Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08528
- Subject:
- NM_177190.5
- Aligned Length:
- 1531
- Identities:
- 1306
- Gaps:
- 8
Alignment
Query 1 ATGTCTGAAAACCTTGACAAGTCCAATGTAAATGAAGCAGGAAAATCAAAATCCAATGATTCTGAGGAAGGCCT 74
||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||.|..||.|..|...||..||.|||.|||||||
Sbjct 1 ATGTCTGAAAACCTTGACAAGTCCCATGTAGACGAAGCAGGAGAGGCAGAGGCGGCTGCCTCCGAGCAAGGCCT 74
Query 75 CGAAGATGCTGTGGAAGGTG--CTGATGAAGCCTTACAAAAAGCAATAAAGTCAGACTCCTCCAGCCCCCAAAG 146
.||||.||||.|||| ||| ||||||||.|||||||.|||..|.|.|||||.|||||..|.||..|||||||
Sbjct 75 GGAAGGTGCTCTGGA--GTGCTCTGATGAAACCTTACAGAAAAAAGTGAAGTCGGACTCACCTAGTTCCCAAAG 146
Query 147 AGTGCAGAGACCTCACTCTAGTCCTCCTCGCTTTGTGACAGTAGAAGAACTTCTAGAGACAGCGAGAGGCGTCA 220
||||...|||||||||||.|||||..||||..||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|.|||.||||
Sbjct 147 AGTGGGAAGACCTCACTCCAGTCCCGCTCGGCTTGTCACTGTAGAGGAACTTCTAGAAACAGCAAAAGGAGTCA 220
Query 221 CCAACATGGCTCTAGCCCATGAAATTGTAGTAAATGGAGACTTTCAGATTAAACCAGTTGAATTACCAGAAAAC 294
|||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||..|.|||||||||.|.|||..|
Sbjct 221 CCAACATGGCTCTGGCCCATGAAATTGTAGTAACTGGAGACTTCCGGATTAACGCTGTTGAATTAGCCGAAGGC 294
Query 295 AGCTTGAAGAAGAGAGTAAAGGAGATTGTACATAAAGCGTTTTGGGATTGCTTGAGTGTGCAGCTAAGTGAAGA 368
||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 295 AGCTTGGAGAAGAGAGTAAAAGAGATTGTACATAAAGCATTCTGGGATTGCTTGAGTGTCCAGTTAAGTGAAGA 368
Query 369 TCCCCCAGCATATGACCATGCTATCAAACTTGTAGGAGAAATCAAAGAGACTCTCTTATCTTTCTTGCTGCCTG 442
.||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 369 GCCCCCAACATATGACCATGCCATCAAACTTGTAGGAGAGATCAAAGAGACTCTGTTATCTTTCTTGCTGCCTG 442
Query 443 GTCATACTAGACTGAGAAACCAGATAACAGAAGTCTTGGATCTGGATCTGATAAAGCAGGAAGCAGAGAATGGG 516
||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 443 GTCACACTAGACTAAGAAACCAGATAACGGAAGTCTTGGATCTGGAGCTGATAAAACAAGAAGCAGAGAATGGG 516
Query 517 GCGCTAGACATTTCCAGGCTGGCAGAATTCATTATTGGCATGATGGGGACACTGTGTGCACCTGCTCGAGATGA 590
||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GCCCTAGACATTTCCAAGCTGGCAGAGTTCATTATTGGCATGATGGGGATATTGTGTGCACCTGCTCGAGATGA 590
Query 591 GGAAGTTAAGAAACTAAAGGACATTAAGGAAATAGTGCCCCTTTTCAGAGAAATTTTTTCTGTGTTGGACCTAA 664
|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 591 GGAAGTTAAAAAACTAAAGGGCATTAAGGAAATAGTGCCTCTCTTCAGGGCAATATTTTCTGTGTTGGACCTAA 664
Query 665 TGAAAGTGGACATGGCCAACTTTGCTATCAGTAGCATCAGGCCTCATCTCATGCAGCAGTCAGTTGAATACGAA 738
|||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.
