Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08479
• Subject: XM_024448059.1
• Aligned Length: 3732
• Identities: 3716
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC  74

Query   75  TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC  148

Query  149  TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT  222

Query  223  GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC  296

Query  297  AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG  370

Query  371  CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCC---GGGGCAGAG  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
Sbjct  371  CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGCAGGGGCAGAG  444

Query  442  AGGAACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGAACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAG  518

Query  516  TGAGTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACC  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACC  592

Query  590  GAGTGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGTGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAG  666

Query  664  ACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCCTGCACAGGAAGGACGTCCTC---------GGTGACTCGGA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||
Sbjct  667  ACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCCTGCACAGGAAGGACGTCCTCGACTTTCCAGGTGACTCGGA  740

Query  729  GGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGC  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGC  814

Query  803  CAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTAC  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTAC  888

Query  877  GTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGC  962

Query  951  CCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGT  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGT  1036

Query 1025  CCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATG  1110

Query 1099  GTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCAC  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCAC  1184

Query 1173  CAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGA  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGA  1258

Query 1247  TGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGC  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGC  1332

Query 1321  CATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAA  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAA  1406

Query 1395  GCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGC  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGC  1480

Query 1469  TGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAG  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAG  1554

Query 1543  CTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCC  1616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCC  1628

Query 1617  TGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACA  1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACA  1702

Query 1691  CGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATC  1764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATC  1776

Query 1765  CAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCT  1838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCT  1850

Query 1839  CTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGC  1912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGC  1924

Query 1913  ACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTG  1986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTG  1998

Query 1987  AAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGG  2060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGG  2072

Query 2061  CCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTAC  2134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTAC  2146

Query 2135  ATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAA  2208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAA  2220

Query 2209  GCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGG  2282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGG  2294

Query 2283  GGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCT  2356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCAGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCT  2368

Query 2357  ACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCC  2430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCC  2442

Query 2431  CGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGC  2504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGC  2516

Query 2505  GGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCC  2578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCC  2590

Query 2579  AGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGT  2652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGT  2664

Query 2653  CTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGC  2726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGC  2738

Query 2727  TTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGC  2800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGC  2812

Query 2801  CTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCC  2874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCC  2886

Query 2875  ACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGC  2948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  ACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGC  2960

Query 2949  GGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATC  3022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATC  3034

Query 3023  TGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTC  3096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTC  3108

Query 3097  CTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGA  3170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGA  3182

Query 3171  AGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAATGGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTG  3244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAACGGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTG  3256

Query 3245  TGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAG  3318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  TGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAG  3330

Query 3319  GACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGACAGCCACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGG  3392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGATAGCCACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGG  3404

Query 3393  CATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCGGGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGC  3466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  CATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCGGGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGC  3478

Query 3467  CTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACGTC  3540
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 3479  CTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACATC  3552

Query 3541  TGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGG  3614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  TGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGG  3626

Query 3615  GCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCA  3688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  GCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCA  3700

Query 3689  CCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA  3720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701  CCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA  3732