Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08137
• Subject: NM_001100176.2
• Aligned Length: 2151
• Identities: 2150
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGCGTGGACAAAGCTGAGCTATGCGGGTCTCTGCTCACCTGGTTACAGACGTTCCACGTTCCGTCTCCCTG  74
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Sbjct    1  ATGAGCGTGGACAAAGCTGAGCTATGCGGGTCTCTGCTCACCTGGTTACAGACGTTCCACGTTCCGTCTCCCTG  74

Query   75  TGCCAGCCCTCAGGACCTGAGCAGCGGCCTTGCCGTAGCCTATGTGCTGAACCAGATAGACCCCTCCTGGTTCA  148
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Sbjct   75  TGCCAGCCCTCAGGACCTGAGCAGCGGCCTTGCCGTAGCCTATGTGCTGAACCAGATAGACCCCTCCTGGTTCA  148

Query  149  ACGAGGCATGGCTCCAGGGCATCTCGGAAGATCCAGGTCCCAACTGGAAGCTGAAGGTCAGCAATCTGAAGATG  222
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Sbjct  149  ACGAGGCATGGCTCCAGGGCATCTCGGAAGATCCAGGTCCCAACTGGAAGCTGAAGGTCAGCAATCTGAAGATG  222

Query  223  GTCTTACGGAGCCTAGTAGAGTACTCCCAGGATGTCCTGGCGCATCCTGTGTCAGAAGAGCATCTCCCAGATGT  296
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Sbjct  223  GTCTTACGGAGCCTAGTAGAGTACTCCCAGGATGTCCTGGCGCATCCTGTGTCAGAAGAGCATCTCCCAGATGT  296

Query  297  GAGCCTCATTGGAGAGTTCTCAGACCCGGCAGAGCTCGGCAAGCTGCTTCAGCTGGTGCTGGGCTGTGCCATCA  370
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Sbjct  297  GAGCCTCATTGGAGAGTTCTCAGACCCGGCAGAGCTCGGCAAGCTGCTTCAGCTGGTGCTGGGCTGTGCCATCA  370

Query  371  GTTGCGAGAAAAAGCAGGACCACATCCAGAGAATCATGACGCTGGAAGAATCGGTTCAGCATGTGGTGATGGAA  444
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Sbjct  371  GTTGCGAGAAAAAGCAGGACCACATCCAGAGAATCATGACGCTGGAAGAATCGGTTCAGCATGTGGTGATGGAA  444

Query  445  GCCATCCAAGAGCTCATGACCAAAGACACTCCTGACTCCCTGTCACCAGAGACGTATGGCAACTTTGACAGCCA  518
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Sbjct  445  GCCATCCAAGAGCTCATGACCAAAGACACTCCTGACTCCCTGTCACCAGAGACGTATGGCAACTTTGACAGCCA  518

Query  519  GTCCCGCAGGTACTATTTCCTAAGTGAGGAGGCTGAGGAGGGGGACGAATTACAGCAGCGCTGTCTGGATCTGG  592
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Sbjct  519  GTCCCGCAGGTACTATTTCCTAAGTGAGGAGGCTGAGGAGGGGGACGAATTACAGCAGCGCTGTCTGGATCTGG  592

Query  593  AGCGGCAGCTGATGCTCCTGTCAGAGGAGAAGCAGAGCCTGGCGCAAGAGAATGCAGGGCTGCGGGAGCGGATG  666
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Sbjct  593  AGCGGCAGCTGATGCTCCTGTCAGAGGAGAAGCAGAGCCTGGCGCAAGAGAATGCAGGGCTGCGGGAGCGGATG  666

Query  667  GGCCGGCCTGAAGGCGAGGGTACCCCAGGTCTCACTGCCAAGAAGCTGCTGCTGCTGCAATCCCAGCTGGAGCA  740
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Sbjct  667  GGCCGGCCTGAAGGCGAGGGTACCCCAGGTCTCACTGCCAAGAAGCTGCTGCTGCTGCAATCCCAGCTGGAGCA  740

