Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08070
- Subject:
- NM_001164537.2
- Aligned Length:
- 2658
- Identities:
- 2495
- Gaps:
- 162
Alignment
Query 1 ATGCCAGGCGGGGGTCCTCAGGGCGCCCCAGCCGCCGCCGGCGGCGGCGGCGTGAGCCACCGCGCAGGCAGCCG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCAGGCGGGGGTCCTCAGGGCGCCCCAGCCGCCGCCGGCGGCGGCGGCGTGAGCCACCGCGCAGGCAGCCG 74
Query 75 GGATTGCTTACCACCTGCAGCGTGCTTTCGGAGGCGGCGGCTGGCACGGAGGCCGGGCTACATGAGAAGCTCGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGATTGCTTACCACCTGCAGCGTGCTTTCGGAGGCGGCGGCTGGCACGGAGGCCGGGCTACATGAGAAGCTCGA 148
Query 149 CAGGGCCTGGGATCGGGTTCCTTTCCCCAGCAGTGGGCACACTGTTCCGGTTCCCAGGAGGGGTGTCTGGCGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGGGCCTGGGATCGGGTTCCTTTCCCCAGCAGTGGGCACACTGTTCCGGTTCCCAGGAGGGGTGTCTGGCGAG 222
Query 223 GAGTCCCACCACTCGGAGTCCAGGGCCAGACAGTGTGGCCTTGACTCGAGAGGCCTCTTGGTCCGGAGCCCTGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGTCCCACCACTCGGAGTCCAGGGCCAGACAGTGTGGCCTTGACTCGAGAGGCCTCTTGGTCCGGAGCCCTGT 296
Query 297 TTCCAAGAGTGCAGCAGCCCCTACTGTGACCTCTGTGAGAGGAACCTCGGCGCACTTTGGGATTCAGCTCAGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCCAAGAGTGCAGCAGCCCCTACTGTGACCTCTGTGAGAGGAACCTCGGCGCACTTTGGGATTCAGCTCAGAG 370
Query 371 GTGGCACCAGATTGCCTGACAGGCTTAGCTGGCCGTGTGGCCCTGGGAGTGCTGGGTGGCAGCAAGAGTTTGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTGGCACCAGATTGCCTGACAGGCTTAGCTGGCCGTGTGGCCCTGGGAGTGCTGGGTGGCAGCAAGAGTTTGCA 444
Query 445 GCCATGGATAGTTCTGAGACCCTGGACGCCAGCTGGGAGGCAGCCTGCAGCGATGGAGCAAGGCGTGTCCGGGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCATGGATAGTTCTGAGACCCTGGACGCCAGCTGGGAGGCAGCCTGCAGCGATGGAGCAAGGCGTGTCCGGGC 518
Query 519 AGCAGGCTCTCTGCCATCAGCAGAGTTGAGTAGCAACAGCTGCAGCCCTGGCTGTGGCCCTGAGGTCCCCCCAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCAGGCTCTCTGCCATCAGCAGAGTTGAGTAGCAACAGCTGCAGCCCTGGCTGTGGCCCTGAGGTCCCCCCAA 592
Query 593 CCCCTCCTGGCTCTCACAGTGCCTTTACCTCAAGCTTTAGCTTTATTCGGCTCTCGCTTGGCTCTGCCGGGGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCCTCCTGGCTCTCACAGTGCCTTTACCTCAAGCTTTAGCTTTATTCGGCTCTCGCTTGGCTCTGCCGGGGAA 666
Query 667 CGTGGAGAAGCAGAAGGCTGCCCACCATCCAGAGAGGCTGAGTCCCATTGCCAGAGCCCCCAGGAGATGGGAGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGTGGAGAAGCAGAAGGCTGCCCACCATCCAGAGAGGCTGAGTCCCATTGCCAGAGCCCCCAGGAGATGGGAGC 740
Query 741 CAAAGCTGCCAGCTTGGACGGGCCTCACGAGGACCCGCGATGTCTCTCTCAGCCCTTCAGTCTCTTGGCTACAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAAAGCTGCCAGCTTGGACGGGCCTCACGAGGACCCGCGATGTCTCTCTCGGCCCTTCAGTCTCTTGGCTACAC 814
Query 815 GGGTCTCTGCAGACTTGGCCCAGGCCGCAAGGAACAGCTCCAGGCCAGAGCGTGACATGCATTCTTTACCAGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGTCTCTGCAGACTTGGCCCAGGCCGCAAGGAACAGCTCCAGGCCAGAGCGTGACATGCATTCTTTACCAGAC 888
