Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08454
• Subject: XM_017008337.2
• Aligned Length: 2265
• Identities: 2263
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGATATATGAAGAAGATGCTGAGGAATGGGCTCTGTACTTGACAGAAGTATTTTTACATGTTGTGAAAAGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATATATGAAGAAGATGCTGAGGAATGGGCTCTGTACTTGACAGAAGTATTTTTACATGTTGTGAAAAGGGA  74

Query   75  AGCCATCCTGTTATATCGCTTGGAGAATTTCTCTTTTCGGCATTTGGAGTTGCTGAACTTAACGTCTTACAAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCCATCCTGTTATATCGCTTGGAGAATTTCTCTTTTCGGCATTTGGAGTTGCTGAACTTAACGTCTTACAAAT  148

Query  149  GTAAACTTTTGATATTATCAAATAGCCTGCTTAGAGACCTAACTCCAAAGAAATGTCAGTTTCTGGAAAAGATA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTAAACTTTTGATATTATCAAATAGCCTGCTTAGAGACCTAACTCCAAAGAAATGTCAGTTTCTGGAAAAGATA  222

Query  223  CTTCATTCACCAAAAAGTGTAGTTACTTTGCTTTGTGGAGTGAAGAGTTCAGATCAGCTCTATGAATTACTAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCATTCACCAAAAAGTGTAGTTACTTTGCTTTGTGGAGTGAAGAGTTCAGATCAGCTCTATGAATTACTAAA  296

Query  297  TATCTCTCAAAGCAGATGGGAGATCTCAACTGAACAGGAACCTGAAGACTACATCTCTGTAATCCAGAGTATCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATCTCTCAAAGCAGATGGGAGATCTCAACTGAACAGGAACCTGAAGACTACATCTCTGTAATCCAGAGTATCA  370

Query  371  TATTCAAAGATTCTGAAGACTACTTTGAGGTCAACATTCCAACAGACCTACGAGCAAAACATTCTGGGGAAATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATTCAAAGATTCTGAAGACTACTTTGAGGTCAACATTCCAACAGACCTACGAGCAAAACATTCTGGGGAAATA  444

Query  445  AGTGAGAGAAAGGAAATTGAAGAACTATCAGAAGCTTCAAGAAACACCATACCACTAGCAGTGGTGCTTCCCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTGAGAGAAAGGAAATTGAAGAACTATCAGAAGCTTCAAGAAACACCATACCACTAGCAGTGGTGCTTCCCAC  518

Query  519  TGAAATTCCATGTGAGAATCCTGGTGAAATATTCATAATTTTGAGAGATGAAGTAATTGGTGATACTGTAGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAATTCCATGTGAGAATCCTGGTGAAATATTCATAATTTTGAGAGATGAAGTAATTGGTGATACTGTAGAGG  592

Query  593  TTGAATTTACATCAAGTAATAAGCGCATTAGAACACGGCCAGCCCTTTGGAATAAGAAAGTCTGGTGCATGAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGAATTTACATCAAGTAATAAGCGCATTAGAACACGGCCAGCCCTTTGGAATAAGAAAGTCTGGTGCATGAAA  666

Query  667  GCTTTAGAGTTTCCTGCTGGTTCAGTCCATGTCAATGTCTACTGTGATGGAATCGTTAAAGCTACAACCAAAAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTTTAGAGTTTCCTGCTGGTTCAGTCCATGTCAATGTCTACTGTGATGGAATCGTTAAAGCTACAACCAAAAT  740

Query  741  TAAGTACTACCCAACAGCAAAGGCAAAGGAATGCCTATTCAGAATGGCAGATTCAGGAGAGAGTTTGTGCCAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAAGTACTACCCAACAGCAAAGGCAAAGGAATGCCTATTCAGAATGGCAGATTCAGGAGAGAGTTTGTGCCAGA  814

Query  815  ATAGCATTGAAGAACTTGATGGTGTCCTTACATCCATATTCAAACATGAGATACCATATTATGAGTTCCAGTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATAGCATTGAAGAACTTGATGGTGTCCTTACATCCATATTCAAACATGAGATACCATATTATGAGTTCCAGTCT  888

Query  889  CTTCAAACTGAAATTTGTTCTCAAAACAAATATACTCATTTCAAAGAACTTCCAACTCTTCTCCACTGTGCAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCAAACTGAAATTTGTTCTCAAAACAAATATACTCATTTCAAAGAACTTCCAACTCTTCTCCACTGTGCAGC  962

Query  963  AAAATTTGGCTTAAAGAACCTGGCTATTCATTTGCTTCAATGTTCAGGAGCAACCTGGGCATCTAAGATGAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAATTTGGCTTAAAGAACCTGGCTATTCATTTGCTTCAATGTTCAGGAGCAACCTGGGCATCTAAGATGAAAA  1036

Query 1037  ATATGGAGGGTTCAGACCCCGCACATATTGCTGAAAGGCATGGTCACAAAGAACTCAAGAAAATCTTCGAAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATATGGAGGGTTCAGACCCCGCACATATTGCTGAAAGGCATGGTCACAAAGAACTCAAGAAAATCTTCGAAGAC  1110

