Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08437
- Subject:
- XM_011248442.1
- Aligned Length:
- 1526
- Identities:
- 1225
- Gaps:
- 127
Alignment
Query 1 ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGTTGT 74
||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGATGTCAGAGCAGGACCTGGCGGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGATCACCCAGTTGT 74
Query 75 TTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGACTAGAAATCAATTGCCAGG 148
|||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 TTTGGAGAATCATGTCGTGACAGATGATGATGAACCTGCCTTGAAGCGCCAGCGACTAGAGATCAATTGCCAGG 148
Query 149 ATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTGGATAGCATTGAAGCCAAA 222
|.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 149 ACCCCTCTATAAAGTCTTTCCTGTACTCTATTAACCAGACGATATGTTTGCGGTTGGATAGCATTGAGGCCAAG 222
Query 223 TTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCACGAACAAGCAGCACAGCCC 296
.|||||||.||.|||||.|||||.|||||..|.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 223 CTGCAAGCTCTCGAGGCCACTTGCAAATCTCTGGAAGAGAAGCTAGACCTGGTCACCAATAAACAGCACAGTCC 296
Query 297 CATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACAAAGTGCGATG-------- 362
|||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 297 CATCCAGGTCCCCATGGTGGCAGGTTCCCCACTTGGCGCCACCCAGACCTGCAACAAAGTGCGATGCGTCGTCC 370
Query 363 -------------------------------------------------------------------------- 362
Sbjct 371 CCCAGACTACAGTAATACTCAACAATGATCGGCAGAACGCCATTGTAGCCAAGATGGAAGACCCATTGAGCAAC 444
Query 363 -----------------------------------CGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAA 401
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 AGGGCACCGGATTCCCTGGAAAATATCATTAGCAACGCTGTTCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATCGTGGTGAA 518
Query 402 GGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCT 475
.|||||.||.||.||.|||||||||.||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|.||
Sbjct 519 AGTGCCTGGTCAGGACGACAGCCACAACGAAGATGGGGAGAGCGGGTCAGAGGCCAGTGACTCCGTGTCTAACT 592
Query 476 GTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCC 549
||||.|||.|.||.||.||||.|||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 593 GTGGCCAGCCAGGAAGCCAGAACATTGGAAGCAACGTCACACTCATCACCCTGAACTCCGAAGAGGACTATCCC 666
Query 550 AATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCT 623
||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 667 AATGGCACCTGGCTGGGCGATGAGAATAACCCTGAGATGCGGGTACGCTGTGCCATCATCCCTTCCGACATGTT 740
Query 624 GCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCTGAGAAGATGGCGCTAACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGG 697
||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 741 GCACATCAGCACCAACTGTCGCACGGCCGAGAAGATGGCGCTGACACTGCTGGACTACCTGTTCCACCGTGAGG 814
Query 698 TGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGC 771
|||||||||||||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 TGCAGGCTGTGTCCAACTTGTCCGGCCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCCCTCACCATCTACGGC 888
Query 772 ATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTC 845
||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 ATCCGGTGTCACCTCTTCTATAAATTTGGAATCACGGAATCTGACTGGTATCGGATCAAGCAGAGCATTGACTC 962
Query 846 CAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGC 919
|||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 963 CAAGTGCCGGACAGCCTGGCGGCGGAAGCAGCGAGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCTCGGAGGACGC 1036
Query 920 CCAACTCGTCCTCCTAC--TGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGC 991
|...|||.|||||.||| |||| ||||||.|.||||||.|.|||||.|||||..||||.|||||.|.||||.
Sbjct 1037 CATCCTCATCCTCTTACAGTGCC--TCAGAGACCATGATGGGAACCCCTCCTCCCACCAGTGAGCTACAGCAGT 1108
Query 992 CACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAA 1065
|| |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1109 CA------CAGCCACAGGCCCTACACTACGCCCTGGCCAACGCCCAGCAGGTCCAGATCCACCAGATTGGGGAG 1176
Query 1066 GACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGAT 1139
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1177 GATGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGCCACCTCCACATTGCCCAGGTGCCTCAAGGGGAGCAGGTGCAGAT 1250
Query 1140 CACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGC 1213
|||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1251 CACACAGGACAGCGAGGGCAATCTGCAGATCCATCATGTGGGTCAGGATGGCCAGGTACTGCAGGGTGCTCAGC 1324
Query 1214 TGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAG 1287
|.||.|||||||||||.||.|||||.||.||..|.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1325 TCATAGCCGTGGCCTCTTCAGACCCTGCTGCTACAGGAGTAGATGGGTCGCCTCTCCAGGGCAGTGACATTCAG 1398
Query 1288 GTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCAC 1361
||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||..||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1399 GTTCAGTATGTCCAGCTGGCGCCTGTGAGTGACCACACAGCCGCAGCGCAGACCGCAGAGGCCCTGCAGCCCAC 1472
Query 1362 GCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCATCCAGATTCAG 1407
.||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1473 TCTGCAGCCCGACATGCAGCTTGAACATGGGGCCATCCAGATCCAG 1518