Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08479
- Subject:
- XM_017001622.1
- Aligned Length:
- 3837
- Identities:
- 3701
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC 74
Query 75 TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC 148
Query 149 TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT 222
Query 223 GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC 296
Query 297 AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG 370
Query 371 CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG 444
Query 445 AACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGA 518
Query 519 GTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAG 592
Query 593 TGTCCTTCCAGCCC------------------------------------------------------------ 606
||||||||||||||
Sbjct 593 TGTCCTTCCAGCCCAAGCTTTCTCCAGACCTGACTAGGCTAAAGGAGAGATACGCCAGGACTAAGAGAGACATC 666
Query 607 ---------------------------------------------------------AAGATGACCCAGCTCAT 623
|||||||||||||||||
Sbjct 667 TTGGCTTTGAGAGTTGGGGGGAGAGACATGCAGGAGCTGAAGCACAAGTACGATTGTAAGATGACCCAGCTCAT 740
Query 624 GAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCC 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCC 814
Query 698 TGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATC 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATC 888
Query 772 AAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCT 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCT 962
Query 846 GGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCC 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCC 1036
Query 920 TGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTG 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTG 1110
Query 994 CACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGA 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGA 1184
Query 1068 CCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTG 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTG 1258
Query 1142 CCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGC 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGC 1332
Query 1216 AGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCT 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCT 1406
Query 1290 TCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGG 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGG 1480
Query 1364 AGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAG 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAG 1554
Query 1438 AGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTT 1511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTT 1628
Query 1512 GACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACA 1585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACA 1702
Query 1586 TGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCC 1659
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAA---------------GGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCC 1761
Query 1660 CTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGG 1733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762 CTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGG 1835
Query 1734 TGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTC 1807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 TGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTC 1909
Query 1808 AGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTG 1881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 AGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTG 1983
Query 1882 GAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTG 1955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1984 GAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTG 2057
Query 1956 GTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGC 2029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2058 GTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGC 2131
Query 2030 TCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCC 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 TCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCC 2205
Query 2104 CTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTG 2177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2206 CTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTG 2279
Query 2178 GCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCT 2251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 GCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCT 2353
Query 2252 TCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTC 2325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 TCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTC 2427
Query 2326 TCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGT 2399
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428 TCAGCAGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGT 2501
Query 2400 GGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCA 2473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 GGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCA 2575
Query 2474 TGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCC 2547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 TGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCC 2649
Query 2548 ACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCAC 2621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2650 ACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCAC 2723
Query 2622 CCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGC 2695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 CCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGC 2797
Query 2696 TCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGC 2769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798 TCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGC 2871
Query 2770 CCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAG 2843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 CCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAG 2945
Query 2844 CTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACG 2917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2946 CTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACG 3019
Query 2918 AGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATC 2991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3020 AGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATC 3093
Query 2992 CGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCC 3065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3094 CGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCC 3167
Query 3066 AGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTG 3139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3168 AGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTG 3241
Query 3140 TCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAAT 3213
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 3242 TCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAAC 3315
Query 3214 GGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCA 3287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3316 GGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCA 3389
Query 3288 GGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGACAGCC 3361
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 3390 GGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGATAGCC 3463
Query 3362 ACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCG 3435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 ACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCG 3537
Query 3436 GGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTC 3509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3538 GGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTC 3611
Query 3510 CATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACGTCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGG 3583
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3612 CATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACATCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGG 3685
Query 3584 AGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGG 3657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3686 AGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGG 3759
Query 3658 AGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA 3720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3760 AGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA 3822