Query 1111  TTTTCAATCCAAGAAATTGACATAAATAATGAGCAAGAAAATGATTATGAAGAGGATATTGCCTCATTTTCCAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTTCAATCCAAGAAATTGACATAAATAATGAGCAAGAAAATGATTATGAAGAGGATATTGCCTCATTTTCCAC  1184

Query 1185  ATATATTCCTTCCACACAGAACCCAGCATTTCATCATGAAAGCAGAAAGACATACGGGCAGAGTGCAGATGGAG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATATATTCCTTCCACACAGAACCCAGCATTTCATCATGAAAGCAGGAAGACATACGGGCAGAGTGCAGATGGAG  1258

Query 1259  CTGAGGCAAATGAAATGGAAGGGGAAGGAAAACAGAATGGATCAGGCATGGAGACCAAACACAGCCCACTAGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGAGGCAAATGAAATGGAAGGGGAAGGAAAACAGAATGGATCAGGCATGGAGACCAAACACAGCCCACTAGAG  1332

Query 1333  GTTGGCAGTGAGAGTTCTGAAGACCAGTATGATGACTTGTATGTGTTCATTCCTGGTGCTGATCCAGAAAATAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTGGCAGTGAGAGTTCTGAAGACCAGTATGATGACTTGTATGTGTTCATTCCTGGTGCTGATCCAGAAAATAA  1406

Query 1407  TTCACAAGAGCCACTCATGAGCAGCAGACCTCCTCTCCCCCCGCCGCGACCTGTAGCTAATGCCTTCCAACTGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTCACAAGAGCCACTCATGAGCAGCAGACCTCCTCTCCCCCCGCCGCGACCTGTAGCTAATGCCTTCCAACTGG  1480

Query 1481  AAAGACCTCACTTCACCTTACCAGGGACAATGGTGGAAGGCCAAATGGAAAGAAGTCAAAACTGGGGTCATCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAAGACCTCACTTCACCTTACCAGGGACAATGGTGGAAGGCCAAATGGAAAGAAGTCAAAACTGGGGTCATCCT  1554

Query 1555  GGTGTTAGACAAGAAACAGGAGATGAACCCAAAGGAGAAAAAGAGAAGAAAGAAGAGGAAAAAGAGCAGGAGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGTGTTAGACAAGAAACAGGAGATGAACCCAAAGGAGAAAAAGAGAAGAAAGAAGAGGAAAAAGAGCAGGAGGA  1628

Query 1629  GGAAGAAGACCCATATACTTTTGCTGAGATTGATGACAGTGAATATGACATGATATTGGCCAATCTGAGTATAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGAAGAAGACCCATATACTTTTGCTGAGATTGATGACAGTGAATATGACATGATATTGGCCAATCTGAGTATAA  1702

Query 1703  AGAAAAAAACTGGGAGTCGGTCTTTCATTATAAATAGACCTCCTGCCCCCACACCCCGACCCACAAGTATACCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGAAAAAAACTGGGAGTCGGTCTTTCATTATAAATAGACCTCCTGCCCCCACACCCCGACCCACAAGTATACCT  1776

Query 1777  CCAAAAGAGGAAACTACACCTTACATAGCTCAAGTGTTTCAACAAAAGACAGCCAGAAGACAATCTGATGATGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCAAAAGAGGAAACTACACCTTACATAGCTCAAGTGTTTCAACAAAAGACAGCCAGAAGACAATCTGATGATGA  1850

Query 1851  CAAGTTCCGTGGTCTTCCTAAGAAACAAGACAGAGCTCGGATAGAGAGTCCAGCCTTTTCTACTCTCAGGGGCT  1924
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAAGTTCTGTGGTCTTCCTAAGAAACAAGACAGAGCTCGGATAGAGAGTCCAGCCTTTTCTACTCTCAGGGGCT  1924

Query 1925  GTCTAACTGATGGTCAGGAAGAACTCATCCTCCTGCAGGAGAAAGTAAAGAATGGGAAAATGTCTATGGATGAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTCTAACTGATGGTCAGGAAGAACTCATCCTCCTGCAGGAGAAAGTAAAGAATGGGAAAATGTCTATGGATGAA  1998

Query 1999  GCTCTGGAGAAATTTAAACACTGGCAGATGGGAAAAAGTGGCCTGGAAATGATTCAGCAGGAGAAATTACGACA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCTCTGGAGAAATTTAAACACTGGCAGATGGGAAAAAGTGGCCTGGAAATGATTCAGCAGGAGAAATTACGACA  2072

Query 2073  ACTACGAGACTGCATTATTGGGAAAAGGCCAGAAGAAGAAAATGTCTATAATAAACTCACCATTGTGCACCATC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ACTACGAGACTGCATTATTGGGAAAAGGCCAGAAGAAGAAAATGTCTATAATAAACTCACCATTGTGCACCATC  2146

Query 2147  CAGGTGGTAAGGAAACTGCCCACAATGAAAATAAGTTTTATAATGTACACTTCAGCAATAAGCTTCCTGCTCGA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAGGTGGTAAGGAAACTGCCCACAATGAAAATAAGTTTTATAATGTACACTTCAGCAATAAGCTTCCTGCTCGA  2220

Query 2221  CCCCAAGTTGAAAAGGAATTTGGTTTCTGTTGCAAGAAAGATCAT  2265
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCCCAAGTTGAAAAGGAATTTGGTTTCTGTTGCAAGAAAGATCAT  2265