Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08016
• Subject: NM_201575.4
• Aligned Length: 2769
• Identities: 2387
• Gaps: 381

Alignment

Query    1  ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT  74

Query   75  CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG  148

Query  149  CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  149  CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCGG  222

Query  223  GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG  296

Query  297  GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA  370

Query  371  CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA  444

Query  445  GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCA--------  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  445  GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCAGTTCTGTG  518

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  519  TAATAACAACATCTCCGAGGGCGAAGGGTATGTGGAGTCTCCAGATCTGGGGAGCCCCGTCAGCCGCACCCTGG  592

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  593  GGCTCCTGGACTGCACTTACAGCATCCATGTCTACCCTGGCTACGGCATTGAGATCCAGGTGCAGACGCTGAAC  666

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  667  CTGTCACAGGAAGAGGAGCTCCTGGTGCTGGCTGGTGGGGGATCCCCAGGCCTGGCCCCCCGACTCCTGGCCAA  740

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  741  CTCATCCATGCTTGGAGAAGGACAAGTCCTTCGGAGCCCAACCAACCGGCTGCTTCTGCACTTCCAGAGCCCAC  814

Query  511  --------------------------------------GCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCG  546
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGTCCCAAGGGGCGGTGGCTTCAGGATCCACTATCAGGCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCG  888

Query  547  GCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCA  620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCA  962

Query  621  GCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCA  694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCA  1036

Query  695  TGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTA  768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTA  1110

Query  769  GGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGT  842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGT  1184

Query  843  CTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATT  916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATT  1258

Query  917  CGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAG  990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAG  1332

Query  991  ACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCT  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCT  1406

Query 1065  GGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAG  1138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAG  1480

Query 1139  GATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGAC  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGAC  1554

Query 1213  ACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTG  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTG  1628

Query 1287  GCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC  1702

Query 1361  AAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTC  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTC  1776

Query 1435  TTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCA  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCA  1850

Query 1509  GGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACG  1582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACG  1924

Query 1583  ACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACG  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACG  1998

Query 1657  GTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTC  1730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTC  2072

Query 1731  TTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACC  1804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACC  2146

Query 1805  GCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAG  1878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAG  2220

Query 1879  GGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGC  1952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGC  2294

Query 1953  CTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACC  2026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACC  2368

Query 2027  AGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTG  2100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTG  2442

Query 2101  CCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCG  2174
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 2443  CCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCA-------------------------------  2485

Query 2175  AAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGC  2248
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2486  --------AAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGC  2551

Query 2249  TGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTT  2322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2552  TGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTT  2625

Query 2323  TTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGC  2396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2626  TTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGC  2699

Query 2397  TGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2427
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700  TGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2730