Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08191
• Subject: XM_024448567.1
• Aligned Length: 1168
• Identities: 871
• Gaps: 290

Alignment

Query    1  ATGGGGGTCTGTGGGTACCTGTTCCTGCCCTGGAAGTGCCTCGTGGTCGTGTCTCTCAGGCTGCTGTTCCTTGT  74
                                                                                  .||.
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------------ATGA  4

Query   75  A-CCCA------------CAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGACAACGTG  135
            | ||||            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    5  AGCCCACCCCGTCCCCTTCTGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGACAACGTG  78

Query  136  ACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAA  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  ACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAA  152

Query  210  CCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAGCAACACCC  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  CCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAGCAACACCC  226

Query  284  AAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGGTGCAGACA  357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  AAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGGTGCAGACA  300

Query  358  GACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGA  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGA  374

Query  432  TATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTACGGTTACTT  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTACGGTTACTT  448

Query  506  GGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCATCACCCGG  579
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  449  GGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCATCACCAGG  522

Query  580  GAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTAAAGGTCAC  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  GAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTAAAGGTCAC  596

Query  654  CGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGACACTGCAGT  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  CGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGACACTGCAGT  670

Query  728  GTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAGGAAAGAAA  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  GTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAGGAAAGAAA  744

Query  802  GGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGACTATGGGAA  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  GGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGACTATGGGAA  818

Query  876  CTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTG------GTGAGACT-  942
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      .||||.|| 
Sbjct  819  CTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTGAACTAAATGAGCCTA  892

Query  943  -GTGCTC-------------------------------------------------------------------  948
             |.||||                                                                   
Sbjct  893  CGAGCTCAACTTTGTTGCAAGAAGTGAAAACTACAGCCCTGACCCCTTGGAAAGGTTTGTATATTTTTCAGACA  966

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct  967  GCTGCTGCCTTGGTGGGTGTGGGGTATGTAAAACTCTTCACCTTCCTCCCAGATGCCTTCTTTCCTGAGCTAAC  1040

Query  949  ----------------------------------------------------------  948
                                                                      
Sbjct 1041  TCCAGGAAGCAGCGCAGAGGGAACCCTCCCCCAACCTTCAACCATCTCCGTGTCAATT  1098