Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08557
Subject:
XM_006499252.1
Aligned Length:
1300
Identities:
1127
Gaps:
121

Alignment

Query    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MKVVPEKNAVRILWGRERGTRAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVN  74

Query   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  HNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPT  148

Query  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AQLLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSH  222

Query  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGI------------------------------------------  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  223  YRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQVGEQSTVQDSATPSPPPPPPQPSTERPRTSAYIRLRQRVSY  296

Query  255  -------------------------------------------------QTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPS  279
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  PTTVECCQHPGILCLCSRCAGTRVPSLLPHQDSVPPASARATTPSFSFVQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPS  370

Query  280  AFSTVQSSTAGNTLRNLSLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSAS  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  371  AFSTVQSSTAGNTLRNLSLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHRELAPGLTGSEWTRTVLTLNSRSEVESMPPPRTSAS  444

Query  354  SVSLLSVLRQQEGGSQASVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELD  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  SVSLLSVLRQQEGGSQASVYTSATEGRGFPSSGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELD  518

Query  428  QSLSGEAPQTQQAQEMLNNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNY  501
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  QSLSGETPQTQQAQEMLNNNIESERPGPSHLPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNY  592

Query  502  SSGEASSSWQVPSSFESVPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSS  575
            |||||||||.|...||..|.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  SSGEASSSWHVSTTFEGMPPSGNQLPPLERTEGQMPSSSRLELSSSASSQEERTVGVAFNQETGHWERIYTQSS  666

Query  576  RSGTVSQEALHQDMPEESSEEDSLRRRLLESSLISLSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSRRD  649
            |||||||||||||||||||||||||                             ||||||||||||||||||||
Sbjct  667  RSGTVSQEALHQDMPEESSEEDSLR-----------------------------RLSPAAYYAQRMIQYLSRRD  711

Query  650  SIRQRSMRYQQNRLRSSTSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPE  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  712  SIRQRSMRYQQNRLRSSTSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPE  785

Query  724  YLPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNC  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  YLPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNC  859

Query  798  KIYNDASCDISADGQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLA  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  860  KIYNDASCDISADGQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLA  933

Query  872  SRRILLHPSTEHMVAQVFRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVI  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  SRRILLHPSTEHMVAQVFRLQQAHGGETSMRRVFNVLYPMPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVI  1007

Query  946  CRPEALNSGVEYYWDQLNETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVTSQGTETLAL  1019
            |||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1008  CRPEALNSGIEYYWDQLSETVFTVHSSSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPTTSVTSQGTQTLAL  1081

Query 1020  QLQNAETQTEREVPEPGTAASGPGEGEGSEYGASGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNII  1093
            ||||||||||||..|||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  QLQNAETQTEREEEEPGAASSGPGEGEGSEYGGSGEDALSRIQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNII  1155

Query 1094  VSHRIHRSSQTGTEPGAAHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPSSSPVPIP  1167
            ||||||||||||||.|||.||||||||||||..|.||||||.|||||||||||.|.|||..||.|.||||||||
Sbjct 1156  VSHRIHRSSQTGTESGAARTSSPQPSTSRGLPSEPGQLAERALSPRTASWDQPSTSGRELPQPALSSSSPVPIP  1229

Query 1168  VSLPSAEGPTVHCELTNNNHLLDG-GSSRGDAAGPRGEPRNR  1208
            |.|.|.||||.||..|||.||..| ||.||.||||.|||.||
Sbjct 1230  VPLASNEGPTMHCNVTNNSHLPEGDGSNRGEAAGPSGEPQNR  1271