Sbjct 665 TGAAAGTTGACATGGCCAACTTCGCCATCAGTAGCATTAGGCCGCACCTCATGCAGCAGTCAGTCGAGTATGAG 738
Query 739 AGGAAGAAGTTTCAAGAGATTTTGGAGAGGCAACCAAATTCCCTGGACTTTGTCACCCAGTGGCTGGAAGAAGC 812
||||.|||||||||.||..|..||||||||||.||.||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.||
Sbjct 739 AGGAGGAAGTTTCAGGAAGTGCTGGAGAGGCAGCCGAACTCCCTGGACTTTGCCACACAGTGGCTGGAAGAGGC 812
Query 813 CTCAGAGGACCTTATGACTCAGAAGTATAAACACGCCCTGCCAGTGGGGGGAATGGCTGCTGGCTCTGGGGACA 886
|.||.|.||||||.|||.|||||||||.|||||.||||||||||..||||||...|||||||||||||||| |
Sbjct 813 CACAAATGACCTTTTGAGTCAGAAGTACAAACATGCCCTGCCAGCTGGGGGAGGCGCTGCTGGCTCTGGGG--A 884
Query 887 TGCCC--AGGCTGAGCCCTGTTGCTGTCCAGAATTACGCTTACCTGAAGCTTCTGAAGTGGGACCACCTCCAGA 958
||||| ...||||.|||||||.||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 885 TGCCCCACTCCTGACCCCTGTTTCTGTCCAGAATTTCGCCTACCTGAAGCTTCTGAAATGGGACCACTTCCAGA 958
Query 959 GGCCGTTCCCCGAAACAGTTTTAATGGACCAGTCTCGCTTCCACGAGCTCCAGTTGCAGCTGGAACAACTGACC 1032
|.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||.|||.||
Sbjct 959 GACCTTTCCCTGAGACAGTTTTGATGGACCAGTCTCGTTTCCAAGAGCTCCAGCTCCAGCTGGAGCAGCTGGCC 1032
Query 1033 ATCCTGGGGGCTGTGTTGCTGGTCACCTTCAGCATGGCAGCGCCAGGAATTTCCAGCCAGGCCGACTTTGCTGA 1106
.|||||||.||.|||.||||||||||.|||||.|..||.||.||.||||||||..|.||.|||||||||||.||
Sbjct 1033 GTCCTGGGAGCCGTGCTGCTGGTCACGTTCAGTACCGCTGCACCGGGAATTTCTGGGCATGCCGACTTTGCCGA 1106
Query 1107 GAAACTCAAGATGATTGTGAAGATTTTGCTAACAGATATGCACCTGCCCTCCTTCCATCTGAAGGACGTCCTCA 1180
|||.|||||||||||.|||||||.|.|||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.||||||.|||..
Sbjct 1107 GAAGCTCAAGATGATGGTGAAGACTCTGCTAACGGACATGCATCTGCCTTCCTTCCATCTGGAGGACGCCCTGG 1180
Query 1181 CTACCATCGGGGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGGTCCTCTCCCTTCACCACG 1254
||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.||...
Sbjct 1181 CTTCCATTGGCGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGCTCCTCCCCATTCTCCGTT 1254
Query 1255 GACAAGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATCCAGGCCGTGGCCAGTCCCGATGACCCCATTCGCAGGATCATGGA 1328
|..||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 GCTAAGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATTCAGGCCCTCGCCAGTCCCGAGGACCCCATTCGCAGGATCATGGA 1328
Query 1329 ATCTCGAATCCTGACCTTCTTAGAAACCTACCTTGCCTCGGGTCATCAGAAGCCATTGCCCACAGTCCCTGGGG 1402
.||.||.||..|.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||..||||.||.||.|||||||
Sbjct 1329 GTCCCGCATTTTCACCTTCTTGGAGACATACCTTGCCTCTGGTCATCAGAAGCCCCTGCCTACTGTGCCTGGGG 1402
Query 1403 GACTCAGTCCAGTTCAGAGAGAGCTGGAGGAAGTTGCTATTAAATTTGCTCGCCTGGTCAACTATAACAAGATG 1476
||.|..||||..||||||.|||||||||.|||||||||.|.|||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 GATTGGGTCCCATTCAGAAAGAGCTGGAAGAAGTTGCTGTGAAATTTGTGCGCCTGGTCAACTATAACAAGATG 1476
Query 1477 GTCTTCTGTCCATACTACGATGCAATCCTGAGTAAGATCCTCGTCCGATCC 1527
||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||.||||.|||
Sbjct 1477 GTGTTCTGTCCCTACTACGATGCAATCCTTAGTAAGCTCCTCCTCCGCTCC 1527