Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08177
• Subject: NM_021439.2
• Aligned Length: 1056
• Identities: 960
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAAGCCAGCGCTGCTGGAAGTGATGAGGATGAACAGAATCTGCCGGATGGTGCTGGCCACTTGCTTGGGATC  74
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGAAGCCGGCGCTGCTGGAAGTGATGAGGATGAACAGAATTTGCCGGATGGTGCTGGCCACTTGCTTCGGATC  74

Query   75  CTTTATCCTGGTCATCTTCTATTTCCAAAGTATGTTGCACCCAGTCATGCGGAGGAATCCCTTTGGTGTGGACA  148
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  CTTTATCTTGGTCATCTTCTATTTCCAAAGTATGTTGCACCCAGTCATGCGGAGGAACCCCTTCGGTGTGGACA  148

Query  149  TCTGCTGCCGGAAGGGGTCCCGAAGCCCCCTGCAGGAACTCTACAACCCAATCCAGCTGGAGCTCTCAAACACT  222
            ||||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  149  TCTGCTGCCGGAAGGGATCGAGAAGTCCCCTGCAGGAGCTCTACAATCCCATCCAGCTGGAGCTATCCAACACT  222

Query  223  GCTGTCCTGCACCAGATGCGGCGGGACCAGGTGACAGACACGTGCCGAGCCAACAGCGCCACAAGCCGTAAGCG  296
            ||..||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||..|||||.|||||
Sbjct  223  GCCATCCTGCACCAGATGAGACGGGACCAGGTGACAGACACCTGCCGGGCCAACAGTGCCATGAGCCGCAAGCG  296

Query  297  GAGGGTGCTGACCCCCAACGACCTGAAGCACTTGGTGGTGGATGAGGACCACGAGCTCATCTACTGCTACGTGC  370
            .||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  297  CAGGGTGCTGACCCCCAACGACCTGAAGCACCTGGTGGTGGATGAGGACCACGAACTCATCTACTGCTATGTGC  370

Query  371  CCAAGGTGGCCTGCACCAACTGGAAGCGGCTCATGATGGTCCTGACCGGGCGGGGGAAGTACAGCGACCCCATG  444
            |||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||..||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  CCAAGGTAGCGTGCACCAACTGGAAGAGGCTCATGATGGTCCTGAGTGGCCGGGGCAAGTACAGCGATCCCATG  444

Query  445  GAGATCCCGGCCAACGAGGCACACGTCTCCGCCAACCTGAAGACCCTGAACCAGTACAGCATCCCAGAAATCAA  518
            ||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  GAGATCCCAGCCAACGAAGCCCACGTGTCGGCCAACCTGAAGACCCTTAACCAGTACAGCATCCCAGAGATCAA  518

Query  519  CCACCGCTTGAAAAGCTACATGAAGTTCCTGTTTGTCCGGGAGCCCTTCGAGAGGCTAGTGTCCGCCTACCGCA  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  519  CCACCGCTTGAAAAGCTACATGAAGTTCCTGTTCGTGCGGGAACCCTTCGAGAGGCTGGTGTCTGCCTACCGCA  592

Query  593  ACAAGTTCACCCAGAAGTACAACATCTCCTTCCACAAGCGGTACGGCACCAAGATCATCAAACGCCAGCGGAAG  666
            ||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct  593  ACAAGTTCACGCAGAAGTACAACACCTCCTTCCACAAGCGCTACGGCACCAAGATCATCCGACGCCAGCGGAAG  666

Query  667  AACGCCACCCAGGAGGCCCTGCGCAAAGGGGACGATGTCAAATTCGAGGAGTTTGTGGCCTATCTCATCGACCC  740
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  AACGCCACGCAGGAGGCCCTGCGCAAGGGGGACGATGTCAAGTTCGAGGAGTTCGTGGCCTACCTCATCGACCC  740

Query  741  ACACACCCAGCGGGAGGAGCCTTTCAACGAACACTGGCAAACCGTCTACTCACTCTGCCATCCCTGCCACATCC  814
            .||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  741  CCACACCCAGCGGGAGGAGCCCTTCAACGAGCACTGGCAGACGGTCTACTCTCTCTGCCACCCGTGCCACATCC  814

Query  815  ACTATGACCTCGTGGGCAAGTACGAGACACTGGAAGAGGATTCTAATTACGTCCTGCAGCTGGCAGGAGTGGGC  888
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||.||
Sbjct  815  ACTACGACCTCGTGGGCAAGTATGAGACACTGGAGGAGGACTCCAATTACGTACTGCAGCTGGCCGGAGTGAGC  888

Query  889  AGCTACCTGAAGTTCCCCACCTATGCAAAGTCTACGAGAACTACTGATGAAATGACCACAGAATTCTTCCAGAA  962
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  889  GGCTACCTGAAGTTCCCCACCTATGCAAAGTCCACCCGAACTACCGACGAGATGACCACGGAGTTCTTCCAGAA  962

Query  963  CATCAGCTCAGAGCACCAAACGCAGCTGTACGAAGTCTACAAACTCGATTTTTTAATGTTCAATTACTCAGTGC  1036
            |||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  CATCAGCGCCGAGCACCAGACACAGCTGTACGAAGTCTACAAACTGGACTTTTTAATGTTCAACTACTCAGTGC  1036

Query 1037  CNAGCTACCTGAAATTNGAA  1056
            |.|.|||||||||.||.||.
Sbjct 1037  CAAACTACCTGAAGTTGGAT  1056