Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08252
- Subject:
- XM_011509601.3
- Aligned Length:
- 1293
- Identities:
- 1182
- Gaps:
- 99
Alignment
Query 1 ATGATCACTGGTGTGTTCAGCATGCGCTTGTGGACCCCAGTGGGCGTCCTGACCTCGCTGGCGTACTGCCTGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATCACTGGTGTGTTCAGCATGCGCTTGTGGACCCCAGTGGGCGTCCTGACCTCGCTGGCGTACTGCCTGCA 74
Query 75 CCAGCGGCGGGTGGCCCTGGCCGAGCTGCAGGAGGCCGATGGCCAGTGTCCGGTCGACCGCAGCCTGCTGAAGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGCGGCGGGTGGCCCTGGCCGAGCTGCAGGAGGCCGATGGCCAGTGTCCGGTCGACCGCAGCCTGCTGAAGT 148
Query 149 TGAAAATGGTGCAGGTCGTGTTTCGACACGGGGCTCGGAGTCCTCTCAAGCCGCTCCCGCTGGAGGAGCAGGTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGAAAATGGTGCAGGTCGTGTTTCGACACGGGGCTCGGAGTCCTCTCAAGCCGCTCCCGCTGGAGGAGCAGGTA 222
Query 223 GAGTGGAACCCCCAGCTATTAGAGGTCCCACCCCAAACTCAGTTTGATTACACAGTCACCAATCTAGCTGGTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGTGGAACCCCCAGCTATTAGAGGTCCCACCCCAAACTCAGTTTGATTACACAGTCACCAATCTAGCTGGTGG 296
Query 297 TCCGAAACCATATTCTCCTTACGACTCTCAATACCATGAGACCACCCTGAAGGGGGGCATGTTTGCTGGGCAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCGAAACCATATTCTCCTTACGACTCTCAATACCATGAGACCACCCTGAAGGGGGGCATGTTTGCTGGGCAGC 370
Query 371 TGACCAAGGTGGGCATGCAGCAAATGTTTGCCTTGGGAGAGAGACTGAGGAAGAACTATGTGGAAGACATTCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGACCAAGGTGGGCATGCAGCAAATGTTTGCCTTGGGAGAGAGACTGAGGAAGAACTATGTGGAAGACATTCCC 444
Query 445 TTTCTTTCACCAACCTTCAACCCACAGGAGGTCTTTATTCGTTCCACTAACATTTTTCGGAATCTGGAGTCCAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTCTTTCACCAACCTTCAACCCACAGGAGGTCTTTATTCGTTCCACTAACATTTTTCGGAATCTGGAGTCCAC 518
Query 519 CCGTTGTTTGCTGGCTGGGCTTTTCCAGTGTCAGAAAGAAGGACCCATCATCATCCACACTGATGAAGCAGATT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCGTTGTTTGCTGGCTGGGCTTTTCCAGTGTCAGAAAGAAGGACCCATCATCATCCACACTGATGAAGCAGATT 592
Query 593 CAGAAGTCTTGTATCCCAACTACCAAAGCTGCTGGAGCCTGAGGCAGAGAACCAGAGGCCGGAGGCAGACTGCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGAAGTCTTGTATCCCAACTACCAAAGCTGCTGGAGCCTGAGGCAGAGAACCAGAGGCCGGAGGCAGACTGCC 666
Query 667 TCTTTACAGCCAGGAATCTCAGAGGATTTGAAAAAGGTGAAGGACAGGATGGGCATTGACAGTAGTGATAAAGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTTTACAGCCAGGAATCTCAGAGGATTTGAAAAAGGTGAAGGACAGGATGGGCATTGACAGTAGTGATAAAGT 740
Query 741 GGACTTCTTCATCCTCCTGGACAAAGTGGCTGCCGAGCAGGCACACAACCTCCCAAGCTGCCCCATGCTGAAGA 814
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGACTTCTTCATCCTCCTGGACAACGTGGCTGCCGAGCAGGCACACAACCTCCCAAGCTGCCCCATGCTGAAGA 814
Query 815 GATTTGCACGGATGATCGAACAGAGAGCTGTGGACACATCCTTGTACATACTGCCCAAGGAAGACAGGGAAAGT 888
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATTTGCAAGGATGATCGAACAGAGAGCTGTGGACACATCCTTGTACATACTGCCCAAGGAAGACAGGGAAAGT 888
Query 889 CTTCAGATGGCAGTAGGCCCATTCCTCCACATCCTAGAGAGCAACCTGCTGAAAGCCATGGACTCTGCCACTGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTCAGATGGCAGTAGGCCCATTCCTCCACATCCTAGAGAGCAACCTGCTGAAAGCCATGGACTCTGCCACTGC 962
Query 963 CCCCGACAAGATCAGAAAGCTGTATCTCTATGCGGCTCATGATGTGACCTTCATACCGCTCTTAATGACCCTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCCCGACAAGATCAGAAAGCTGTATCTCTATGCGGCTCATGATGTGACCTTCATACCGCTCTTAATGACCCTGG 1036
Query 1037 GGATTTTTGACCACAAATGGCCACCGTTTGCTGTTGACCTGACCATGGAACTTTACCAGCACCTGGAATCTAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGATTTTTGACCACAAATGGCCACCGTTTGCTGTTGACCTGACCATGGAACTTTACCAGCACCTGGAATCTAAG 1110
Query 1111 GAGTGGTTTGTGCAGCTCTATTACCACGGGAAGGA---GCAGGTGCCGAGAGGTTGCCCTGATGGGCTCTGCCC 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||..|.||
Sbjct 1111 GAGTGGTTTGTGCAGCTCTATTACCACGGGAAGGACTTGCAGGTAGCAAG------------------------ 1160
Query 1182 GCTGGACAT----GTTCTTGAATGCCATGTCAGTTTATACCTTAAGCCCAGAAAAATACCATGCACTCTGCTCT 1251
||| | ||||| ||| |||||.|.|.| |||.|
Sbjct 1161 ------CATAACAG-----GAATG-------------------AAG------AAAATTCTAGG------GCTTT 1192
Query 1252 --CAAACTCAGGTGATGGAAGTTGGAAATGAAGAG 1284
||..||||.
Sbjct 1193 TCCAGCCTCAT------------------------ 1203