Query 889 ATGGACCCTGGCTCCTCCAGTTCTCTGGATCCCTCACTGGCTGGCTGTGGTGGTGATGGGAGCAGCGGCTCAGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGGACCCTGGCTCCTCCAGTTCTCTGGATCCCTCACTGGCTGGCTGTGGTGGTGATGGGAGCAGCGGCTCAGG 962
Query 963 GGATGCCCACTCTTGGGACACCCTGCTCAGGAAATGGGAGCCAGTGCTGCGGGACTGCCTGCTGAGAAACCGGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGATGCCCACTCTTGGGACACCCTGCTCAGGAAATGGGAGCCAGTGCTGCGGGACTGCCTGCTGAGAAACCGGA 1036
Query 1037 GGCAGATGGAGGTAATATCCTTAAGATTAAAACTTCAGAAACTTCAGGAAGATGCAGTTGAGAATGATGATTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGCAGATGGAGGTAATATCCTTAAGATTAAAACTTCAGAAACTTCAGGAAGATGCAGTTGAGAATGATGATTAT 1110
Query 1111 GATAA--------------------------------------------------------------------- 1115
|||||
Sbjct 1111 GATAAAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGTCAAGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGCAATCCACCTGC 1184
Query 1116 ---------------------------AGCTGAGACGTTACAACAAAGATTAGAAGACCTGGAACAAGAGAAAA 1162
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCTGAGACGTTACAACAAAGATTAGAAGACCTGGAACAAGAGAAAA 1258
Query 1163 TCAGCCTGCACTTTCAACTTCCTTCAAGGCAGCCAGCTCTTAGCAGTTTCCTGGGTCACCTGGCAGCACAAGTC 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCAGCCTGCACTTTCAACTTCCTTCAAGGCAGCCAGCTCTTAGCAGTTTCCTGGGTCACCTGGCAGCACAAGTC 1332
Query 1237 CAGGCTGCCTTGCGCCGTGGGGCCACTCAGCAGGCCAGCGGAGATGACACCCACACCCCACTGAGAATGGAGCC 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGGCTGCCTTGCGCCGTGGGGCCACTCAGCAGGCCAGCGGAGATGACACCCACACCCCACTGAGAATGGAGCC 1406
Query 1311 GAGGCTGTTGGAACCCACTGCTCAGGACAGCTTGCACGTGTCCATCACGAGACGAGACTGGCTTCTTCAGGAAA 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGGCTGTTGGAACCCACTGCTCAGGACAGCTTGCACGTGTCCATCACGAGACGAGACTGGCTTCTTCAGGAAA 1480
Query 1385 AGCAGCAGCTACAGAAAGAAATCGAAGCTCTCCAAGCAAGGATGTTTGTGCTGGAAGCCAAAGATCAACAGCTG 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCAGCAGCTACAGAAAGAAATCGAAGCTCTCCAAGCAAGGATGTTTGTGCTGGAAGCCAAAGATCAACAGCTG 1554
Query 1459 AGAAGGGAAATAGAGGAGCAAGAGCAGCAACTCCAGTGGCAGGGCTGCGACCTGACCCCACTGGTGGGCCAGCT 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGAAGGGAAATAGAGGAGCAAGAGCAGCAACTCCAGTGGCAGGGCTGCGACCTGACCCCACTGGTGGGCCAGCT 1628
Query 1533 GTCCCTGGGTCAGCTGCAGGAGGTCAGCAAGGCCTTGCAGGACACCCTGGCCTCAGCCGGTCAGATTCCCTTCC 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GTCCCTGGGTCAGCTGCAGGAGGTCAGCAAGGCCTTGCAGGACACCCTGGCCTCAGCCGGTCAGATTCCCTTCC 1702
Query 1607 ATGCAGAGCCACCGGAAACCATAAGGAGCCTCCAGGAAAGAATAAAATCCCTCAACTTGTCACTTAAAGAAATC 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATGCAGAGCCACCGGAAACCATAAGGAGCCTCCAGGAAAGAATAAAATCCCTCAACTTGTCACTTAAAGAAATC 1776
