Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08557
• Subject: NM_001367470.1
• Aligned Length: 1208
• Identities: 1027
• Gaps: 179

Alignment

Query    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------MERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  43

Query  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPSAFSTVQSSTAGNTLRNL  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPSAFSTVQSSTAGNTLRNL  117

Query  297  SLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASSVSLLSVLRQQEGGSQA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  SLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASSVSLLSVLRQQEGGSQA  191

Query  371  SVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELDQSLSGEAPQTQQAQEML  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  SVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELDQSLSGEAPQTQQAQEML  265

Query  445  NNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNYSSGEASSSWQVPSSFES  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  NNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNYSSGEASSSWQVPSSFES  339

Query  519  VPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSSRSGTVSQEALHQDMPEE  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  VPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSSRSGTVSQEALHQDMPEE  413

Query  593  SSEEDSLRRRLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSRRDSIRQRSMRYQQNRLRSS  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  SSEEDSLRRRLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSRRDSIRQRSMRYQQNRLRSS  487

Query  667  TSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPEYLPYAGIFHERGQPGLA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  TSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPEYLPYAGIFHERGQPGLA  561

Query  741  THSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNCKIYNDASCDISADGQLL  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  THSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNCKIYNDASCDISADGQLL  635

Query  815  AAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLASRRILLHPSTEHMVAQV  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  AAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLASRRILLHPSTEHMVAQV  709

Query  889  FRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVICRPEALNSGVEYYWDQL  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  FRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVICRPEALNSGVEYYWDQL  783

Query  963  NETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTETLALQLQNAETQTEREVPEPG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  784  NETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTQTLALQLQNAETQTEREVPEPG  857

Query 1037  TAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNIIVSHRIHRSSQTGTEPGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  TAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNIIVSHRIHRSSQTGTEPGA  931

Query 1111  AHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVPIPVSLPSAEGPTVHCELTN  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  932  AHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVPIPVSLPSAEGPTLHCELTN  1005

Query 1185  NNHLLDGGSSRGDAAGPRGEPRNR  1208
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  NNHLLDGGSSRGDAAGPRGEPRNR  1029