Query  741  GTTGCAGGAGGAGAACTTCAGGCTGGAGAGTGGCAGGGAGGATGAGCGCCTGCGCTGTGCCGAGCTGGAGAGGG  814
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Sbjct  741  GTTGCAGGAGGAGAACTTCAGGCTGGAGAGTGGCAGGGAGGATGAGCGCCTGCGCTGTGCCGAGCTGGAGAGGG  814

Query  815  AGGTTGCGGAGCTGCAGCACCGGAACCAGGCGCTGACTAGCCTGGCCCAGGAGGCACAGGCCCTGAAGGATGAG  888
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Sbjct  815  AGGTTGCGGAGCTGCAGCACCGGAACCAGGCGCTGACTAGCCTGGCCCAGGAGGCACAGGCCCTGAAGGATGAG  888

Query  889  ATGGATGAACTACGGCAGTCTTCGGAGCGTGCTGGGCAGCTGGAGGCCACGCTGACCAGTTGCCGGCGCCGCTT  962
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Sbjct  889  ATGGATGAACTACGGCAGTCTTCGGAGCGTGCTGGGCAGCTGGAGGCCACGCTGACCAGTTGCCGGCGCCGCTT  962

Query  963  GGGCGAGCTGAGGGAGCTGCGGCGGCAGGTGCGGCAGCTGGAGGAACGCAACGCCGGCCACGCCGAGCGCACGC  1036
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Sbjct  963  GGGCGAGCTGAGGGAGCTGCGGCGGCAGGTGCGGCAGCTGGAGGAACGCAACGCCGGCCACGCCGAGCGCACGC  1036

Query 1037  GACAACTGGAGGATGAGCTACGCCGAGCGGGCTCCCTGCGCGCCCAGCTGGAGGCGCAGCGGCGGCAGGTGCAG  1110
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Sbjct 1037  GACAACTGGAGGATGAGCTACGCCGAGCGGGCTCCCTGCGCGCCCAGCTGGAGGCGCAGCGGCGGCAGGTGCAG  1110

Query 1111  GAACTGCAGGGCCAGCGGCAGGAGGAGGCCATGAAGGCCGAGAAATGGCTATTTGAATGCCGCAACCTGGAGGA  1184
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Sbjct 1111  GAACTGCAGGGCCAGCGGCAGGAGGAGGCCATGAAGGCCGAGAAATGGCTATTTGAATGCCGCAACCTGGAGGA  1184

Query 1185  AAAGTATGAGTCGGTGACAAAGGAGAAGGAGCGGCTGTTGGCGGAGCGGGACTCCTTGCGGGAGGCCAATGAGG  1258
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Sbjct 1185  AAAGTATGAGTCGGTGACAAAGGAGAAGGAGCGGCTGTTGGCGGAGCGGGACTCCTTGCGGGAGGCCAATGAGG  1258

Query 1259  AGCTGCGCTGCGCCCAGCTGCAGCCGCGGGGGTTGACCCAGGCCGATCCCTCACTGGATCCCACCTCCACACCC  1332
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Sbjct 1259  AGCTGCGCTGCGCCCAGCTGCAGCCGCGGGGGTTGACCCAGGCCGATCCCTCACTGGATCCCACCTCCACACCC  1332

Query 1333  GTGGATAACTTAGCCGCAGAGATCCTGCCTGCGGAGCTCAGGGAGACGCTCCTGCGGCTTCAGCTGGAGAACAA  1406
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Sbjct 1333  GTGGATAACTTAGCCGCAGAGATCCTGCCTGCGGAGCTCAGGGAGACGCTCCTGCGGCTTCAGCTGGAGAACAA  1406

