Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08557
• Subject: NM_172669.3
• Aligned Length: 1300
• Identities: 1156
• Gaps: 92

Alignment

Query    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGTRAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74

Query   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148

Query  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222

Query  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGI------------------------------------------  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQVGEQSTVQDSATPSPPPPPPQPSTERPRTSAYIRLRQRVSY  296

Query  255  -------------------------------------------------QTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPS  279
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  PTTVECCQHPGILCLCSRCAGTRVPSLLPHQDSVPPASARATTPSFSFVQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPS  370

Query  280  AFSTVQSSTAGNTLRNLSLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSAS  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  371  AFSTVQSSTAGNTLRNLSLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHRELAPGLTGSEWTRTVLTLNSRSEVESMPPPRTSAS  444

Query  354  SVSLLSVLRQQEGGSQASVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELD  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  SVSLLSVLRQQEGGSQASVYTSATEGRGFPSSGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELD  518

Query  428  QSLSGEAPQTQQAQEMLNNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNY  501
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  QSLSGETPQTQQAQEMLNNNIESERPGPSHLPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNY  592

Query  502  SSGEASSSWQVPSSFESVPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSS  575
            |||||||||.|...||..|.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  SSGEASSSWHVSTTFEGMPPSGNQLPPLERTEGQMPSSSRLELSSSASSQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSS  666

Query  576  RSGTVSQEALHQDMPEESSEEDSLRRRLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSRRD  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  RSGTVSQEALHQDMPEESSEEDSLRRRLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSRRD  740

Query  650  SIRQRSMRYQQNRLRSSTSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPE  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  SIRQRSMRYQQNRLRSSTSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPE  814

Query  724  YLPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNC  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  YLPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNC  888

Query  798  KIYNDASCDISADGQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLA  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  KIYNDASCDISADGQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLA  962

Query  872  SRRILLHPSTEHMVAQVFRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVI  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  SRRILLHPSTEHMVAQVFRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVI  1036

Query  946  CRPEALNSGVEYYWDQLNETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTETLAL  1019
            |||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1037  CRPEALNSGIEYYWDQLSETVFTVHSSSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPTTSVTSQGTQTLAL  1110

Query 1020  QLQNAETQTEREVPEPGTAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNII  1093
            ||||||||||||..|||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  QLQNAETQTEREEEEPGAASSGPGEGEGSEYGGSGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNII  1184

Query 1094  VSHRIHRSSQTGTEPGAAHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVPIP  1167
            ||||||||||||||.|||.||||||||||||..|.||||||.|||||||||||.|.|||..||.|.||||||||
Sbjct 1185  VSHRIHRSSQTGTESGAARTSSPQPSTSRGLPSEPGQLAERALSPRTASWDQPSTSGRELPQPALSSSSPVPIP  1258

Query 1168  VSLPSAEGPTVHCELTNNNHLLDG-GSSRGDAAGPRGEPRNR  1208
            |.|.|.||||.||..|||.||..| ||.||.||||.|||.||
Sbjct 1259  VPLASNEGPTMHCNVTNNSHLPEGDGSNRGEAAGPSGEPQNR  1300