Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08557
Subject:
NM_001267782.2
Aligned Length:
1301
Identities:
1206
Gaps:
93

Alignment

Query    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74

Query   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148

Query  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222

Query  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPSAFSTVQSSTAGNTLRNL  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPSAFSTVQSSTAGNTLRNL  296

Query  297  SLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASSVSLLSVLRQQEGGSQA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  SLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASSVSLLSVLRQQEGGSQA  370

Query  371  SVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELDQSLSGEAPQTQQAQEML  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  SVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELDQSLSGEAPQTQQAQEML  444

Query  445  NNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNYSSGEASSSWQVPSSFES  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  NNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNYSSGEASSSWQVPSSFES  518

Query  519  VPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSSRSGTVSQEALHQDMPEE  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  VPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSSRSGTVSQEALHQDMPEE  592

Query  593  SSEEDSLRR-----------------------------------------------------------------  601
            |||||||||                                                                 
Sbjct  593  SSEEDSLRRRSLALSPRLEYSGAILAHCKLRLPGSCHSPASASQVAGTTGAHHHARLIFAFLVEMEFHHVSQAG  666

Query  602  ----------------------------RLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSR  647
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  LELLTSGDLPTSASQSAGITGVSHRAWPRLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSR  740

Query  648  RDSIRQRSMRYQQNRLRSSTSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLL  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  RDSIRQRSMRYQQNRLRSSTSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLL  814

Query  722  PEYLPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQ  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  PEYLPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQ  888

Query  796  NCKIYNDASCDISADGQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVG  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  NCKIYNDASCDISADGQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVG  962

Query  870  LASRRILLHPSTEHMVAQVFRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDL  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  LASRRILLHPSTEHMVAQVFRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDL  1036

Query  944  VICRPEALNSGVEYYWDQLNETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTETL  1017
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1037  VICRPEALNSGVEYYWDQLNETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTQTL  1110

Query 1018  ALQLQNAETQTEREVPEPGTAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNN  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ALQLQNAETQTEREVPEPGTAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNN  1184

Query 1092  IIVSHRIHRSSQTGTEPGAAHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVP  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  IIVSHRIHRSSQTGTEPGAAHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVP  1258

Query 1166  IPVSLPSAEGPTVHCELTNNNHLLDGGSSRGDAAGPRGEPRNR  1208
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  IPVSLPSAEGPTLHCELTNNNHLLDGGSSRGDAAGPRGEPRNR  1301