Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08349
• Subject: NM_001346281.2
• Aligned Length: 1058
• Identities: 945
• Gaps: 112

Alignment

Query    1  ATGGCGGTGGACATCACGCTGCTATTCCGGGCCAGCGTCAAGACCGTGAAGACGCGGAACAAGGCGCTGGGAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGTGGACATCACGCTGCTATTCCGGGCCAGCGTCAAGACCGTGAAGACGCGGAACAAGGCGCTGGGAGT  74

Query   75  GGCGGTGGGCGGCGGGGTCGATGGCAGCCGGGACGAGCTGTTCCGCCGGAGCCCCCGGCCCAAGGGCGACTTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGGTGGGCGGCGGGGTCGATGGCAGCCGGGACGAGCTGTTCCGCCGGAGCCCCCGGCCCAAGGGCGACTTCT  148

Query  149  CCAGCCGGGCCCGCGAAGTGATTTCTCACATTGGCAAACTGAGAGATTTTCTTCTGGAACACAGGAAAGATTAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGCCGGGCCCGCGAAGTGATTTCTCACATTGGCAAACTGAGAGATTTTCTTCTGGAACACAGGAAAGATTAT  222

Query  223  ATTAATGCTTATAGCCATACCATGTCTGAATATGGGAGGATGACAGACACAGAACGAGACCAGATAGACCAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTAATGCTTATAGCCATACCATGTCTGAATATGGGAGGATGACAGACACAGAACGAGACCAGATAGACCAGGA  296

Query  297  TGCCCAGATATTCATGAGGACCTGTTCAGAAGCAATTCAGCAACTACGAACAGAAGCTCACAAGGAGATACATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCCAGATATTCATGAGGACCTGTTCAGAAGCAATTCAGCAACTACGAACAGAAGCTCACAAGGAGATACATT  370

Query  371  CCCAGCAAGTGAAGGAGCACAGGACCGCTGTTTTGGATTTCATTGAAGATTACTTGAAAAGAGTATGTAAACTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCAGCAAGTGAAGGAGCACAGGACCGCTGTTTTGGATTTCATTGAAGATTACTTGAAAAGAGTATGTAAACTT  444

Query  445  TACTCAGAACAGAGAGCCATCCGAGTTAAAAGAGTGGTGGATAAGAAAAGATT---------------------  497
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  445  TACTCAGAACAGAGAGCCATCCGAGTTAAAAGAGTGGTGGATAAGAAAAGATTAGCCTTTGCTGGAGGCATAAA  518

Query  498  --------------------------------ATCTAAGTTGGAACCAGAACCAAATACAAAGACAAGAGAATC  539
                                            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGGACAGGCGTACCTCGGAGATATCACAGATCTAAGCTGGAACCAGAACCAAATACAAAGACAAGAGAATC  592

Query  540  CACATCTTCTGAGAAAGTTTCACAGAGTCCTTCAAAAGACTCTGAAGAAAACCCTGCCACTGAAGAACGTCCAG  613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACATCTTCTGAGAAAGTTTCACAGAGTCCTTCAAAAGACTCTGAAGAAAACCCTGCCACTGAAGAACGTCCAG  666

Query  614  AAAAAATTTTGGCTGAAACACAACCTGAATTGGGAACGTGGGGAGATGGCAAAGGCGAAGATGAGTTATCCCCA  687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAAAATTTTGGCTGAAACACAACCTGAATTGGGAACGTGGGGAGATGGCAAAGGCGAAGATGAGTTATCCCCA  740

Query  688  GAAGAAATACAAATGTTTGAACAGGAAAATCAGCGACTAATTGGTGAAATGAACAGCTTGTTTGATGAAGTGAG  761
            ||||||||||||||                                                           |
Sbjct  741  GAAGAAATACAAAT-----------------------------------------------------------G  755

Query  762  GCAAATCGAAGGGAGAGTGGTTGAGATTTCCAGACTCCAAGAGATATTCACGGAAAAGGTTTTGCAACAGGAAG  835
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  756  GCAAATCGAAGGGAGAGTGGTTGAGATTTCCAGACTCCAAGAGATATTCACGGAAAAGGTTTTGCAACAGGAAG  829

Query  836  CTGAGATTGACAGCATTCACCAGTTAGTTGTGGGGGCAACTGAAAATATCAAGGAAGGCAACGAAGACATAAGA  909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  830  CTGAGATTGACAGCATTCACCAGTTAGTTGTGGGGGCAACTGAAAATATCAAGGAAGGCAACGAAGACATAAGA  903

Query  910  GAGGCCATTAAAAACAACGCTGGCTTCCGCGTGTGGATCCTCTTCTTCCTCGTGATGTGCTCCTTCTCCTTGCT  983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  904  GAGGCCATTAAAAACAACGCTGGCTTCCGCGTGTGGATCCTCTTCTTCCTCGTGATGTGCTCCTTCTCCTTGCT  977

Query  984  CTTCCTCGACTGGTACGACAGC  1005
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct  978  CTTCCTCGACTGGTACGACAGC  999