Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08129
• Subject: NM_013366.4
• Aligned Length: 2466
• Identities: 2464
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGCAGTTGTGGTGGCGGAGGGGGACAGCGACTCCCGGCCCGGACAGGAGTTGTTAGTGGCCTGGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGCAGTTGTGGTGGCGGAGGGGGACAGCGACTCCCGGCCCGGACAGGAGTTGTTAGTGGCCTGGAA  74

Query   75  CACCGTGAGCACCGGCCTGGTGCCGCCGGCTGCGCTGGGGCTGGTGTCTTCCCGGACCAGCGGTGCAGTCCCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACCGTGAGCACCGGCCTGGTGCCGCCGGCTGCGCTGGGGCTGGTGTCTTCCCGGACCAGCGGTGCAGTCCCGC  148

Query  149  CAAAGGAAGAGGAGCTCCGGGCGGCGGTGGAGGTTCTGAGGGGCCACGGGCTACACTCGGTCCTGGAGGAGTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAAGGAAGAGGAGCTCCGGGCGGCGGTGGAGGTTCTGAGGGGCCACGGGCTACACTCGGTCCTGGAGGAGTGG  222

Query  223  TTCGTGGAGGTGCTGCAGAACGATCTGCAGGCCAACATCTCCCCTGAGTTCTGGAATGCCATCTCCCAATGCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCGTGGAGGTGCTGCAGAACGATCTGCAGGCCAACATCTCCCCTGAGTTCTGGAATGCCATCTCCCAATGCGA  296

Query  297  GAACTCTGCGGATGAGCCCCAGTGCCTTTTGCTACTCCTTGACGCTTTTGGCCTGCTGGAGAGCCGCCTGGATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACTCTGCGGATGAGCCCCAGTGCCTTTTGCTACTCCTTGACGCTTTTGGCCTGCTGGAGAGCCGCCTGGATC  370

Query  371  CCTACCTGCGTAGCCTAGAGCTGCTGGAGAAATGGACTCGCCTGGGCTTGCTGATGGGCACTGGTGCTCAGGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTACCTGCGTAGCCTAGAGCTGCTGGAGAAATGGACTCGCCTGGGCTTGCTGATGGGCACTGGTGCTCAGGGG  444

Query  445  CTGCGAGAAGAAGTCCACACTATGTTGCGCGGAGTCTTGTTCTTTAGCACCCCCAGAACCTTCCAAGAGATGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCGAGAAGAAGTCCACACTATGTTGCGCGGAGTCTTGTTCTTTAGCACCCCCAGAACCTTCCAAGAGATGAT  518

Query  519  CCAGCGTCTGTATGGGTGCTTCTTGAGAGTCTATATGCAGAGTAAGAGGAAGGGGGAAGGGGGCACAGACCCGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGCGTCTGTATGGGTGCTTCTTGAGAGTCTATATGCAGAGTAAGAGGAAGGGGGAAGGGGGCACAGACCCGG  592

Query  593  AACTGGAAGGGGAGCTGGACAGCCGGTATGCCCGTCGCCGGTACTACCGGCTCCTGCAGAGCCCGCTGTGTGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACTGGAAGGGGAGCTGGACAGCCGGTATGCCCGTCGCCGGTACTACCGGCTCCTGCAGAGCCCGCTGTGTGCA  666

Query  667  GGGTGCAGCAGTGACAAGCAACAGTGCTGGTGTCGCCAGGCTCTGGAGCAGTTCCATCAGCTCAGCCAGGTCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGTGCAGCAGTGACAAGCAACAGTGCTGGTGTCGCCAGGCTCTGGAGCAGTTCCATCAGCTCAGCCAGGTCTT  740

Query  741  ACACAGGCTCAGTCTGCTGGAGCGGGTCAGTGCCGAGGCTGTGACCACCACCCCGCACCAGGTGACCCGGGAGA  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACACAGGCTCAGTCTGCTGGAGCGGGTCAGTGCCGAGGCTGTGACCACCACCCTGCACCAGGTGACCCGGGAGA  814

