Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08064
• Subject: NM_001144027.3
• Aligned Length: 1791
• Identities: 1562
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  ATGCCGAGCCCGCAGCTTCTGGTGCTCTTCGGCAGCCAGACAGGCACGGCTCAGGATGTGTCGGAGAGACTGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGAGCCCGCAGCTTCTGGTGCTCTTCGGCAGCCAGACAGGCACGGCTCAGGATGTGTCGGAGAGACTGGG  74

Query   75  TCGCGAGGCCCGGCGCCGGCGGCTTGGCTGCCGGGTGCAGGCCCTGGACTCCTACCCGGTGGTGAATCTGATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGCGAGGCCCGGCGCCGGCGGCTTGGCTGCCGGGTGCAGGCCCTGGACTCCTACCCGGTGGTGAATCTGATTA  148

Query  149  ACGAGCCCCTGGTGATATTTGTTTGTGCAACTACAGGCCAAGGAGACCCCCCTGACAACATGAAGAACTTCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGAGCCCCTGGTGATATTTGTTTGTGCAACTACAGGCCAAGGAGACCCCCCTGACAACATGAAGAACTTCTGG  222

Query  223  AGGTTTATATTCCGGAAGAACCTGCCCTCCACTGCCCTCTGTCAGATGGACTTTGCCGTCCTGGGCCTCGGGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGTTTATATTCCGGAAGAACCTGCCCTCCACTGCCCTCTGTCAGATGGACTTTGCCGTCCTGGGCCTCGGGGA  296

Query  297  CTCCTCATACGCCAAGTTCAACTTCGTGGCCAAGAAGCTGCACCGACGGCTACTGCAGCTTGGGGGCAGCGCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCCTCATACGCCAAGTTCAACTTCGTGGCCAAGAAGCTGCACCGACGGCTACTGCAGCTTGGGGGCAGCGCCC  370

Query  371  TCCTGCCCGTGTGCCTGGGCGATGACCAGCATGAGCTGGGGCCCGACGCTGCTGTGGACCCCTGGCTGCGAGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  371  TCCTGCCCGTGTGCCTGGGCGATGACCAGCATGAGCTGGG----------------------------------  410

Query  445  TTGTGGGACAGGGTTCTGGGGCTGTACCCGCCGCCTCCGGGCCTCACTGAGATCCCTCCCGGAGTCCCCCTGCC  518
                                                                                ||||||
Sbjct  411  --------------------------------------------------------------------CCTGCC  416

Query  519  CTCCAAGTTCACCCTGCTGTTCCTCCAAGAGGCACCCAGCACGGGCTCTGAGGGGCAGCGGGTAGCTCACCCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CTCCAAGTTCACCCTGCTGTTCCTCCAAGAGGCACCCAGCACGGGCTCTGAGGGGCAGCGGGTAGCTCACCCCG  490

Query  593  GCTCTCAGGAGCCCCCGTCAGAGTCGAAGCCCTTCCTAGCACCCATGATCTCCAACCAGAGAGTCACCGGCCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  GCTCTCAGGAGCCCCCGTCAGAGTCGAAGCCCTTCCTAGCACCCATGATCTCCAACCAGAGAGTCACCGGCCCC  564

Query  667  TCCCACTTCCAGGACGTTCGGCTGATTGAGTTTGACATCTTGGGCTCTGGCATCAGCTTTGCTGCTGGTGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  TCCCACTTCCAGGACGTTCGGCTGATTGAGTTTGACATCTTGGGCTCTGGCATCAGCTTTGCTGCTGGTGATGT  638

Query  741  GGTGCTGATTCAGCCCTCCAACTCGGCTGCCCATGTCCAGCGGTTCTGCCAGGTGCTGGGCCTGGACCCTGACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  GGTGCTGATTCAGCCCTCCAACTCGGCTGCCCATGTCCAGCGGTTCTGCCAGGTGCTGGGCCTGGACCCTGACC  712

Query  815  AGCTCTTCATGCTGCAGCCGCGGGAGCCAGATGTCTCCTCCCCCACGAGGCTGCCCCAGCCCTGCTCCATGCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  AGCTCTTCATGCTGCAGCCGCGGGAGCCAGATGTCTCCTCCCCCACGAGGCTGCCCCAGCCCTGCTCCATGCGG  786

