Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08064
• Subject: NM_001144028.3
• Aligned Length: 1791
• Identities: 1769
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGCCGAGCCCGCAGCTTCTGGTGCTCTTCGGCAGCCAGACAGGCACGGCTCAGGATGTGTCGGAGAGACTGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGAGCCCGCAGCTTCTGGTGCTCTTCGGCAGCCAGACAGGCACGGCTCAGGATGTGTCGGAGAGACTGGG  74

Query   75  TCGCGAGGCCCGGCGCCGGCGGCTTGGCTGCCGGGTGCAGGCCCTGGACTCCTACCCGGTGGTGAATCTGATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGCGAGGCCCGGCGCCGGCGGCTTGGCTGCCGGGTGCAGGCCCTGGACTCCTACCCGGTGGTGAATCTGATTA  148

Query  149  ACGAGCCCCTGGTGATATTTGTTTGTGCAACTACAGGCCAAGGAGACCCCCCTGACAACATGAAGAACTTCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGAGCCCCTGGTGATATTTGTTTGTGCAACTACAGGCCAAGGAGACCCCCCTGACAACATGAAGAACTTCTGG  222

Query  223  AGGTTTATATTCCGGAAGAACCTGCCCTCCACTGCCCTCTGTCAGATGGACTTTGCCGTCCTGGGCCTCGGGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGTTTATATTCCGGAAGAACCTGCCCTCCACTGCCCTCTGTCAGATGGACTTTGCCGTCCTGGGCCTCGGGGA  296

Query  297  CTCCTCATACGCCAAGTTCAACTTCGTGGCCAAGAAGCTGCACCGACGGCTACTGCAGCTTGGGGGCAGCGCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCCTCATACGCCAAGTTCAACTTCGTGGCCAAGAAGCTGCACCGACGGCTACTGCAGCTTGGGGGCAGCGCCC  370

Query  371  TCCTGCCCGTGTGCCTGGGCGATGACCAGCATGAGCTGGGGCCCGACGCTGCTGTGGACCCCTGGCTGCGAGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTGCCCGTGTGCCTGGGCGATGACCAGCATGAGCTGGGGCCCGACGCTGCTGTGGACCCCTGGCTGCGAGAC  444

Query  445  TTGTGGGACAGGGTTCTGGGGCTGTACCCGCCGCCTCCGGGCCTCACTGAGATCCCTCCCGGAGTCCCCCTGCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGTGGGACAGGGTTCTGGGGCTGTACCCGCCGCCTCCGGGCCTCACTGAGATCCCTCCCGGAGTCCCCCTGCC  518

Query  519  CTCCAAGTTCACCCTGCTGTTCCTCCAAGAGGCACCCAGCACGGGCTCTGAGGGGCAGCGGGTAGCTCACCCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCCAAGTTCACCCTGCTGTTCCTCCAAGAGGCACCCAGCACGGGCTCTGAGGGGCAGCGGGTAGCTCACCCCG  592

Query  593  GCTCTCAGGAGCCCCCGTCAGAGTCGAAGCCCTTCCTAGCACCCATGATCTCCAACCAGAGAGTCACCGGCCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTCTCAGGAGCCCCCGTCAGAGTCGAAGCCCTTCCTAGCACCCATGATCTCCAACCAGAGAGTCACCGGCCCC  666

Query  667  TCCCACTTCCAGGACGTTCGGCTGATTGAGTTTGACATCTTGGGCTCTGGCATCAGCTTTGCTGCTGGTGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCCACTTCCAGGACGTTCGGCTGATTGAGTTTGACATCTTGGGCTCTGGCATCAGCTTTGCTGCTGGTGATGT  740

Query  741  GGTGCTGATTCAGCCCTCCAACTCGGCTGCCCATGTCCAGCGGTTCTGCCAGGTGCTGGGCCTGGACCCTGACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTGCTGATTCAGCCCTCCAACTCGGCTGCCCATGTCCAGCGGTTCTGCCAGGTGCTGGGCCTGGACCCTGACC  814

Query  815  AGCTCTTCATGCTGCAGCCGCGGGAGCCAGATGTCTCCTCCCCCACGAGGCTGCCCCAGCCCTGCTCCATGCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCTCTTCATGCTGCAGCCGCGGGAGCCAGATGTCTCCTCCCCCACGAGGCTGCCCCAGCCCTGCTCCATGCGG  888

