Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08372
Subject:
NM_170601.5
Aligned Length:
1569
Identities:
1567
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGTCGCGCCGGGGCTTGTACTCGGGCTGGTGCTGCCATTAATCCTGTGGGCCGACAGAAGTGCAGGTATTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCGCGCCGGGGCTTGTACTCGGGCTGGTGCTGCCATTAATCCTGTGGGCCGACAGAAGTGCAGGTATTGG  74

Query   75  TTTTCGCTTTGCTTCATACATCAATAATGATATGGTGCTGCAGAAGGAGCCTGCTGGGGCAGTGATATGGGGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTTTCGCTTTGCTTCATACATCAATAATGATATGGTGCTGCAGAAGGAGCCTGCTGGGGCAGTGATATGGGGCT  148

Query  149  TCGGTACACCTGGAGCCACAGTGACCGTGACCCTGCGCCAAGGTCAGGAAACCATCATGAAGAAAGTGACCAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCGGTACACCTGGAGCCACAGTGACCGTGACCCTGCGCCAAGGTCAGGAAACCATCATGAAGAAAGTGACCAGT  222

Query  223  GTAAAAGCTCACTCTGATACGTGGATGGTGGTACTGGATCCTATGAAGCCTGGAGGACCTTTCGAAGTGATGGC  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGAAAGCTCACTCTGATACGTGGATGGTGGTACTGGATCCTATGAAGCCTGGAGGACCTTTCGAAGTGATGGC  296

Query  297  ACAACAGACTTTGGAGAAAATAAACTTCACCCTGAGAGTTCATGACGTCCTGTTTGGAGATGTCTGGCTCTGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAACAGACTTTGGAGAAAATAAACTTCACCCTGAGAGTTCATGACGTCCTGTTTGGAGATGTCTGGCTCTGTA  370

Query  371  GTGGGCAGAGTAACATGCAGATGACTGTGTTACAGATATTTAATGCTACAAGGGAGTTGTCTAACACTGCGGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGGGCAGAGTAACATGCAGATGACTGTGTTACAGATATTTAATGCTACAAGGGAGTTGTCTAACACTGCGGCA  444

Query  445  TATCAGTCTGTCCGCATCCTCTCTGTCTCTCCCATTCAAGCAGAGCAGGAGCTGGAGGACCTTGTTGCGGTTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATCAGTCTGTCCGCATCCTCTCTGTCTCTCCCATTCAAGCAGAGCAGGAGCTGGAGGACCTTGTTGCGGTTGA  518

Query  519  CTTGCAGTGGTCTAAGCCCACCTCAGAAAACTTAGGCCATGGATATTTCAAGTACATGTCAGCAGTGTGCTGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTGCAGTGGTCTAAGCCCACCTCAGAAAACTTAGGCCATGGATATTTCAAGTACATGTCAGCAGTGTGCTGGC  592

Query  593  TCTTTGGACGTCACCTTTATGACACTCTGCAGTATCCCATCGGGCTGATCGCCTCCAGCTGGGGCGGGACACCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTTTGGACGTCACCTTTATGACACTCTGCAGTATCCCATCGGGCTGATCGCCTCCAGCTGGGGCGGGACACCC  666

Query  667  ATTGAAGCCTGGTCATCTGGACGGTCACTGAAAGCCTGTGGGGTCCCTAAACAAGGGTCCATTCCATACGATTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGAAGCCTGGTCATCTGGACGGTCACTGAAAGCCTGTGGGGTCCCTAAACAAGGGTCCATTCCATACGATTC  740

Query  741  TGTAACTGGTCCCAGTAAGCACTCTGTTCTCTGGAATGCCATGATCCATCCACTGTGCAATATGACTCTGAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTAACTGGTCCCAGTAAGCACTCTGTTCTCTGGAATGCCATGATCCATCCACTGTGCAATATGACTCTGAAAG  814

Query  815  GGGTAGTATGGTACCAGGGGGAGTCCAATATAAATTATAACACGGATCTGTACAATTGCACATTCCCTGCACTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGTAGTATGGTACCAGGGGGAGTCCAATATAAATTATAACACGGATCTGTACAATTGCACATTCCCTGCACTC  888

Query  889  ATCGAAGACTGGCGTGAAACCTTCCACCGTGGTTCCCAGGGGCAGACGGAGCGTTTCTTCCCATTTGGACTTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCGAAGACTGGCGTGAAACCTTCCACCGTGGTTCCCAGGGGCAGACGGAGCGTTTCTTCCCATTTGGACTTGT  962

Query  963  CCAGTTATCTTCAGATTTGTCTAAGAAGAGCTCAGACGATGGATTTCCCCAGATCCGTTGGCATCAAACAGCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGTTATCTTCAGATTTGTCTAAGAAGAGCTCAGACGATGGATTTCCCCAGATCCGTTGGCATCAAACAGCAG  1036

Query 1037  ACTTCGGCTATGTCCCCAACCCAAAGATGCCCAATACTTTCATGGCTGTAGCTATGGATCTCTGTGATAGAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTTCGGCTATGTCCCCAACCCAAAGATGCCCAATACTTTCATGGCTGTAGCTATGGATCTCTGTGATAGAGAC  1110

Query 1111  TCGCCTTTTGGCAGCATCCACCCTCGAGATAAACAGACTGTGGCTTATCGGCTGCATTTGGGGGCCCGTGCTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCGCCTTTTGGCAGCATCCACCCTCGAGATAAACAGACTGTGGCTTATCGGCTGCATTTGGGGGCCCGTGCTCT  1184

Query 1185  GGCTTATGGTGAGAAGAATTTGACCTTTGAAGGACCACTGCCTGAGAAGATAGAACTCTTGGCTCACAAGGGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTTATGGTGAGAAGAATTTGACCTTTGAAGGACCACTGCCTGAGAAGATAGAACTCTTGGCTCACAAGGGGC  1258

Query 1259  TGCTCAATCTCACATATTACCAGCAAATCCAGGTGCAGAAAAAGGACAACAAGATATTTGAGATCTCCTGTTGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTCAATCTCACATATTACCAGCAAATCCAGGTGCAGAAAAAGGACAACAAGATATTTGAGATCTCCTGTTGC  1332

Query 1333  AGTGACCATCGATGCAAGTGGCTTCCAGCTTCTATGAACACCGTCTCCACCCAGTCCCTGACCCTGGCGATCGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGACCATCGATGCAAGTGGCTTCCAGCTTCTATGAACACCGTCTCCACCCAGTCCCTGACCCTGGCGATCGA  1406

Query 1407  TTCTTGTCATGGCACTGTGGTTGCTCTCCGCTATGCTTGGACCACGTGGCCTTGTGAATATAAGCAGTGTCCCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTCTTGTCATGGCACTGTGGTTGCTCTCCGCTATGCTTGGACCACGTGGCCTTGTGAATATAAGCAGTGTCCCC  1480

Query 1481  TATACCACCCCAGTAGTGCCCTGCCAGCCCCTCCATTCATTGCTTTCATTACAGACCAGGGTCCTGGACATCAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TATACCACCCCAGTAGTGCCCTGCCAGCCCCTCCCTTCATTGCTTTCATTACAGACCAGGGTCCTGGACATCAG  1554

Query 1555  AGCAATGTTGCTAAA  1569
            |||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCAATGTTGCTAAA  1569