Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08064
• Subject: XM_011518545.1
• Aligned Length: 1818
• Identities: 1688
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGCCGAGCCCGCAGCTTCTGGTGCTCTTCGGCAGCCAGACAGGCACGGCTCAGGATGTGTCGGAGAGACTGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGAGCCCGCAGCTTCTGGTGCTCTTCGGCAGCCAGACAGGCACGGCTCAGGATGTGTCGGAGAGACTGGG  74

Query   75  TCGCGAGGCCCGGCGCCGGCGGCTTGGCTGCCGGGTGCAGGCCCTGGACTCCTACCCGGTGGTGAATCTGATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGCGAGGCCCGGCGCCGGCGGCTTGGCTGCCGGGTGCAGGCCCTGGACTCCTACCCGGTGGTGAATCTGATTA  148

Query  149  ACGAGCCCCTGGTGATATTTGTTTGTGCAACTACAGGCCAAGGAGACCCCCCTGACAACATGAAGAACTTCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGAGCCCCTGGTGATATTTGTTTGTGCAACTACAGGCCAAGGAGACCCCCCTGACAACATGAAGAACTTCTGG  222

Query  223  AGGTTTATATTCCGGAAGAACCTGCCCTCCACTGCCCTCTGTCAGATGGACTTTGCCGTCCTGGGCCTCGGGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGTTTATATTCCGGAAGAACCTGCCCTCCACTGCCCTCTGTCAGATGGACTTTGCCGTCCTGGGCCTCGGGGA  296

Query  297  CTCCTCATACGCCAAGTTCAACTTCGTGGCCAAGAAGCTGCACCGACGGCTACTGCAGCTTGGGGGCAGCGCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCCTCATACGCCAAGTTCAACTTCGTGGCCAAGAAGCTGCACCGACGGCTACTGCAGCTTGGGGGCAGCGCCC  370

Query  371  TCCTGCCCGTGTGCCTGGGCGATGACCAGCATGAGCTGGGGCCCGACGCTGCTGTGGACCCCTGGCTGCGAGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  371  TCCTGCCCGTGTGCCTGGGCGATGACCAGCATGAGCTGGG----------------------------------  410

Query  445  TTGTGGGACAGGGTTCTGGGGCTGTACCCGCCGCCTCCGGGCCTCACTGAGATCCCTCCCGGAGTCCCCCTGCC  518
                                                                                ||||||
Sbjct  411  --------------------------------------------------------------------CCTGCC  416

Query  519  CTCCAAGTTCACCCTGCTGTTCCTCCAAGAGGCACCCAGCACGGGCTCTGAGGGGCAGCGGGTAGCTCACCCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CTCCAAGTTCACCCTGCTGTTCCTCCAAGAGGCACCCAGCACGGGCTCTGAGGGGCAGCGGGTAGCTCACCCCG  490

Query  593  GCTCTCAGGAGCCCCCGTCAGAGTCGAAGCCCTTCCTAGCACCCATGATCTCCAACCAGAGAGTCACCGGCCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  GCTCTCAGGAGCCCCCGTCAGAGTCGAAGCCCTTCCTAGCACCCATGATCTCCAACCAGAGAGTCACCGGCCCC  564

Query  667  TCCCACTTCCAGGACGTTCGGCTGATTGAGTTTGACATCTTGGGCTCTGGCATCAGCTTTGCTGCTGGTGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  TCCCACTTCCAGGACGTTCGGCTGATTGAGTTTGACATCTTGGGCTCTGGCATCAGCTTTGCTGCTGGTGATGT  638

Query  741  GGTGCTGATTCAGCCCTCCAACTCGGCTGCCCATGTCCAGCGGTTCTGCCAGGTGCTGGGCCTGGACCCTGACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  GGTGCTGATTCAGCCCTCCAACTCGGCTGCCCATGTCCAGCGGTTCTGCCAGGTGCTGGGCCTGGACCCTGACC  712

Query  815  AGCTCTTCATGCTGCAGCCGCGGGAGCCAGATGTCTCCTCCCCCACGAGGCTGCCCCAGCCCTGCTCCATGCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  AGCTCTTCATGCTGCAGCCGCGGGAGCCAGATGTCTCCTCCCCCACGAGGCTGCCCCAGCCCTGCTCCATGCGG  786

Query  889  CACCTCGTGTCCCACTACCTGGACATCGCCAGCGTGCCTCGCCGCTCCTTCTTCGAACTCCTGGCCTGTCTATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  CACCTCGTGTCCCACTACCTGGACATCGCCAGCGTGCCTCGCCGCTCCTTCTTCGAACTCCTGGCCTGTCTATC  860

