Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08016
• Subject: NM_001252566.1
• Aligned Length: 923
• Identities: 767
• Gaps: 127

Alignment

Query   1  MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQGLPLKEEEILPEPGSETPTVASEALAELLHGALLRRGPEMGYLPGSDP  74
           ||||.||||||.|||.||||||.||.||||||.|..|||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct   1  MGTPKAQHPPPSQLLLLILLSCAWIEGLPLKEDEMMPEPGSETPTVASEDLAELLHGALLRKGPEIGFLPGSDP  74

Query  75  DPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGVRGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEG  148
           ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||.|||
Sbjct  75  DPTLATPPAGQTLAAPSLPRATEPGTGPLTTAVTPKGVRGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPGPASPVPPLRPEG  148

Query 149  GEEETTTTIITTTTVTTTVTSP----------------------------------------------------  170
           ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct 149  GEEETTTTIITTTTVTTTVTSPVLCNNNISEGEGFVESPDLGSTASRSVELLDCTYSIHVYPGYGIEIQVQTLN  222

Query 171  --------------------------------------------------------------AYLLSCGFPPRP  182
                                                                         ||||||||||||
Sbjct 223  LSQEEELLVLAGGGSPGLAPRLLANSSMLGEGQVLRSPTNRLLLHFQSPRVPRGNGFRIHYQAYLLSCGFPPRP  296

Query 183  AHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAV  256
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 297  AHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPAWTGEPPSCTASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAA  370

Query 257  GPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSE  330
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSE  444

Query 331  TPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWND  404
           |||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TPANPLLLSLRFEAFEEDRCFPPFLAHGNVTTTDPEFHPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWND  518

Query 405  TEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV  478
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGLHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV  592

Query 479  LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGT  552
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGT  666

Query 553  VLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLE  626
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  VLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEITNGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLE  740

Query 627  GAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCV  700
           |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  GAAVLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCV  814

Query 701  PGHPSQWTSQPPLCKVAYEELLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSL  774
           |||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 815  PGHPSQWTSQPPLCK-------------VTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGIGVYIYYTKLQGKSL  875

Query 775  FGFSGSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI  809
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876  FGFSGSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI  910