Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08479
• Subject: XM_017001620.1
• Aligned Length: 3741
• Identities: 3068
• Gaps: 666

Alignment

Query    1  ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC  74

Query   75  TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC  148

Query  149  TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT  222

Query  223  GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC  296

Query  297  AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG  370

Query  371  CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCC---GGGGCAGAG  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
Sbjct  371  CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGCAGGGGCAGAG  444

Query  442  AGGAACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGAACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAG  518

Query  516  TGAGTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACC  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACC  592

Query  590  GAGTGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGTGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAG  666

Query  664  ACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCCTGCACAGGAAGGACGTCCTC---------GGTGACTCGGA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||
Sbjct  667  ACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCCTGCACAGGAAGGACGTCCTCGACTTTCCAGGTGACTCGGA  740

Query  729  GGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGC  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGC  814

Query  803  CAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTAC  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTAC  888

Query  877  GTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGC  962

Query  951  CCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGT  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGT  1036

Query 1025  CCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATG  1110

Query 1099  GTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCAC  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCAC  1184

Query 1173  CAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGA  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGA  1258

Query 1247  TGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGC  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGC  1332

Query 1321  CATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAA  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAA  1406

Query 1395  GCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGC  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGC  1480

Query 1469  TGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAG  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAG  1554

Query 1543  CTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCC  1616
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1555  CTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAA---  1625

Query 1617  TGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACA  1690
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  ------------GGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACA  1687

Query 1691  CGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATC  1764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688  CGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATC  1761

Query 1765  CAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCT  1838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762  CAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCT  1835

Query 1839  CTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGC  1912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836  CTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGC  1909

Query 1913  ACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTG  1986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910  ACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTG  1983

Query 1987  AAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGG  2060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1984  AAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGG  2057

Query 2061  CCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTAC  2134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2058  CCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTAC  2131

Query 2135  ATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAA  2208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132  ATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAA  2205

Query 2209  GCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGG  2282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2206  GCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGG  2279

Query 2283  GGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCT  2356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280  GGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCAGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCT  2353

Query 2357  ACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCC  2430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354  ACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCC  2427

Query 2431  CGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGC  2504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428  CGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGC  2501

Query 2505  GGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCC  2578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502  GGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCC  2575

Query 2579  AGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGT  2652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576  AGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGT  2649

Query 2653  CTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGC  2726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2650  CTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGC  2723

Query 2727  TTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGC  2800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724  TTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGC  2797

Query 2801  CTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCC  2874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798  CTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCC  2871

Query 2875  ACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGC  2948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872  ACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGC  2945

Query 2949  GGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATC  3022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2946  GGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATC  3019

Query 3023  TGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAG------AAGCACTTGTGTGTCACC  3090
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|||      ||..|..|||   ||.||
Sbjct 3020  TGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCA-GACAGGTCATTAATAAAATGT---TCTCC  3089

Query 3091  ---AGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCCCGTGCC  3161
               ||||                                                                   
Sbjct 3090  AAGAGCC-------------------------------------------------------------------  3096

Query 3162  TCGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAATGGGCACTGTGGGCCTGTGGCCT  3235
                                                                                      
Sbjct 3097  --------------------------------------------------------------------------  3096

Query 3236  TCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGG  3309
                                                                                      
Sbjct 3097  --------------------------------------------------------------------------  3096

Query 3310  GCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGACAGCCACGTGGGCCGAGAGCTGACCCG  3383
                                                                                      
Sbjct 3097  --------------------------------------------------------------------------  3096

Query 3384  CAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCGGGCCCGCTGCTCTCCATGCGGG  3457
                                                                                      
Sbjct 3097  --------------------------------------------------------------------------  3096

Query 3458  AGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCCGACGAC  3531
                                                                                      
Sbjct 3097  --------------------------------------------------------------------------  3096

Query 3532  CCCGACGTCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGCCATCAT  3605
                                                                                      
Sbjct 3097  --------------------------------------------------------------------------  3096

Query 3606  CTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGA  3679
                                                                                      
Sbjct 3097  --------------------------------------------------------------------------  3096

Query 3680  CGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA  3720
                                                     
Sbjct 3097  -----------------------------------------  3096