Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08528
• Subject: XM_011520204.2
• Aligned Length: 1542
• Identities: 1524
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGTCTGAAAACCTTGACAAGTCCAATGTAAATGAAGCAGGAAAATCAAAATCCAATGATTCTGAGGAAGGCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGAAAACCTTGACAAGTCCAATGTAAATGAAGCAGGAAAATCAAAATCCAATGATTCTGAGGAAGGCCT  74

Query   75  CGAAGATGCTGTGGAAGGTGCTGATGAAGCCTTACAAAAAGCAATAAAGTCAGACTCCTCCAGCCCCCAAAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAAGATGCTGTGGAAGGTGCTGATGAAGCCTTACAAAAAGCAATAAAGTCAGACTCCTCCAGCCCCCAAAGAG  148

Query  149  TGCAGAGACCTCACTCTAGTCCTCCTCGCTTTGTGACAGTAGAAGAACTTCTAGAGACAGCGAGAGGCGTCACC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TGCAGAGACCTCACTCTAGTCCTCCTCGCTTTGTGACAGTAGAAGAACTTCTAGAGACAGCGAGAGGTGTCACC  222

Query  223  AACATGGCTCTAGCCCATGAAATTGTAGTAAATGGAGACTTTCAGATTAAACCAGTTGAATTACCAGAAAACAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACATGGCTCTAGCCCATGAAATTGTAGTAAATGGAGACTTTCAGATTAAACCAGTTGAATTACCAGAAAACAG  296

Query  297  CTTGAAGAAGAGAGTAAAGGAGATTGTACATAAAGCGTTTTGGGATTGCTTGAGTGTGCAGCTAAGTGAAGATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTGAAGAAGAGAGTAAAGGAGATTGTACATAAAGCGTTTTGGGATTGCTTGAGTGTGCAGCTAAGTGAAGATC  370

Query  371  CCCCAGCATATGACCATGCTATCAAACTTGTAGGAGAAATCAAAGAGACTCTCTTATCTTTCTTGCTGCCTGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCAGCATATGACCATGCTATCAAACTTGTAGGAGAAATCAAAGAGACTCTCTTATCTTTCTTGCTGCCTGGT  444

Query  445  CATACTAGACTGAGAAACCAGATAACAGAAGTCTTGGATCTGGATCTGATAAAGCAGGAAGCAGAGAATGGGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATACTAGACTGAGAAACCAGATAACAGAAGTCTTGGATCTGGATCTGATAAAGCAGGAAGCAGAGAATGGGGC  518

Query  519  GCTAGACATTTCCAGGCTGGCAGAATTCATTATTGGCATGATGGGGACACTGTGTGCACCTGCTCGAGATGAGG  592
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTAGACATTTCCAAGCTGGCAGAATTCATTATTGGCATGATGGGGACACTGTGTGCACCTGCTCGAGATGAGG  592

Query  593  AAGTTAAGAAACTAAAGGACATTAAGGAAATAGTGCCCCTTTTCAGAGAAATTTTTTCTGTGTTGGACCTAATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGTTAAGAAACTAAAGGACATTAAGGAAATAGTGCCCCTTTTCAGAGAAATTTTTTCTGTGTTGGACCTAATG  666

Query  667  AAAGTGGACATGGCCAACTTTGCTATCAGTAGCATCAGGCCTCATCTCATGCAGCAGTCAGTTGAATACGAAAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTGGACATGGCCAACTTTGCTATCAGTAGCATCAGGCCTCATCTCATGCAGCAGTCAGTTGAATACGAAAG  740

Query  741  GAAGAAGTTTCAAGAGATTTTGGAGAGGCAACCAA---------------ATTCCCTGGACTTTGTCACCCAGT  799
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGAAGTTTCAAGAGATTTTGGAGAGGCAACCAACTTTGTTTTTCACAGATTCCCTGGACTTTGTCACCCAGT  814

Query  800  GGCTGGAAGAAGCCTCAGAGGACCTTATGACTCAGAAGTATAAACACGCCCTGCCAGTGGGGGGAATGGCTGCT  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTGGAAGAAGCCTCAGAGGACCTTATGACTCAGAAGTATAAACACGCCCTGCCAGTGGGGGGAATGGCTGCT  888

Query  874  GGCTCTGGGGACATGCCCAGGCTGAGCCCTGTTGCTGTCCAGAATTACGCTTACCTGAAGCTTCTGAAGTGGGA  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTCTGGGGACATGCCCAGGCTGAGCCCTGTTGCTGTCCAGAATTACGCTTACCTGAAGCTTCTGAAGTGGGA  962

Query  948  CCACCTCCAGAGGCCGTTCCCCGAAACAGTTTTAATGGACCAGTCTCGCTTCCACGAGCTCCAGTTGCAGCTGG  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACCTCCAGAGGCCGTTCCCCGAAACAGTTTTAATGGACCAGTCTCGCTTCCACGAGCTCCAGTTGCAGCTGG  1036

Query 1022  AACAACTGACCATCCTGGGGGCTGTGTTGCTGGTCACCTTCAGCATGGCAGCGCCAGGAATTTCCAGCCAGGCC  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AACAACTGACCATCCTGGGGGCTGTGTTGCTGGTCACCTTCAGCATGGCAGCGCCAGGAATTTCCAGCCAGGCC  1110

Query 1096  GACTTTGCTGAGAAACTCAAGATGATTGTGAAGATTTTGCTAACAGATATGCACCTGCCCTCCTTCCATCTGAA  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACTTTGCTGAGAAACTCAAGATGATTGTGAAGATTTTGCTAACAGATATGCACCTGCCCTCCTTCCATCTGAA  1184

Query 1170  GGACGTCCTCACTACCATCGGGGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGGTCCTCTC  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGACGTCCTCACTACCATCGGGGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGGTCCTCTC  1258

Query 1244  CCTTCACCACGGACAAGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATCCAGGCCGTGGCCAGTCCCGATGACCCCATTCGC  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTTCACCACGGACAAGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATCCAGGCCGTGGCCAGTCCCGATGACCCCATTCGC  1332

Query 1318  AGGATCATGGAATCTCGAATCCTGACCTTCTTAGAAACCTACCTTGCCTCGGGTCATCAGAAGCCATTGCCCAC  1391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGATCATGGAATCTCGAATCCTGACCTTCTTAGAAACCTACCTTGCCTCGGGTCATCAGAAGCCATTGCCCAC  1406

Query 1392  AGTCCCTGGGGGACTCAGTCCAGTTCAGAGAGAGCTGGAGGAAGTTGCTATTAAATTTGCTCGCCTGGTCAACT  1465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGTCCCTGGGGGACTCAGTCCAGTTCAGAGAGAGCTGGAGGAAGTTGCTATTAAATTTGCTCGCCTGGTCAACT  1480

Query 1466  ATAACAAGATGGTCTTCTGTCCATACTACGATGCAATCCTGAGTAAGATCCTCGTCCGATCC  1527
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATAACAAGATGGTCTTCTGTCCCTACTACGATGCAATCCTGAGTAAGATCCTCGTCCGATCC  1542