Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08454
- Subject:
- NM_017935.5
- Aligned Length:
- 2355
- Identities:
- 2263
- Gaps:
- 90
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTGCCAGCAGCGCCAGGCAAGGGGCTTGGGAGCCCGGACCCCGCCCCCTGCGGCCCAGCGCCCCCAGGAAA 74
Query 1 ----------------ATGATATATGAAGAAGATGCTGAGGAATGGGCTCTGTACTTGACAGAAGTATTTTTAC 58
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TACAAAAGATATAATAATGATATATGAAGAAGATGCTGAGGAATGGGCTCTGTACTTGACAGAAGTATTTTTAC 148
Query 59 ATGTTGTGAAAAGGGAAGCCATCCTGTTATATCGCTTGGAGAATTTCTCTTTTCGGCATTTGGAGTTGCTGAAC 132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGTTGTGAAAAGGGAAGCCATCCTGTTATATCGCTTGGAGAATTTCTCTTTTCGGCATTTGGAGTTGCTGAAC 222
Query 133 TTAACGTCTTACAAATGTAAACTTTTGATATTATCAAATAGCCTGCTTAGAGACCTAACTCCAAAGAAATGTCA 206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTAACGTCTTACAAATGTAAACTTTTGATATTATCAAATAGCCTGCTTAGAGACCTAACTCCAAAGAAATGTCA 296
Query 207 GTTTCTGGAAAAGATACTTCATTCACCAAAAAGTGTAGTTACTTTGCTTTGTGGAGTGAAGAGTTCAGATCAGC 280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTTTCTGGAAAAGATACTTCATTCACCAAAAAGTGTAGTTACTTTGCTTTGTGGAGTGAAGAGTTCAGATCAGC 370
Query 281 TCTATGAATTACTAAATATCTCTCAAAGCAGATGGGAGATCTCAACTGAACAGGAACCTGAAGACTACATCTCT 354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTATGAATTACTAAATATCTCTCAAAGCAGATGGGAGATCTCAACTGAACAGGAACCTGAAGACTACATCTCT 444
Query 355 GTAATCCAGAGTATCATATTCAAAGATTCTGAAGACTACTTTGAGGTCAACATTCCAACAGACCTACGAGCAAA 428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTAATCCAGAGTATCATATTCAAAGATTCTGAAGACTACTTTGAGGTCAACATTCCAACAGACCTACGAGCAAA 518
Query 429 ACATTCTGGGGAAATAAGTGAGAGAAAGGAAATTGAAGAACTATCAGAAGCTTCAAGAAACACCATACCACTAG 502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACATTCTGGGGAAATAAGTGAGAGAAAGGAAATTGAAGAACTATCAGAAGCTTCAAGAAACACCATACCACTAG 592
Query 503 CAGTGGTGCTTCCCACTGAAATTCCATGTGAGAATCCTGGTGAAATATTCATAATTTTGAGAGATGAAGTAATT 576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGTGGTGCTTCCCACTGAAATTCCATGTGAGAATCCTGGTGAAATATTCATAATTTTGAGAGATGAAGTAATT 666
Query 577 GGTGATACTGTAGAGGTTGAATTTACATCAAGTAATAAGCGCATTAGAACACGGCCAGCCCTTTGGAATAAGAA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGTGATACTGTAGAGGTTGAATTTACATCAAGTAATAAGCGCATTAGAACACGGCCAGCCCTTTGGAATAAGAA 740
Query 651 AGTCTGGTGCATGAAAGCTTTAGAGTTTCCTGCTGGTTCAGTCCATGTCAATGTCTACTGTGATGGAATCGTTA 724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTCTGGTGCATGAAAGCTTTAGAGTTTCCTGCTGGTTCAGTCCATGTCAATGTCTACTGTGATGGAATCGTTA 814
Query 725 AAGCTACAACCAAAATTAAGTACTACCCAACAGCAAAGGCAAAGGAATGCCTATTCAGAATGGCAGATTCAGGA 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGCTACAACCAAAATTAAGTACTACCCAACAGCAAAGGCAAAGGAATGCCTATTCAGAATGGCAGATTCAGGA 888
Query 799 GAGAGTTTGTGCCAGAATAGCATTGAAGAACTTGATGGTGTCCTTACATCCATATTCAAACATGAGATACCATA 872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGAGTTTGTGCCAGAATAGCATTGAAGAACTTGATGGTGTCCTTACATCCATATTCAAACATGAGATACCATA 962
Query 873 TTATGAGTTCCAGTCTCTTCAAACTGAAATTTGTTCTCAAAACAAATATACTCATTTCAAAGAACTTCCAACTC 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTATGAGTTCCAGTCTCTTCAAACTGAAATTTGTTCTCAAAACAAATATACTCATTTCAAAGAACTTCCAACTC 1036
Query 947 TTCTCCACTGTGCAGCAAAATTTGGCTTAAAGAACCTGGCTATTCATTTGCTTCAATGTTCAGGAGCAACCTGG 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTCTCCACTGTGCAGCAAAATTTGGCTTAAAGAACCTGGCTATTCATTTGCTTCAATGTTCAGGAGCAACCTGG 1110
Query 1021 GCATCTAAGATGAAAAATATGGAGGGTTCAGACCCCGCACATATTGCTGAAAGGCATGGTCACAAAGAACTCAA 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCATCTAAGATGAAAAATATGGAGGGTTCAGACCCCGCACATATTGCTGAAAGGCATGGTCACAAAGAACTCAA 1184
