Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08479
- Subject:
- NM_001319837.1
- Aligned Length:
- 3720
- Identities:
- 3701
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC 74
Query 75 TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC 148
Query 149 TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT 222
Query 223 GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC 296
Query 297 AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG 370
Query 371 CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG 444
Query 445 AACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGA 518
Query 519 GTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAG 592
Query 593 TGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACA 666
Query 667 CGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCCTGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCCTGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACAT 740
Query 741 GGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGA 814
Query 815 GCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTG 888
Query 889 AAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCA 962
Query 963 GGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGG 1036
Query 1037 CTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTG 1110
Query 1111 TACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTT 1184
Query 1185 CCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCA 1258
Query 1259 TCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGG 1332
Query 1333 CTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGA 1406
Query 1407 CCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAG 1480
Query 1481 GCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCC 1554
Query 1555 AAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAG 1628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAA--------------- 1613
Query 1629 GGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 GGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCC 1687
Query 1703 AGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 AGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGC 1761
Query 1777 GCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762 GCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCT 1835
Query 1851 GCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 GCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACC 1909
Query 1925 AGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 AGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAG 1983
Query 1999 ATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1984 ATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAG 2057
Query 2073 CTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2058 CTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAA 2131
Query 2147 TCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 TCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGG 2205
Query 2221 TGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2206 TGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCA 2279
Query 2295 CAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 CAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCAGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCG 2353
Query 2369 GGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 GGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAG 2427
Query 2443 TCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428 TCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGA 2501
Query 2517 CGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 CGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCA 2575
Query 2591 TCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 TCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTG 2649
Query 2665 CTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGAC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2650 CTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGAC 2723
Query 2739 CAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 CAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCC 2797
Query 2813 TGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798 TGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAG 2871
Query 2887 CCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 CCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGT 2945
Query 2961 CTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2946 CTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCA 3019
Query 3035 ACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3020 ACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAG 3093
Query 3109 GGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAA 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3094 GGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAA 3167
Query 3183 GATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAATGGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3168 GATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAACGGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCA 3241
Query 3257 TCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGAC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3242 TCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGAC 3315
Query 3331 GGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGACAGCCACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCA 3404
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3316 GGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGATAGCCACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCA 3389
Query 3405 GTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCGGGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCG 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3390 GTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCGGGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCG 3463
Query 3479 CAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACGTCTGGGTGCGCAGC 3552
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 3464 CAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACATCTGGGTGCGCAGC 3537
Query 3553 CGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCG 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3538 CGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCG 3611
Query 3627 CAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCT 3700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3612 CAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCT 3685
Query 3701 GGCAGGTGCCCTTGATGCTA 3720
||||||||||||||||||||
Sbjct 3686 GGCAGGTGCCCTTGATGCTA 3705