Query  815  GGATGGAGGACCGTTGCCGGGGCGAGTACGAGCGCTCCTTCCTGCGTGAGTTCCACAAGTGGATCGAGCGGGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGATGGAGGACCGTTGCCGGGGCGAGTACGAGCGCTCCTTCCTGCGTGAGTTCCACAAGTGGATCGAGCGGGTG  888

Query  889  GTCGGCTGGCTCGGCAAGGTGTTCCTGCAGGACGGCCCCGCCAGGCCCGCATCTCCCGAGGCCGGCAACACCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCGGCTGGCTCGGCAAGGTGTTCCTGCAGGACGGCCCCGCCAGGCCCGCATCTCCCGAGGCCGGCAACACCCT  962

Query  963  GCGCCGCTGGCGCTGCCACGTGCAAAGGTTCTTCTACCGCATCTACGCCAGCCTGCGCATCGAGGAGCTCTTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGCCGCTGGCGCTGCCACGTGCAAAGGTTCTTCTACCGCATCTACGCCAGCCTGCGCATCGAGGAGCTCTTCA  1036

Query 1037  GCATCGTCCGAGACTTCCCAGACTCCCGGCCAGCCATCGAGGACCTCAAGTACTGCCTGGAGAGGACGGACCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCATCGTCCGAGACTTCCCAGACTCCCGGCCAGCCATCGAGGACCTCAAGTACTGCCTGGAGAGGACGGACCAG  1110

Query 1111  AGGCAGCAGCTGCTCGTGTCCCTCAAGGCTGCCCTGGAGACTCGGCTCCTGCATCCAGGCGTCAACACGTGTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGCAGCAGCTGCTCGTGTCCCTCAAGGCTGCCCTGGAGACTCGGCTCCTGCATCCAGGCGTCAACACGTGTGA  1184

Query 1185  CATCATCACCCTCTATATCTCTGCCATCAAGGCGCTGCGCGTGCTGGACCCTTCCATGGTCATCCTGGAGGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCATCACCCTCTATATCTCTGCCATCAAGGCGCTGCGCGTGCTGGACCCTTCCATGGTCATCCTGGAGGTGG  1258

Query 1259  CCTGTGAGCCTATCCGCCGCTACCTGAGGACGCGGGAGGACACAGTGCGGCAGATTGTGGCTGGGCTGACGGGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTGTGAGCCTATCCGCCGCTACCTGAGGACGCGGGAGGACACAGTGCGGCAGATTGTGGCTGGGCTGACGGGG  1332

Query 1333  GACTCGGACGGGACAGGGGACCTGGCTGTTGAGCTGTCCAAGACCGACCCGGCGAGCCTGGAGACAGGCCAGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACTCGGACGGGACAGGGGACCTGGCTGTTGAGCTGTCCAAGACCGACCCGGCGAGCCTGGAGACAGGCCAGGA  1406

Query 1407  CAGTGAGGATGACTCAGGCGAGCCAGAGGACTGGGTCCCGGACCCTGTGGATGCCGATCCAGGGAAGTCGAGCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGTGAGGATGACTCAGGCGAGCCAGAGGACTGGGTCCCGGACCCTGTGGATGCCGATCCAGGGAAGTCGAGCT  1480

Query 1481  CCAAGCGGCGTTCATCGGACATCATCAGCCTGCTGGTCAGCATCTACGGCAGCAAGGACCTCTTCATCAATGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAAGCGGCGTTCATCGGACATCATCAGCCTGCTGGTCAGCATCTACGGCAGCAAGGACCTCTTCATCAATGAG  1554

Query 1555  TACCGCTCGCTGCTGGCCGACCGCCTGCTGCACCAGTTCAGCTTCAGCCCCGAGCGGGAGATCCGCAACGTGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TACCGCTCGCTGCTGGCCGACCGCCTGCTGCACCAGTTCAGCTTCAGCCCCGAGCGGGAGATCCGCAACGTGGA  1628

