGYLPGSDP  74
           ||||||||||||||||||||||||||                                            |||.
Sbjct   1  MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQ--------------------------------------------GSDR  30

Query  75  DPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGVRGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  31  DPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGVRGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEG  104

Query 149  GEEETTTTIITTTTVTTTVTSP----------------------------------------------------  170
           ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct 105  GEEETTTTIITTTTVTTTVTSPVLCNNNISEGEGYVESPDLGSPVSRTLGLLDCTYSIHVYPGYGIEIQVQTLN  178

Query 171  --------------------------------------------------------------AYLLSCGFPPRP  182
                                                                         ||||||||||||
Sbjct 179  LSQEEELLVLAGGGSPGLAPRLLANSSMLGEGQVLRSPTNRLLLHFQSPRVPRGGGFRIHYQAYLLSCGFPPRP  252

Query 183  AHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAV  256
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253  AHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAV  326

Query 257  GPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSE  330
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327  GPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSE  400

Query 331  TPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWND  404
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401  TPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWND  474

Query 405  TEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV  478
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475  TEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV  548

Query 479  LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGT  552
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549  LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGT  622

Query 553  VLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLE  626
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623  VLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLE  696

Query 627  GAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCV  700
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697  GAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCV  770

Query 701  PGHPSQWTSQPPLCKVAYEELLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSL  774
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771  PGHPSQWTSQPPLCKVAYEELLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSL  844

Query 775  FGFSGSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI  809
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 845  FGFSGSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI  879