Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08453
• Subject: NM_001305155.1
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1028
• Gaps: 330

Alignment

Query    1  ATGGACTGGAAAGAAGTTCTTCGTCGGCGCCTAGCGACGCCCAACACCTGTCCAAACAAAAAAAAAAGTGAACA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAATTAAAAGATGAAGAAATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAAAACACAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAATTCTATAAGACCATTCCCCGGTTTTATTATAGGCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGAGAGGAATCAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAAGAATTACAGAACTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGACACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTT  370
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------ATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTT  40

Query  371  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   41  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCAT  114

Query  445  ACAGATTCATATGGAAGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  115  ACAGATTCATATGGAAGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAAC  188

Query  519  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  189  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATAT  262

Query  593  TGGAACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  TGGAACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCA  336

Query  667  GTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  GTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAG  410

Query  741  CTTCCTAGATGATTTATTGGAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  CTTCCTAGATGATTTATTGGAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  484

Query  815  CTCCTTCTGCCCTAAGAGTTTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  CTCCTTCTGCCCTAAGAGTTTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAA  558

Query  889  GAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  GAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  632

Query  963  TGATGGAGAAATGGACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  TGATGGAGAAATGGACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTC  706

Query 1037  TACAATATATTTTCAAACTGCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  TACAATATATTTTCAAACTGCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT  780

Query 1111  AGGGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  AGGGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  854

Query 1185  TGACATGGTAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  TGACATGGTAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  928

Query 1259  TAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  TAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGT  1002

Query 1333  GAAAACTCTGCAGACCTNGATGATACA  1359
            |||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1003  GAAAACTCTGCAGACCTTGATGATACA  1029