Query 1629  GCTGCTGAAGCTGCGCTTTGGCGAGGCCCCAATGCACTTCTGTGAAGTCATGCTGAAGGACATGGCGGACTCCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTGCTGAAGCTGCGCTTTGGCGAGGCCCCAATGCACTTCTGTGAAGTCATGCTGAAGGACATGGCGGACTCCC  1702

Query 1703  GCCGCATCAATGCCAACATCCGGGAGGAGGATGAGAAGCGGCCAGCAGAGGAGCAGCCACCGTTCGGGGTCTAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCCGCATCAATGCCAACATCCGGGAGGAGGATGAGAAGCGGCCAGCAGAGGAGCAGCCACCGTTCGGGGTCTAC  1776

Query 1777  GCTGTCATCCTGTCCAGTGAGTTCTGGCCGCCCTTCAAGGACGAGAAGCTGGAGGTCCCCGAGGATATCAGGGC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCTGTCATCCTGTCCAGTGAGTTCTGGCCGCCCTTCAAGGACGAGAAGCTGGAGGTCCCCGAGGATATCAGGGC  1850

Query 1851  AGCCCTGGAGGCTTACTGCAAGAAGTATGAGCAGCTCAAGGCCATGCGGACCCTCAGTTGGAAGCACACCCTGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGCCCTGGAGGCTTACTGCAAGAAGTATGAGCAGCTCAAGGCCATGCGGACCCTCAGTTGGAAGCACACCCTGG  1924

Query 1925  GCCTGGTGACCATGGACGTGGAGCTGGCCGACCGCACGCTGTCTGTGGCGGTCACCCCAGTACAGGCGGTGATC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCCTGGTGACCATGGACGTGGAGCTGGCCGACCGCACGCTGTCTGTGGCGGTCACCCCAGTACAGGCGGTGATC  1998

Query 1999  TTGCTGTATTTTCAGGACCAAGCCAGCTGGACCCTGGAGGAACTGAGCAAGGCGGTGAAGATGCCCGTGGCGCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTGCTGTATTTTCAGGACCAAGCCAGCTGGACCCTGGAGGAACTGAGCAAGGCGGTGAAGATGCCCGTGGCGCT  2072

Query 2073  GCTGCGGCGGCGGATGTCCGTGTGGCTGCAGCAGGGTGTGCTGCGTGAGGAGCCCCCCGGCACCTTCTCTGTCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCTGCGGCGGCGGATGTCCGTGTGGCTGCAGCAGGGTGTGCTGCGTGAGGAGCCCCCCGGCACCTTCTCTGTCA  2146

Query 2147  TTGAGGAGGAGCGGCCTCAGGACCGGGACAACATGGTGCTCATTGACAGTGACGACGAGAGCGACTCCGGCATG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTGAGGAGGAGCGGCCTCAGGACCGGGACAACATGGTGCTCATTGACAGTGACGACGAGAGCGACTCCGGCATG  2220

Query 2221  GCCTCCCAGGCCGACCAGAAGGAGGAGGAGCTGCTGCTCTTCTGGACGTACATCCAGGCCATGCTGACCAACCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GCCTCCCAGGCCGACCAGAAGGAGGAGGAGCTGCTGCTCTTCTGGACGTACATCCAGGCCATGCTGACCAACCT  2294

Query 2295  GGAGAGCCTCTCACTGGATCGTATCTACAACATGCTCCGCATGTTTGTGGTGACTGGGCCTGCACTGGCCGAGA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGAGAGCCTCTCACTGGATCGTATCTACAACATGCTCCGCATGTTTGTGGTGACTGGGCCTGCACTGGCCGAGA  2368

Query 2369  TTGACCTGCAGGAGCTGCAGGGCTACCTGCAGAAGAAGGTGCGGGACCAGCAGCTCGTCTACTCGGCCGGCGTC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTGACCTGCAGGAGCTGCAGGGCTACCTGCAGAAGAAGGTGCGGGACCAGCAGCTCGTCTACTCGGCCGGCGTC  2442

Query 2443  TACCGCCTGCCCACGAACTGCAGC  2466
            |||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2443  TACCGCCTGCCCAAGAACTGCAGC  2466