Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08479
• Subject: XM_005245929.3
• Aligned Length: 1240
• Identities: 1007
• Gaps: 188

Alignment

Query    1  MASSNPPPQPAIGDQLVPGVPGPSSEAEDDPGEAFEFDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERDTDPPLIHLDSIPVT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  DPDPAAAPPGTGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAER  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  NLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVEVEPAKHRVSFQPKMTQLMKAAKSGTKDGLEKT  222
             .|.....  |.......|||..|......     .|..|....|..|.|...|..........          
Sbjct    1  -MLPSSSW--GKRKLRGRLGWVRSDARGVM-----WARQEGLHHPHPHAVIRCPSSSSSSVSCS----------  56

Query  223  RMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESL  296
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   57  -----------------GDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESL  113

Query  297  KRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDV  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  KRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDV  187

Query  371  YSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDR  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  YSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDR  261

Query  445  LSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKS  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  LSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKS  335

Query  519  KERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSG  592
            ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  KERRVFLLNDMLVCANINFK-----GQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSG  404

Query  593  AKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEE  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  AKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEE  478

Query  667  IHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFW  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  IHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFW  552

Query  741  CPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVK  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  CPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVK  626

Query  815  SFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPV  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  SFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPV  700

Query  889  LCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQ  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  LCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQ  774

Query  963  PQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQ  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  PQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQ  848

Query 1037  GLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPD  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  GLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPD  922

Query 1111  GQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRS  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  923  GQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDIWVRS  996

Query 1185  RPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  RPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML  1052