Query  889  CACCTCGTGTCCCACTACCTGGACATCGCCAGCGTGCCTCGCCGCTCCTTCTTCGAACTCCTGGCCTGTCTATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACCTCGTGTCCCACTACCTGGACATCGCCAGCGTGCCTCGCCGCTCCTTCTTCGAACTCCTGGCCTGTCTATC  962

Query  963  CCTCCATGAGCTGGAGCGGGAGAAGCTGCTGGAGTTCAGTTCTGCCCAAGGCCAGGAGGAGCTCTTTGAATACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTCCATGAGCTGGAGCGGGAGAAGCTGCTGGAGTTCAGTTCTGCCCAAGGCCAGGAGGAGCTCTTTGAATACT  1036

Query 1037  GCAACCGGCCCCGCAGGACCATCCTGGAGGTGCTCTGTGACTTCCCGCACACAGCTGCCGCCATCCCTCCCGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAACCGGCCCCGCAGGACCATCCTGGAGGTGCTCTGTGACTTCCCGCACACAGCTGCCGCCATCCCTCCCGAC  1110

Query 1111  TACCTGTTGGACCTCATCCCCGTTATCCGGCCGAGGGCCTTCTCCATCGCCTCCTCGCTGCTGACTCACCCCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 1111  TACCTGTTGGACCTCATCCCCGTTATCCGGCCGAGGGCCTTCTCCATCGCCTCCTCGCTGCT------------  1172

Query 1185  ACGGCTGCAGATCCTCGTGGCTGTAGTGCAGTTCCAGACTCGCCTCAAGGAGCCCCGCCGGGGCCTCTGCTCCT  1258
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  ---------GATCCTCGTGGCTGTAGTGCAGTTCCAGACTCGCCTCAAGGAGCCCCGCCGGGGCCTCTGCTCCT  1237

Query 1259  CCTGGCTGGCATCCCTGGACCCTGGGCAAGGACCTGTCCGGGTGCCCCTCTGGGTGCGGCCTGGGAGTCTGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  CCTGGCTGGCATCCCTGGACCCTGGGCAAGGACCTGTCCGGGTGCCCCTCTGGGTGCGGCCTGGGAGTCTGGCC  1311

Query 1333  TTCCCAGAGACACCAGACACACCTGTGATCATGGTGGGGCCTGGCACTGGGGTAGCCCCCTTCCGAGCAGCCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  TTCCCAGAGACACCAGACACACCTGTGATCATGGTGGGGCCTGGCACTGGGGTAGCCCCCTTCCGAGCAGCCAT  1385

Query 1407  CCAGGAGCGTGTGGCCCAGGGCCAGACTGGAAACTTCTTGTTTTTTGGCTGCCGCTGGCGGGACCAAGACTTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  CCAGGAGCGTGTGGCCCAGGGCCAGACTGGAAACTTCTTGTTTTTTGGCTGCCGCTGGCGGGACCAAGACTTCT  1459

Query 1481  ACTGGGAGGCTGAGTGGCAGGAGCTGGAGAAGCGGGACTGTCTGACCCTCATCCCTGCCTTCTCCCGGGAACAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460  ACTGGGAGGCTGAGTGGCAGGAGCTGGAGAAGCGGGACTGTCTGACCCTCATCCCTGCCTTCTCCCGGGAACAG  1533

Query 1555  GAGCAGAAAATATATGTGCAGCACCGGCTCCGGGAGCTGGGGTCGCTTGTGTGGGAACTGCTGGACCGCCAGGG  1628
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534  GAGCAGAAAGTATATGTGCAGCACCGGCTCCGGGAGCTGGGGTCGCTTGTGTGGGAACTGCTGGACCGCCAGGG  1607

Query 1629  TGCATACTTCTACCTGGCAGGCAACGCCAAGTCCATGCCAGCGGACGTCTCGGAAGCCCTGATGTCCATCTTCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608  TGCATACTTCTACCTGGCAGGCAACGCCAAGTCCATGCCAGCGGACGTCTCGGAAGCCCTGATGTCCATCTTCC  1681

Query 1703  AGGAGGAGGGTGGACTCTGCAGCCCGGACGCAGCCGCGTATCTAGCCAGGCTCCAGCAGACACGGCGCTTCCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682  AGGAGGAGGGTGGACTCTGCAGCCCGGACGCAGCCGCGTATCTAGCCAGGCTCCAGCAGACACGGCGCTTCCAG  1755

Query 1777  ACAGAGACGTGGGCC  1791
            |||||||||||||||
Sbjct 1756  ACAGAGACGTGGGCC  1770