Query 1681 ACTACTAAGGTGTGTATGAGTGAGAAATTCTGCAGCACCCTGAGGAAGAAAGTTAACGATATTGAAACCCAACT 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACTACTAAGGTGTGTATGAGTGAGAAATTCTGCAGCACCCTGAGGAAGAAAGTTAACGATATTGAAACCCAACT 1850
Query 1755 ACCAGCCTTGCTTGAAGCCAAAATGCATGCCATATCAGGAAACCATTTCTGGACGGCTAAAGACCTCACCGAGG 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACCAGCCTTGCTTGAAGCCAAAATGCATGCCATATCAGGAAACCATTTCTGGACGGCTAAAGACCTCACCGAGG 1924
Query 1829 AGATTAGATCATTAACATCAGAGAGAGAAGGGCTGGAGGGACTCCTCAGCAAGCTGTTGGTGTTGAGTTCCAGG 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGATTAGATCATTAACATCAGAGAGAGAAGGGCTGGAGGGACTCCTCAGCAAGCTGTTGGTGTTGAGTTCCAGG 1998
Query 1903 AATGTCAAAAAGCTGGGAAGTGTTAAAGAAGATTACAACAGACTGAGAAGAGAAGTGGAGCACCAGGAGACTGC 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AATGTCAAAAAGCTGGGAAGTGTTAAAGAAGATTACAACAGACTGAGAAGAGAAGTGGAGCACCAGGAGACTGC 2072
Query 1977 CTATGAAACAAGTGTGAAGGAAAATACTATGAAGTACATGGAAACACTTAAGAATAAACTGTGCAGCTGCAAGT 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CTATGAAACAAGTGTGAAGGAAAATACTATGAAGTACATGGAAACACTTAAGAATAAACTGTGCAGCTGCAAGT 2146
Query 2051 GTCCACTGCTTGGGAAAGTGTGGGAAGCTGACTTGGAAGCTTGTCGATTGCTTATCCAGAGCCTACAGCTCCAG 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GTCCACTGCTTGGGAAAGTGTGGGAAGCTGACTTGGAAGCTTGTCGATTGCTTATCCAGAGCCTACAGCTCCAG 2220
Query 2125 GAAGCCAGGGGAAGCCTGTCTGTAGAAGATGAGAGGCAGATGGATGACTTAGAGGGAGCTGCTCCTCCTATTCC 2198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAAGCCAGGGGAAGCCTGTCTGTAGAAGATGAGAGGCAGATGGATGACTTAGAGGGAGCTGCTCCTCCTATTCC 2294
Query 2199 CCCCAGGCTCCACTCCGAGGATAAAAGGAAGACCCCTTTGA--------------------------------- 2239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CCCCAGGCTCCACTCCGAGGATAAAAGGAAGACCCCTTTGAAGGTATTGGAAGAATGGAAGACTCACCTCATCC 2368
Query 2240 ---------------------------------AGGAATCTTACATCCTTTCTGCAGAACTTGGAGAAAAGTGT 2280
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCTCTCTGCACTGTGCTGGAGGTGAACAGAAAGAGGAATCTTACATCCTTTCTGCAGAACTTGGAGAAAAGTGT 2442
Query 2281 GAAGACATAGGCAAGAAGCTATTGTACTTGGAAGATCAACTTCACACAGCAATCCACAGTCATGATGAAGATCT 2354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GAAGACATAGGCAAGAAGCTATTGTACTTGGAAGATCAACTTCACACAGCAATCCACAGTCATGATGAAGATCT 2516
Query 2355 CATTCAGTCTCTCAGGAGGGAGCTCCAGATGGTGAAGGAAACTCTGCAGGCCATGATCCTGCAGCTCCAGCCAG 2428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CATTCAGTCTCTCAGGAGGGAGCTCCAGATGGTGAAGGAAACTCTGCAGGCCATGATCCTGCAGCTCCAGCCAG 2590
Query 2429 CAAAGGAGGCGGGAGAAAGAGAAGCTGCAGCTTCCTGCATGACAGCTGGTGTCCACGAAGCACAAGCC 2496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CAAAGGAGGCGGGAGAAAGAGAAGCTGCAGCTTCCTGCATGACAGCTGGTGTCCACGAAGCACAAGCC 2658