Query 1095 GAAAATCTTCGAAGACTTTTCAATCCAAGAAATTGACATAAATAATGAGCAAGAAAATGATTATGAAGAGGATA 1168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAAAATCTTCGAAGACTTTTCAATCCAAGAAATTGACATAAATAATGAGCAAGAAAATGATTATGAAGAGGATA 1258
Query 1169 TTGCCTCATTTTCCACATATATTCCTTCCACACAGAACCCAGCATTTCATCATGAAAGCAGAAAGACATACGGG 1242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259 TTGCCTCATTTTCCACATATATTCCTTCCACACAGAACCCAGCATTTCATCATGAAAGCAGGAAGACATACGGG 1332
Query 1243 CAGAGTGCAGATGGAGCTGAGGCAAATGAAATGGAAGGGGAAGGAAAACAGAATGGATCAGGCATGGAGACCAA 1316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGAGTGCAGATGGAGCTGAGGCAAATGAAATGGAAGGGGAAGGAAAACAGAATGGATCAGGCATGGAGACCAA 1406
Query 1317 ACACAGCCCACTAGAGGTTGGCAGTGAGAGTTCTGAAGACCAGTATGATGACTTGTATGTGTTCATTCCTGGTG 1390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACACAGCCCACTAGAGGTTGGCAGTGAGAGTTCTGAAGACCAGTATGATGACTTGTATGTGTTCATTCCTGGTG 1480
Query 1391 CTGATCCAGAAAATAATTCACAAGAGCCACTCATGAGCAGCAGACCTCCTCTCCCCCCGCCGCGACCTGTAGCT 1464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGATCCAGAAAATAATTCACAAGAGCCACTCATGAGCAGCAGACCTCCTCTCCCCCCGCCGCGACCTGTAGCT 1554
Query 1465 AATGCCTTCCAACTGGAAAGACCTCACTTCACCTTACCAGGGACAATGGTGGAAGGCCAAATGGAAAGAAGTCA 1538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AATGCCTTCCAACTGGAAAGACCTCACTTCACCTTACCAGGGACAATGGTGGAAGGCCAAATGGAAAGAAGTCA 1628
Query 1539 AAACTGGGGTCATCCTGGTGTTAGACAAGAAACAGGAGATGAACCCAAAGGAGAAAAAGAGAAGAAAGAAGAGG 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAACTGGGGTCATCCTGGTGTTAGACAAGAAACAGGAGATGAACCCAAAGGAGAAAAAGAGAAGAAAGAAGAGG 1702
Query 1613 AAAAAGAGCAGGAGGAGGAAGAAGACCCATATACTTTTGCTGAGATTGATGACAGTGAATATGACATGATATTG 1686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAAAAGAGCAGGAGGAGGAAGAAGACCCATATACTTTTGCTGAGATTGATGACAGTGAATATGACATGATATTG 1776
Query 1687 GCCAATCTGAGTATAAAGAAAAAAACTGGGAGTCGGTCTTTCATTATAAATAGACCTCCTGCCCCCACACCCCG 1760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCCAATCTGAGTATAAAGAAAAAAACTGGGAGTCGGTCTTTCATTATAAATAGACCTCCTGCCCCCACACCCCG 1850
Query 1761 ACCCACAAGTATACCTCCAAAAGAGGAAACTACACCTTACATAGCTCAAGTGTTTCAACAAAAGACAGCCAGAA 1834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACCCACAAGTATACCTCCAAAAGAGGAAACTACACCTTACATAGCTCAAGTGTTTCAACAAAAGACAGCCAGAA 1924
Query 1835 GACAATCTGATGATGACAAGTTCCGTGGTCTTCCTAAGAAACAAGACAGAGCTCGGATAGAGAGTCCAGCCTTT 1908
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GACAATCTGATGATGACAAGTTCTGTGGTCTTCCTAAGAAACAAGACAGAGCTCGGATAGAGAGTCCAGCCTTT 1998
Query 1909 TCTACTCTCAGGGGCTGTCTAACTGATGGTCAGGAAGAACTCATCCTCCTGCAGGAGAAAGTAAAGAATGGGAA 1982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TCTACTCTCAGGGGCTGTCTAACTGATGGTCAGGAAGAACTCATCCTCCTGCAGGAGAAAGTAAAGAATGGGAA 2072
Query 1983 AATGTCTATGGATGAAGCTCTGGAGAAATTTAAACACTGGCAGATGGGAAAAAGTGGCCTGGAAATGATTCAGC 2056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AATGTCTATGGATGAAGCTCTGGAGAAATTTAAACACTGGCAGATGGGAAAAAGTGGCCTGGAAATGATTCAGC 2146
Query 2057 AGGAGAAATTACGACAACTACGAGACTGCATTATTGGGAAAAGGCCAGAAGAAGAAAATGTCTATAATAAACTC 2130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGGAGAAATTACGACAACTACGAGACTGCATTATTGGGAAAAGGCCAGAAGAAGAAAATGTCTATAATAAACTC 2220
Query 2131 ACCATTGTGCACCATCCAGGTGGTAAGGAAACTGCCCACAATGAAAATAAGTTTTATAATGTACACTTCAGCAA 2204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ACCATTGTGCACCATCCAGGTGGTAAGGAAACTGCCCACAATGAAAATAAGTTTTATAATGTACACTTCAGCAA 2294
Query 2205 TAAGCTTCCTGCTCGACCCCAAGTTGAAAAGGAATTTGGTTTCTGTTGCAAGAAAGATCAT 2265
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TAAGCTTCCTGCTCGACCCCAAGTTGAAAAGGAATTTGGTTTCTGTTGCAAGAAAGATCAT 2355