Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08557
• Subject: NM_001367469.1
• Aligned Length: 1208
• Identities: 1117
• Gaps: 89

Alignment

Query    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74
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Sbjct    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74

Query   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148

Query  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222

Query  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPSAFSTVQSSTAGNTLRNL  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPSAFSTVQSSTAGNTLRNL  296

Query  297  SLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASSVSLLSVLRQQEGGSQA  370
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Sbjct  297  SLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASSVSLLSVLRQQEGGSQA  370

Query  371  SVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELDQSLSGEAPQTQQAQEML  444
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Sbjct  371  SVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELDQSLSGEAPQTQQAQEML  444

Query  445  NNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNYSSGEASSSWQVPSSFES  518
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Sbjct  445  NNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNYSSGEASSSWQVPSSFES  518

Query  519  VPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSSRSGTVSQEALHQDMPEE  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  VPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSSRSGTVSQEALHQDMPEE  592

Query  593  SSEEDSLRRRLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSRRDSIRQRSMRYQQNRLRSS  666
            |||||||||                                                                 
Sbjct  593  SSEEDSLRR-----------------------------------------------------------------  601

Query  667  TSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPEYLPYAGIFHERGQPGLA  740
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  602  ------------------------DNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPEYLPYAGIFHERGQPGLA  651

Query  741  THSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNCKIYNDASCDISADGQLL  814
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Sbjct  652  THSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNCKIYNDASCDISADGQLL  725

Query  815  AAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLASRRILLHPSTEHMVAQV  888
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Sbjct  726  AAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLASRRILLHPSTEHMVAQV  799

Query  889  FRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVICRPEALNSGVEYYWDQL  962
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Sbjct  800  FRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVICRPEALNSGVEYYWDQL  873

Query  963  NETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTETLALQLQNAETQTEREVPEPG  1036
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Sbjct  874  NETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTQTLALQLQNAETQTEREVPEPG  947

Query 1037  TAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNIIVSHRIHRSSQTGTEPGA  1110
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Sbjct  948  TAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNIIVSHRIHRSSQTGTEPGA  1021

Query 1111  AHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVPIPVSLPSAEGPTVHCELTN  1184
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Sbjct 1022  AHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVPIPVSLPSAEGPTLHCELTN  1095

Query 1185  NNHLLDGGSSRGDAAGPRGEPRNR  1208
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Sbjct 1096  NNHLLDGGSSRGDAAGPRGEPRNR  1119