Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08528
- Subject:
- XM_011520206.2
- Aligned Length:
- 1542
- Identities:
- 1524
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGTCTGAAAACCTTGACAAGTCCAATGTAAATGAAGCAGGAAAATCAAAATCCAATGATTCTGAGGAAGGCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGAAAACCTTGACAAGTCCAATGTAAATGAAGCAGGAAAATCAAAATCCAATGATTCTGAGGAAGGCCT 74
Query 75 CGAAGATGCTGTGGAAGGTGCTGATGAAGCCTTACAAAAAGCAATAAAGTCAGACTCCTCCAGCCCCCAAAGAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGAAGATGCTGTGGAAGGTGCTGATGAAGCCTTACAAAAAGCAATAAAGTCAGACTCCTCCAGCCCCCAAAGAG 148
Query 149 TGCAGAGACCTCACTCTAGTCCTCCTCGCTTTGTGACAGTAGAAGAACTTCTAGAGACAGCGAGAGGCGTCACC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 TGCAGAGACCTCACTCTAGTCCTCCTCGCTTTGTGACAGTAGAAGAACTTCTAGAGACAGCGAGAGGTGTCACC 222
Query 223 AACATGGCTCTAGCCCATGAAATTGTAGTAAATGGAGACTTTCAGATTAAACCAGTTGAATTACCAGAAAACAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACATGGCTCTAGCCCATGAAATTGTAGTAAATGGAGACTTTCAGATTAAACCAGTTGAATTACCAGAAAACAG 296
Query 297 CTTGAAGAAGAGAGTAAAGGAGATTGTACATAAAGCGTTTTGGGATTGCTTGAGTGTGCAGCTAAGTGAAGATC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTGAAGAAGAGAGTAAAGGAGATTGTACATAAAGCGTTTTGGGATTGCTTGAGTGTGCAGCTAAGTGAAGATC 370
Query 371 CCCCAGCATATGACCATGCTATCAAACTTGTAGGAGAAATCAAAGAGACTCTCTTATCTTTCTTGCTGCCTGGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCCAGCATATGACCATGCTATCAAACTTGTAGGAGAAATCAAAGAGACTCTCTTATCTTTCTTGCTGCCTGGT 444
Query 445 CATACTAGACTGAGAAACCAGATAACAGAAGTCTTGGATCTGGATCTGATAAAGCAGGAAGCAGAGAATGGGGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATACTAGACTGAGAAACCAGATAACAGAAGTCTTGGATCTGGATCTGATAAAGCAGGAAGCAGAGAATGGGGC 518
Query 519 GCTAGACATTTCCAGGCTGGCAGAATTCATTATTGGCATGATGGGGACACTGTGTGCACCTGCTCGAGATGAGG 592
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTAGACATTTCCAAGCTGGCAGAATTCATTATTGGCATGATGGGGACACTGTGTGCACCTGCTCGAGATGAGG 592
Query 593 AAGTTAAGAAACTAAAGGACATTAAGGAAATAGTGCCCCTTTTCAGAGAAATTTTTTCTGTGTTGGACCTAATG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGTTAAGAAACTAAAGGACATTAAGGAAATAGTGCCCCTTTTCAGAGAAATTTTTTCTGTGTTGGACCTAATG 666
Query 667 AAAGTGGACATGGCCAACTTTGCTATCAGTAGCATCAGGCCTCATCTCATGCAGCAGTCAGTTGAATACGAAAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAGTGGACATGGCCAACTTTGCTATCAGTAGCATCAGGCCTCATCTCATGCAGCAGTCAGTTGAATACGAAAG 740
Query 741 GAAGAAGTTTCAAGAGATTTTGGAGAGGCAACCAA---------------ATTCCCTGGACTTTGTCACCCAGT 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGAAGTTTCAAGAGATTTTGGAGAGGCAACCAACTTTGTTTTTCACAGATTCCCTGGACTTTGTCACCCAGT 814
Query 800 GGCTGGAAGAAGCCTCAGAGGACCTTATGACTCAGAAGTATAAACACGCCCTGCCAGTGGGGGGAATGGCTGCT 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGCTGGAAGAAGCCTCAGAGGACCTTATGACTCAGAAGTATAAACACGCCCTGCCAGTGGGGGGAATGGCTGCT 888
Query 874 GGCTCTGGGGACATGCCCAGGCTGAGCCCTGTTGCTGTCCAGAATTACGCTTACCTGAAGCTTCTGAAGTGGGA 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCTCTGGGGACATGCCCAGGCTGAGCCCTGTTGCTGTCCAGAATTACGCTTACCTGAAGCTTCTGAAGTGGGA 962
Query 948 CCACCTCCAGAGGCCGTTCCCCGAAACAGTTTTAATGGACCAGTCTCGCTTCCACGAGCTCCAGTTGCAGCTGG 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCACCTCCAGAGGCCGTTCCCCGAAACAGTTTTAATGGACCAGTCTCGCTTCCACGAGCTCCAGTTGCAGCTGG 1036
Query 1022 AACAACTGACCATCCTGGGGGCTGTGTTGCTGGTCACCTTCAGCATGGCAGCGCCAGGAATTTCCAGCCAGGCC 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AACAACTGACCATCCTGGGGGCTGTGTTGCTGGTCACCTTCAGCATGGCAGCGCCAGGAATTTCCAGCCAGGCC 1110
Query 1096 GACTTTGCTGAGAAACTCAAGATGATTGTGAAGATTTTGCTAACAGATATGCACCTGCCCTCCTTCCATCTGAA 1169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACTTTGCTGAGAAACTCAAGATGATTGTGAAGATTTTGCTAACAGATATGCACCTGCCCTCCTTCCATCTGAA 1184
Query 1170 GGACGTCCTCACTACCATCGGGGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGGTCCTCTC 1243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGACGTCCTCACTACCATCGGGGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGGTCCTCTC 1258
Query 1244 CCTTCACCACGGACAAGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATCCAGGCCGTGGCCAGTCCCGATGACCCCATTCGC 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCTTCACCACGGACAAGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATCCAGGCCGTGGCCAGTCCCGATGACCCCATTCGC 1332
Query 1318 AGGATCATGGAATCTCGAATCCTGACCTTCTTAGAAACCTACCTTGCCTCGGGTCATCAGAAGCCATTGCCCAC 1391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGGATCATGGAATCTCGAATCCTGACCTTCTTAGAAACCTACCTTGCCTCGGGTCATCAGAAGCCATTGCCCAC 1406
Query 1392 AGTCCCTGGGGGACTCAGTCCAGTTCAGAGAGAGCTGGAGGAAGTTGCTATTAAATTTGCTCGCCTGGTCAACT 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGTCCCTGGGGGACTCAGTCCAGTTCAGAGAGAGCTGGAGGAAGTTGCTATTAAATTTGCTCGCCTGGTCAACT 1480
Query 1466 ATAACAAGATGGTCTTCTGTCCATACTACGATGCAATCCTGAGTAAGATCCTCGTCCGATCC 1527
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATAACAAGATGGTCTTCTGTCCCTACTACGATGCAATCCTGAGTAAGATCCTCGTCCGATCC 1542