Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08437
• Subject: XM_024450325.1
• Aligned Length: 1561
• Identities: 1276
• Gaps: 260

Alignment

Query    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAG----  70
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGGTAC  74

Query   71  --------------TTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC  130
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGCTGTGGGACATTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC  148

Query  131  TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG  222

Query  205  GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC  296

Query  279  GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA  370

Query  353  AAGTGCGATG----------------------------------------------------------------  362
            ||||||||||                                                                
Sbjct  371  AAGTGCGATGCGTCGTCCCCCAGACTACAGTAATACTCAACAATGATCGGCAGAACGCCATTGTAGCCAAGATG  444

Query  363  -----------------------------------------------------CGCTGTGCCTGGGCGTCGGCA  383
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGACCCCTTGAGCAACAGGGCACCGGATTCCCTGGAAAATGTCATTAGCAACGCTGTGCCTGGGCGTCGGCA  518

Query  384  GAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCA  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCA  592

Query  458  GCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAAC  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAAC  666

Query  532  TCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCAT  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCAT  740

Query  606  CATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCTGAGAAGATGGCGCTAACGCTGCTGGACT  679
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  741  CATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCCGAGAAGATGGCGCTCACGCTGCTGGACT  814

Query  680  ACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGAC  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGAC  888

Query  754  CCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAAT  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAAT  962

Query  828  CAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGA  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGA  1036

Query  902  GCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCC  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCC  1110

Query  976  AGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGAT  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGAT  1184

Query 1050  CCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGG  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTA---------GGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGG  1249

Query 1124  GGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGGTG  1197
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1250  GGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGCTT  1323

Query 1198  CTGCAGGGTGCACAGCTG-ATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGTGGATGGGTC------GC  1264
            ||..|||    .||.|.| |||.||  .||||||| ||.|||                 ||..|||      ||
Sbjct 1324  CTAGAGG----CCACCCGCATCCCC--TGCCTCCT-GGCCCC-----------------ATCCGTCTTCAAAGC  1373

Query 1265  CACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCT----GGCGCCAGTGAGT----GA-CCACACGGCC  1329
            ||       ||||.|   .||||||            |||    ||||     ||||    || |||       
Sbjct 1374  CA-------GCAGTG---GCCAGGT------------GCTTGAGGGCG-----GAGTTGCAGATCCA-------  1413

Query 1330  GGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGA---GATGCAGCTCGAGCACGGGGCCATCCA  1400
               |||.||||  .|||.|       ||.|.|.|| || |.|||   |||||..||                  
Sbjct 1414  ---GCAGAGAC--TCGATG-------GCACTCTCT-CA-CTGGATCTGATGCGACT------------------  1455

Query 1401  GATTCAG  1407
                   
Sbjct 1456  -------  1455