Query  963  CCTCCATGAGCTGGAGCGGGAGAAGCTGCTGGAGTTCAGTTCTGCCCAAGGCCAGGAGGAGCTCTTTGAATACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  CCTCCATGAGCTGGAGCGGGAGAAGCTGCTGGAGTTCAGTTCTGCCCAAGGCCAGGAGGAGCTCTTTGAATACT  934

Query 1037  GCAACCGGCCCCGCAGGACCATCCTGGAGGTGCTCTGTGACTTCCCGCACACAGCTGCCGCCATCCCTCCCGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  GCAACCGGCCCCGCAGGACCATCCTGGAGGTGCTCTGTGACTTCCCGCACACAGCTGCCGCCATCCCTCCCGAC  1008

Query 1111  TACCTGTTGGACCTCATCCCCGTTATCCGGCCGAGGGCCTTCTCCATCGCCTCCTCGCTGCTGACTCACCCCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  TACCTGTTGGACCTCATCCCCGTTATCCGGCCGAGGGCCTTCTCCATCGCCTCCTCGCTGCTGACTCACCCCTC  1082

Query 1185  ACGGCTGCAGATCCTCGTGGCTGTAGTGCAGTTCCAGACTCGCCTCAAGGAGCCCCGCCGGGGCCTCTGCTCCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  ACGGCTGCAGATCCTCGTGGCTGTAGTGCAGTTCCAGACTCGCCTCAAGGAGCCCCGCCGGGGCCTCTGCTCCT  1156

Query 1259  CCTGGCTGGCATCCCTGGACCCTGGGCAAGGACCTGTCCGGGTGCCCCTCTGGGTGCGGCCTGGGAGTCTGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  CCTGGCTGGCATCCCTGGACCCTGGGCAAGGACCTGTCCGGGTGCCCCTCTGGGTGCGGCCTGGGAGTCTGGCC  1230

Query 1333  TTCCCAGAGACACCAGACACACCTGTGATCATGGTGGGGCCTGGCACTGGGGTAGCCCCCTTCCGAGCAGCCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  TTCCCAGAGACACCAGACACACCTGTGATCATGGTGGGGCCTGGCACTGGGGTAGCCCCCTTCCGAGCAGCCAT  1304

Query 1407  CCAGGAGCGTGTGGCCCAGGGCCAGACTGGAAACTTCTTGTTTTTTGGCTGCCGCTGGCGGGACCAAGACTTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  CCAGGAGCGTGTGGCCCAGGGCCAGACTGGAAACTTCTTGTTTTTTGGCTGCCGCTGGCGGGACCAAGACTTCT  1378

Query 1481  ACTGGGAGGCTGAGTGGCAGGAGCTGGAGAAGCGGGACTGTCTGACCCTCATCCCTGCCTTCTCCCGGGA----  1550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 1379  ACTGGGAGGCTGAGTGGCAGGAGCTGGAGAAGCGGGACTGTCTGACCCTCATCCCTGCCTTCTCCCGGGAACAG  1452

Query 1551  -----------------------ACAGGAGCAGAAAATATATGTGCAGCACCGGCTCCGGGAGCTGGGGTCGCT  1601
                                   |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453  CCCCCAGCCCTGTTCTCTGCCCTACAGGAGCAGAAAGTATATGTGCAGCACCGGCTCCGGGAGCTGGGGTCGCT  1526

Query 1602  TGTGTGGGAACTGCTGGACCGCCAGGGTGCATACTTCTACCTGGCAGGCAACGCCAAGTCCATGCCAGCGGACG  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527  TGTGTGGGAACTGCTGGACCGCCAGGGTGCATACTTCTACCTGGCAGGCAACGCCAAGTCCATGCCAGCGGACG  1600

Query 1676  TCTCGGAAGCCCTGATGTCCATCTTCCAGGAGGAGGGTGGACTCTGCAGCCCGGACGCAGCCGCGTATCTAGCC  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601  TCTCGGAAGCCCTGATGTCCATCTTCCAGGAGGAGGGTGGACTCTGCAGCCCGGACGCAGCCGCGTATCTAGCC  1674

Query 1750  AGGCTCCAGCAGACACGGCGCTTCCAGACAGAGACGTGGGCC  1791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675  AGGCTCCAGCAGACACGGCGCTTCCAGACAGAGACGTGGGCC  1716