Query 1407  GCGGCTGTGCAGGCAGGAGGCGGCCGACCGGGAGCGGCAGGAGGAGCTGCAGCGCCAGCTGGAGGATGCCAACC  1480
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Sbjct 1407  GCGGCTGTGCAGGCAGGAGGCGGCCGACCGGGAGCGGCAGGAGGAGCTGCAGCGCCACCTGGAGGATGCCAACC  1480

Query 1481  GCGCGCGCCACGGGTTGGAGACGCAGCACCGGCTGAACCAGCAGCAGCTATCCGAGCTGCGGGCCCAGGTGGAG  1554
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Sbjct 1481  GCGCGCGCCACGGGTTGGAGACGCAGCACCGGCTGAACCAGCAGCAGCTATCCGAGCTGCGGGCCCAGGTGGAG  1554

Query 1555  GACCTGCAGAAAGCCCTGCAGGAGCAGGGGGGCAAGACTGAAGATTCCATTTTGCTGAAAAGGAAGCTGGAGGA  1628
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Sbjct 1555  GACCTGCAGAAAGCCCTGCAGGAGCAGGGGGGCAAGACTGAAGATTCCATTTTGCTGAAAAGGAAGCTGGAGGA  1628

Query 1629  ACATTTGCAGAAGCTTCATGAGGCAGATCTGGAGTTGCAGAGGAAGCGGGAGTACATTGAGGAGCTGGAGCCAC  1702
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Sbjct 1629  ACATTTGCAGAAGCTTCATGAGGCAGATCTGGAGTTGCAGAGGAAGCGGGAGTACATTGAGGAGCTGGAGCCAC  1702

Query 1703  CCACTGACAGCAGCACAGCCCGGCGGATCGAGGAGCTGCAGCATAACTTGCAGAAGAAGGACGCGGACTTGCGG  1776
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Sbjct 1703  CCACTGACAGCAGCACAGCCCGGCGGATCGAGGAGCTGCAGCATAACTTGCAGAAGAAGGACGCGGACTTGCGG  1776

Query 1777  GCCATGGAGGAGCGATACCGCCGCTACGTGGACAAGGCCCGCATGGTCATGCAGACCATGGAACCCAAGCAGCG  1850
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Sbjct 1777  GCCATGGAGGAGCGATACCGCCGCTACGTGGACAAGGCCCGCATGGTCATGCAGACCATGGAACCCAAGCAGCG  1850

Query 1851  GCCAGCTGCGGGGGCACCTCCAGAACTCCATTCCCTGAGGACACAGCTCCGAGAACGGGATGTCCGCATCCGAC  1924
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Sbjct 1851  GCCAGCTGCGGGGGCACCTCCAGAACTCCATTCCCTGAGGACACAGCTCCGAGAACGGGATGTCCGCATCCGAC  1924

Query 1925  ACCTGGAGATGGACTTTGAGAAAAGCCGAAGTCAGCGGGAGCAGGAAGAAAAGCTGCTCATCAGTGCCTGGTAT  1998
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Sbjct 1925  ACCTGGAGATGGACTTTGAGAAAAGCCGAAGTCAGCGGGAGCAGGAAGAAAAGCTGCTCATCAGTGCCTGGTAT  1998

Query 1999  AATATGGGCATGGCCTTGCAGCAGCGAGCTGGGGAGGAGCGGGCGCCTGCCCATGCCCAGTCATTCCTGGCACA  2072
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Sbjct 1999  AATATGGGCATGGCCTTGCAGCAGCGAGCTGGGGAGGAGCGGGCGCCTGCCCATGCCCAGTCATTCCTGGCACA  2072

Query 2073  GCAGCGGCTGGCAACCAATTCTCGCCGTGGACCCTTGGGACGCCTGGCATCTCTGAACCTTCGCCCCACTGACA  2146
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Sbjct 2073  GCAGCGGCTGGCAACCAATTCTCGCCGTGGACCCTTGGGACGCCTGGCATCTCTGAACCTTCGCCCCACTGACA  2146

Query 2147  AGCAC  2151
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Sbjct 2147  AGCAC  2151