Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08252
- Subject:
- NM_001323625.2
- Aligned Length:
- 1292
- Identities:
- 1188
- Gaps:
- 91
Alignment
Query 1 ATGATCACTGGTGTGTTCAGCATGCGCTTGTGGACCCCAGTGGGCGTCCTGACCTCGCTGGCGTACTGCCTGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATCACTGGTGTGTTCAGCATGCGCTTGTGGACCCCAGTGGGCGTCCTGACCTCGCTGGCGTACTGCCTGCA 74
Query 75 CCAGCGGCGGGTGGCCCTGGCCGAGCTGCAGGAGGCCGATGGCCAGTGTCCGGTCGACCGCAGCCTGCTGAAGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGCGGCGGGTGGCCCTGGCCGAGCTGCAGGAGGCCGATGGCCAGTGTCCGGTCGACCGCAGCCTGCTGAAGT 148
Query 149 TGAAAATGGTGCAGGTCGTGTTTCGACACGGGGCTCGGAGTCCTCTCAAGCCGCTCCCGCTGGAGGAGCAGGTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGAAAATGGTGCAGGTCGTGTTTCGACACGGGGCTCGGAGTCCTCTCAAGCCGCTCCCGCTGGAGGAGCAGGTA 222
Query 223 GAGTGGAACCCCCAGCTATTAGAGGTCCCACCCCAAACTCAGTTTGATTACACAGTCACCAATCTAGCTGGTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGTGGAACCCCCAGCTATTAGAGGTCCCACCCCAAACTCAGTTTGATTACACAGTCACCAATCTAGCTGGTGG 296
Query 297 TCCGAAACCATATTCTCCTTACGACTCTCAATACCATGAGACCACCCTGAAGGGGGGCATGTTTGCTGGGCAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCGAAACCATATTCTCCTTACGACTCTCAATACCATGAGACCACCCTGAAGGGGGGCATGTTTGCTGGGCAGC 370
Query 371 TGACCAAGGTGGGCATGCAGCAAATGTTTGCCTTGGGAGAGAGACTGAGGAAGAACTATGTGGAAGACATTCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGACCAAGGTGGGCATGCAGCAAATGTTTGCCTTGGGAGAGAGACTGAGGAAGAACTATGTGGAAGACATTCCC 444
Query 445 TTTCTTTCACCAACCTTCAACCCACAGGAGGTCTTTATTCGTTCCACTAACATTTTTCGGAATCTGGAGTCCAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTCTTTCACCAACCTTCAACCCACAGGAGGTCTTTATTCGTTCCACTAACATTTTTCGGAATCTGGAGTCCAC 518
Query 519 CCGTTGTTTGCTGGCTGGGCTTTTCCAGTGTCAGAAAGAAGGACCCATCATCATCCACACTGATGAAGCAGATT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCGTTGTTTGCTGGCTGGGCTTTTCCAGTGTCAGAAAGAAGGACCCATCATCATCCACACTGATGAAGCAGATT 592
Query 593 CAGAAGTCTTGTATCCCAACTACCAAAGCTGCTGGAGCCTGAGGCAGAGAACCAGAGGCCGGAGGCAGACTGCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGAAGTCTTGTATCCCAACTACCAAAGCTGCTGGAGCCTGAGGCAGAGAACCAGAGGCCGGAGGCAGACTGCC 666
Query 667 TCTTTACAGCCAGGAATCTCAGAGGATTTGAAAAAGGTGAAGGACAGGATGGGCATTGACAGTAGTGATAAAGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTTTACAGCCAGGAATCTCAGAGGATTTGAAAAAGGTGAAGGACAGGATGGGCATTGACAGTAGTGATAAAGT 740
Query 741 GGACTTCTTCATCCTCCTGGACAAAGTGGCTGCCGAGCAGGCACACAACCTCCCAAGCTGCCCCATGCTGAAGA 814
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGACTTCTTCATCCTCCTGGACAACGTGGCTGCCGAGCAGGCACACAACCTCCCAAGCTGCCCCATGCTGAAGA 814
Query 815 GATTTGCACGGATGATCGAACAGAGAGCTGTGGACACATCCTTGTACATACTGCCCAAGGAAGACAGGGAAAGT 888
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATTTGCAAGGATGATCGAACAGAGAGCTGTGGACACATCCTTGTACATACTGCCCAAGGAAGACAGGGAAAGT 888
Query 889 CTTCAGATGGCAGTAGGCCCATTCCTCCACATCCTAGAGAGCAACCTGCTGAAAGCCATGGACTCTGCCACTGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTCAGATGGCAGTAGGCCCATTCCTCCACATCCTAGAGAGCAACCTGCTGAAAGCCATGGACTCTGCCACTGC 962
Query 963 CCCCGACAAGATCAGAAAGCTGTATCTCTATGCGGCTCATGATGTGACCTTCATACCGCTCTTAATGACCCTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCCCGACAAGATCAGAAAGCTGTATCTCTATGCGGCTCATGATGTGACCTTCATACCGCTCTTAATGACCCTGG 1036
Query 1037 GGATTTTTGACCACAAATGGCCACCGTTTGCTGTTGACCTGACCATGGAACTTTACCAGCACCTGGAATCTAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGATTTTTGACCACAAATGGCCACCGTTTGCTGTTGACCTGACCATGGAACTTTACCAGCACCTGGAATCTAAG 1110
Query 1111 GAGTGGTTTGTGCAGCTCTATTACCACGGGAAGG----AGC----AGGTGCCGAGAGGTTGCCCTGATGGGCTC 1176
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |.| |||| |.||||| |.|||
Sbjct 1111 GAGTGGTTTGTGCAGCTCTATTACCACGGGAAGGTAATACCCCTGAGGT-----GGGGTTG----GGTGG---- 1171
Query 1177 TGCCCGCTGGACATGTTCTTGAATGCCATGTCAGTTTATACCTTAAGCCCAGAAAAATACCATGCACTCTGCTC 1250
||| ||| |.|| .||| ||.|.||| ||| |||
Sbjct 1172 -------TGG---------TGA--GGCA-----------CCCT-----CCTGCAAA--ACC---CAC------- 1199
Query 1251 TCAAACTCAGGTGATGGAAGTTGGAAATGAAGAG 1284
|.|.||.||.
Sbjct 1200 -CTACCTGAGT----------------------- 1209