Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08183
Subject:
XM_017029564.1
Aligned Length:
1167
Identities:
1118
Gaps:
48

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------ATGGAACCAGCAGTTAGCGAGCCAAT  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAAAAGAAAAGTTGATTACAAACGGGACCATATTTTGCTTCGAAATGGAACCAGCAGTTAGCGAGCCAAT  74

Query   27  GAGAGACCAAGTCGCACGGACTCATTTGACAGAGGACACTCCCAAAGTGAATGCTGACATAGAAAAGGTTAACC  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGAGACCAAGTCGCACGGACTCATTTGACAGAGGACACTCCCAAAGTGAATGCTGACATAGAAAAGGTTAACC  148

Query  101  AGAATCAGGCCAAGAGATGCACAGTGATCGGGGGCTCTGGATTCCTGGGGCAGCACATGGTGGAGCAGTTGCTG  174
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAATCAGGCCAAGAGATGCACAGTGATCGGTGGCTCTGGATTCCTGGGGCAGCACATGGTGGAGCAGTTGCTG  222

Query  175  GCAAGAGGATATGCTGTCAATGTATTTGATATCCAGCAAGGGTTTGATAATCCCCAGGTGCGGTTCTTTCTGGG  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAAGAGGATATGCTGTCAATGTATTTGATATCCAGCAAGGGTTTGATAATCCCCAGGTGCGGTTCTTTCTGGG  296

Query  249  TGACCTCTGCAGCCGACAGGATCTGTACCCAGCTCTGAAAGGTGTAAACACAGTTTTCCACTGTGCGTCACCCC  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCTCTGCAGCCGACAGGATCTGTACCCAGCTCTGAAAGGTGTAAACACAGTTTTCCACTGTGCGTCACCCC  370

Query  323  CACCATCCAGTAACAACAAGGAGCTCTTTTATAGAGTGAATTACATTGGCACCAAGAATGTCATTGAAACTTGC  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACCATCCAGTAACAACAAGGAGCTCTTTTATAGAGTGAATTACATTGGCACCAAGAATGTCATTGAAACTTGC  444

Query  397  AAAGAGGCTGGGGTTCAGAAACTCATTTTAACCAGCAGTGCCAGTGTCATCTTTGAGGGCGTCGATATCAAGAA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGAGGCTGGGGTTCAGAAACTCATTTTAACCAGCAGTGCCAGTGTCATCTTTGAGGGCGTCGATATCAAGAA  518

Query  471  TGGAACTGAAGACCTTCCCTATGCCATGAAACCCATTGACTACTACACAGAGACTAAGATCTTACAGGAGAGGG  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAACTGAAGACCTTCCCTATGCCATGAAACCCATTGACTACTACACAGAGACTAAGATCTTACAGGAGAGGG  592

Query  545  CAGTTCTGGGCGCCAACGATCCTGAGAAGAATTTCTTAACCACAGCCATCCGCCCTCATGGCATTTTCGGCCCA  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGTTCTGGGCGCCAACGATCCTGAGAAGAATTTCTTAACCACAGCCATCCGCCCTCATGGCATTTTCGGCCCA  666

Query  619  AGGGACCCGCAGTTGGTACCCATCCTCATCGAGGCAGCCAGGAACGGCAAGATGAAGTTCGTGATTGGAAATGG  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGGACCCGCAGTTGGTACCCATCCTCATCGAGGCAGCCAGGAACGGCAAGATGAAGTTCGTGATTGGAAATGG  740

Query  693  GAAGAACTTGGTGGACTTCACCTTTGTGGAGAACGTGGTCCATGGACACATCCTGGCGGCAGAGCAGCTCTCCC  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGAACTTGGTGGACTTCACCTTTGTGGAGAACGTGGTCCATGGACACATCCTGGCGGCAGAGCAGCTCTCCC  814

Query  767  GAGACTCGACACTGGGTGGGAAGGCATTTCACATCACCAATGATGAGCCCATCCCTTTCTGGACATTCCTGTCT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGACTCGACACTGGGTGGGAAGGCATTTCACATCACCAATGATGAGCCCATCCCTTTCTGGACATTCCTGTCT  888

Query  841  CGCATCCTGACAGGCCTCAATTATGAGGCCCCCAAGTACCACATCCCCTACTGGGTGGCCTACTACCTGGCCCT  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCATCCTGACAGGCCTCAATTATGAGGCCCCCAAGTACCACATCCCCTACTGGGTGGCCTACTACCTGGCCCT  962

Query  915  CCTGCTATCCCTGCTGGTGATGGTGATCAGTCCTGTCATCCAGCTGCAGCCCACCTTCACACCCATGCGGGTCG  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTGCTATCCCTGCTGGTGATGGTGATCAGTCCTGTCATCCAGCTGCAGCCCACCTTCACACCCATGCGGGTCG  1036

Query  989  CACTGGCTGGCACATTCCACTACTACAGCTGCGAGAGAGCCAAAAAGGCCATGGGCTACCAGCCACTAGTGACC  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACTGGCTGGCACATTCCACTACTACAGCTGCGAGAGAGCCAAAAAGGCCATGGGCTACCAGCCACTAGTGACC  1110

Query 1063  ATGGATGATGCTATGGAGAGGACCGTGCAGAGCTTTCGCCACCTGCGGAGGGTCAAG  1119
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGATGATGCTATGGAGAGGACCGTGCAGAGCTTTCGCCACCTGCGGAGGGTCAAG  1167