Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08528
• Subject: XM_017017990.1
• Aligned Length: 1527
• Identities: 1524
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCTGAAAACCTTGACAAGTCCAATGTAAATGAAGCAGGAAAATCAAAATCCAATGATTCTGAGGAAGGCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGAAAACCTTGACAAGTCCAATGTAAATGAAGCAGGAAAATCAAAATCCAATGATTCTGAGGAAGGCCT  74

Query   75  CGAAGATGCTGTGGAAGGTGCTGATGAAGCCTTACAAAAAGCAATAAAGTCAGACTCCTCCAGCCCCCAAAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAAGATGCTGTGGAAGGTGCTGATGAAGCCTTACAAAAAGCAATAAAGTCAGACTCCTCCAGCCCCCAAAGAG  148

Query  149  TGCAGAGACCTCACTCTAGTCCTCCTCGCTTTGTGACAGTAGAAGAACTTCTAGAGACAGCGAGAGGCGTCACC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TGCAGAGACCTCACTCTAGTCCTCCTCGCTTTGTGACAGTAGAAGAACTTCTAGAGACAGCGAGAGGTGTCACC  222

Query  223  AACATGGCTCTAGCCCATGAAATTGTAGTAAATGGAGACTTTCAGATTAAACCAGTTGAATTACCAGAAAACAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACATGGCTCTAGCCCATGAAATTGTAGTAAATGGAGACTTTCAGATTAAACCAGTTGAATTACCAGAAAACAG  296

Query  297  CTTGAAGAAGAGAGTAAAGGAGATTGTACATAAAGCGTTTTGGGATTGCTTGAGTGTGCAGCTAAGTGAAGATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTGAAGAAGAGAGTAAAGGAGATTGTACATAAAGCGTTTTGGGATTGCTTGAGTGTGCAGCTAAGTGAAGATC  370

Query  371  CCCCAGCATATGACCATGCTATCAAACTTGTAGGAGAAATCAAAGAGACTCTCTTATCTTTCTTGCTGCCTGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCAGCATATGACCATGCTATCAAACTTGTAGGAGAAATCAAAGAGACTCTCTTATCTTTCTTGCTGCCTGGT  444

Query  445  CATACTAGACTGAGAAACCAGATAACAGAAGTCTTGGATCTGGATCTGATAAAGCAGGAAGCAGAGAATGGGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATACTAGACTGAGAAACCAGATAACAGAAGTCTTGGATCTGGATCTGATAAAGCAGGAAGCAGAGAATGGGGC  518

Query  519  GCTAGACATTTCCAGGCTGGCAGAATTCATTATTGGCATGATGGGGACACTGTGTGCACCTGCTCGAGATGAGG  592
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTAGACATTTCCAAGCTGGCAGAATTCATTATTGGCATGATGGGGACACTGTGTGCACCTGCTCGAGATGAGG  592

Query  593  AAGTTAAGAAACTAAAGGACATTAAGGAAATAGTGCCCCTTTTCAGAGAAATTTTTTCTGTGTTGGACCTAATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGTTAAGAAACTAAAGGACATTAAGGAAATAGTGCCCCTTTTCAGAGAAATTTTTTCTGTGTTGGACCTAATG  666

Query  667  AAAGTGGACATGGCCAACTTTGCTATCAGTAGCATCAGGCCTCATCTCATGCAGCAGTCAGTTGAATACGAAAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTGGACATGGCCAACTTTGCTATCAGTAGCATCAGGCCTCATCTCATGCAGCAGTCAGTTGAATACGAAAG  740

Query  741  GAAGAAGTTTCAAGAGATTTTGGAGAGGCAACCAAATTCCCTGGACTTTGTCACCCAGTGGCTGGAAGAAGCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGAAGTTTCAAGAGATTTTGGAGAGGCAACCAAATTCCCTGGACTTTGTCACCCAGTGGCTGGAAGAAGCCT  814

Query  815  CAGAGGACCTTATGACTCAGAAGTATAAACACGCCCTGCCAGTGGGGGGAATGGCTGCTGGCTCTGGGGACATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGAGGACCTTATGACTCAGAAGTATAAACACGCCCTGCCAGTGGGGGGAATGGCTGCTGGCTCTGGGGACATG  888

Query  889  CCCAGGCTGAGCCCTGTTGCTGTCCAGAATTACGCTTACCTGAAGCTTCTGAAGTGGGACCACCTCCAGAGGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCAGGCTGAGCCCTGTTGCTGTCCAGAATTACGCTTACCTGAAGCTTCTGAAGTGGGACCACCTCCAGAGGCC  962

Query  963  GTTCCCCGAAACAGTTTTAATGGACCAGTCTCGCTTCCACGAGCTCCAGTTGCAGCTGGAACAACTGACCATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTCCCCGAAACAGTTTTAATGGACCAGTCTCGCTTCCACGAGCTCCAGTTGCAGCTGGAACAACTGACCATCC  1036

Query 1037  TGGGGGCTGTGTTGCTGGTCACCTTCAGCATGGCAGCGCCAGGAATTTCCAGCCAGGCCGACTTTGCTGAGAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGGGGCTGTGTTGCTGGTCACCTTCAGCATGGCAGCGCCAGGAATTTCCAGCCAGGCCGACTTTGCTGAGAAA  1110

Query 1111  CTCAAGATGATTGTGAAGATTTTGCTAACAGATATGCACCTGCCCTCCTTCCATCTGAAGGACGTCCTCACTAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCAAGATGATTGTGAAGATTTTGCTAACAGATATGCACCTGCCCTCCTTCCATCTGAAGGACGTCCTCACTAC  1184

Query 1185  CATCGGGGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGGTCCTCTCCCTTCACCACGGACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCGGGGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGGTCCTCTCCCTTCACCACGGACA  1258

Query 1259  AGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATCCAGGCCGTGGCCAGTCCCGATGACCCCATTCGCAGGATCATGGAATCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATCCAGGCCGTGGCCAGTCCCGATGACCCCATTCGCAGGATCATGGAATCT  1332

Query 1333  CGAATCCTGACCTTCTTAGAAACCTACCTTGCCTCGGGTCATCAGAAGCCATTGCCCACAGTCCCTGGGGGACT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGAATCCTGACCTTCTTAGAAACCTACCTTGCCTCGGGTCATCAGAAGCCATTGCCCACAGTCCCTGGGGGACT  1406

Query 1407  CAGTCCAGTTCAGAGAGAGCTGGAGGAAGTTGCTATTAAATTTGCTCGCCTGGTCAACTATAACAAGATGGTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGTCCAGTTCAGAGAGAGCTGGAGGAAGTTGCTATTAAATTTGCTCGCCTGGTCAACTATAACAAGATGGTCT  1480

Query 1481  TCTGTCCATACTACGATGCAATCCTGAGTAAGATCCTCGTCCGATCC  1527
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTGTCCCTACTACGATGCAATCCTGAGTAAGATCCTCGTCCGATCC  1527