Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08557
• Subject: NM_001367468.1
• Aligned Length: 1298
• Identities: 1206
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74
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Sbjct    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74

Query   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148

Query  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222

Query  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGI------------------------------------------  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQVGEQSTVQDSATPSPPPPPPQPSTERPRTSAYIRLRQRVSY  296

Query  255  ------------------------------------------------QTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPSA  280
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  PTAECCQHLGILCLCSRCSGTRVPSLLPHQDSVPPASARATTPSFSFVQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPSA  370

Query  281  FSTVQSSTAGNTLRNLSLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASS  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  FSTVQSSTAGNTLRNLSLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASS  444

Query  355  VSLLSVLRQQEGGSQASVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELDQ  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  VSLLSVLRQQEGGSQASVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELDQ  518

Query  429  SLSGEAPQTQQAQEMLNNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNYS  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  SLSGEAPQTQQAQEMLNNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNYS  592

Query  503  SGEASSSWQVPSSFESVPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSSR  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  SGEASSSWQVPSSFESVPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSSR  666

Query  577  SGTVSQEALHQDMPEESSEEDSLRRRLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSRRDS  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  SGTVSQEALHQDMPEESSEEDSLRRRLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSRRDS  740

Query  651  IRQRSMRYQQNRLRSSTSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPEY  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  IRQRSMRYQQNRLRSSTSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPEY  814

Query  725  LPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNCK  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  LPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNCK  888

Query  799  IYNDASCDISADGQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLAS  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  IYNDASCDISADGQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLAS  962

Query  873  RRILLHPSTEHMVAQVFRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVIC  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  RRILLHPSTEHMVAQVFRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVIC  1036

Query  947  RPEALNSGVEYYWDQLNETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTETLALQ  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1037  RPEALNSGVEYYWDQLNETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTQTLALQ  1110

Query 1021  LQNAETQTEREVPEPGTAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNIIV  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  LQNAETQTEREVPEPGTAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNIIV  1184

Query 1095  SHRIHRSSQTGTEPGAAHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVPIPV  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  SHRIHRSSQTGTEPGAAHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVPIPV  1258

Query 1169  SLPSAEGPTVHCELTNNNHLLDGGSSRGDAAGPRGEPRNR  1208
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  SLPSAEGPTLHCELTNNNHLLDGGSSRGDAAGPRGEPRNR  1298