Query  889  CACCTCGTGTCCCACTACCTGGACATCGCCAGCGTGCCTCGCCGCTCCTTCTTCGAACTCCTGGCCTGTCTATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  CACCTCGTGTCCCACTACCTGGACATCGCCAGCGTGCCTCGCCGCTCCTTCTTCGAACTCCTGGCCTGTCTATC  860

Query  963  CCTCCATGAGCTGGAGCGGGAGAAGCTGCTGGAGTTCAGTTCTGCCCAAGGCCAGGAGGAGCTCTTTGAATACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  CCTCCATGAGCTGGAGCGGGAGAAGCTGCTGGAGTTCAGTTCTGCCCAAGGCCAGGAGGAGCTCTTTGAATACT  934

Query 1037  GCAACCGGCCCCGCAGGACCATCCTGGAGGTGCTCTGTGACTTCCCGCACACAGCTGCCGCCATCCCTCCCGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  GCAACCGGCCCCGCAGGACCATCCTGGAGGTGCTCTGTGACTTCCCGCACACAGCTGCCGCCATCCCTCCCGAC  1008

Query 1111  TACCTGTTGGACCTCATCCCCGTTATCCGGCCGAGGGCCTTCTCCATCGCCTCCTCGCTGCTGACTCACCCCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  TACCTGTTGGACCTCATCCCCGTTATCCGGCCGAGGGCCTTCTCCATCGCCTCCTCGCTGCTGACTCACCCCTC  1082

Query 1185  ACGGCTGCAGATCCTCGTGGCTGTAGTGCAGTTCCAGACTCGCCTCAAGGAGCCCCGCCGGGGCCTCTGCTCCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  ACGGCTGCAGATCCTCGTGGCTGTAGTGCAGTTCCAGACTCGCCTCAAGGAGCCCCGCCGGGGCCTCTGCTCCT  1156

Query 1259  CCTGGCTGGCATCCCTGGACCCTGGGCAAGGACCTGTCCGGGTGCCCCTCTGGGTGCGGCCTGGGAGTCTGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  CCTGGCTGGCATCCCTGGACCCTGGGCAAGGACCTGTCCGGGTGCCCCTCTGGGTGCGGCCTGGGAGTCTGGCC  1230

Query 1333  TTCCCAGAGACACCAGACACACCTGTGATCATGGTGGGGCCTGGCACTGGGGTAGCCCCCTTCCGAGCAGCCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  TTCCCAGAGACACCAGACACACCTGTGATCATGGTGGGGCCTGGCACTGGGGTAGCCCCCTTCCGAGCAGCCAT  1304

Query 1407  CCAGGAGCGTGTGGCCCAGGGCCAGACTGGAAACTTCTTGTTTTTTGGCTGCCGCTGGCGGGACCAAGACTTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  CCAGGAGCGTGTGGCCCAGGGCCAGACTGGAAACTTCTTGTTTTTTGGCTGCCGCTGGCGGGACCAAGACTTCT  1378

Query 1481  ACTGGGAGGCTGAGTGGCAGGAGCTGGAGAAGCGGGACTGTCTGACCCTCATCCCTGCCTTCTCCCGGGAACAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379  ACTGGGAGGCTGAGTGGCAGGAGCTGGAGAAGCGGGACTGTCTGACCCTCATCCCTGCCTTCTCCCGGGAACAG  1452

Query 1555  GAGCAGAAAATATATGTGCAGCACCGGCTCCGGGAGCTGGGGTCGCTTGTGTGGGAACTGCTGGACCGCCAGGG  1628
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 1453  GAGCAGAAAGTATATGTGCAGCACCGGCTCCGGGAGCTGGGGTCGCTTGTGTGGGAACTGCTGGACCGC-----  1521

Query 1629  TGCATACTTCTACCTGGCAGGCAACGCCAAGTCCATGCCAGCGGACGTCTCGGAAGCCCTGATGTCCATCTTCC  1702
                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 1522  -----------------CAGGCAACGCCAAGTCCATGCCAGCGGACGTCTCGGAAGCCC---------------  1563

Query 1703  AGGAGGAGGGTGGACTCTGCAGCCCGGACGCAGCCGCGTATCTAGCCAGGCTCCAGCAGACACGGCGCTTCCAG  1776
                                                                                      
Sbjct 1564  --------------------------------------------------------------------------  1563

Query 1777  ACAGAGACGTGGGCC  1791
                           
Sbjct 1564  ---------------  1563