Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08566
• Subject: NM_018044.4
• Aligned Length: 1398
• Identities: 1286
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGGGCTGTATGCTGCAGCTGCAGGCGTGTTGGCCGGCGTGGAGAGCCGCCAGGGCTCTATCAAGGGGTTGGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCTGTATGCTGCAGCTGCAGGCGTGTTGGCCGGCGTGGAGAGCCGCCAGGGCTCTATCAAGGGGTTGGT  74

Query   75  GTACTCCAGCAACTTCCAGAACGTGAAGCAGCTGTACGCGCTGGTGTGCGAAACGCAGCGCTACTCCGCCGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTACTCCAGCAACTTCCAGAACGTGAAGCAGCTGTACGCGCTGGTGTGCGAAACGCAGCGCTACTCCGCCGTGC  148

Query  149  TGGATGCTGTGATCGCCAGCGCCGGCCTCCTCCGTGCGGAGAAGAAGCTGCGGCCGCACCTGGCCAAGGTGCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGATGCTGTGATCGCCAGCGCCGGCCTCCTCCGTGCGGAGAAGAAGCTGCGGCCGCACCTGGCCAAGGTGCTA  222

Query  223  GTGTATGAGTTGTTGTTGGGAAAGGGCTTTCGAGGGGGTGGGGGCCGATGGAAGGCTCTGTTGGGCCGGCACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGTATGAGTTGTTGTTGGGAAAGGGCTTTCGAGGGGGTGGGGGCCGATGGAAGGCTCTGTTGGGCCGGCACCA  296

Query  297  GGCGAGGCTCAAGGCTGAGTTGGCTCGGCTCAAGGTTCATCGGGGTGTGAGCCGGAATGAGGACCTGTTGGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCGAGGCTCAAGGCTGAGTTGGCTCGGCTCAAGGTTCATCGGGGTGTGAGCCGGAATGAGGACCTGTTGGAAG  370

Query  371  TGGGATCCAGGCCTGGTCCAGCCTCCCAGCTGCCTCGATTTGTGCGTGTGAACACTCTCAAGACCTGCTCCGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGGATCCAGGCCTGGTCCAGCCTCCCAGCTGCCTCGATTTGTGCGTGTGAACACTCTCAAGACCTGCTCCGAT  444

Query  445  GATGTAGTTGATTATTTCAAGAGACAAGGTTTCTCCTATCAGGGTCGGGCTTCCAGCCTCGATGACTTACGAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGTAGTTGATTATTTCAAGAGACAAGGTTTCTCCTATCAGGGTCGGGCTTCCAGCCTCGATGACTTACGAGC  518

Query  519  CCTCAAGGGGAAGCATTTTCTCCTGGACCCCTTGATGCCGGAGCTGCTGGTGTTTCCCGCCCAGACAGATCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTCAAGGGGAAGCATTTTCTCCTGGACCCCTTGATGCCGGAGCTGCTGGTGTTTCCCGCCCAGACAGATCTGC  592

Query  593  ATGAACACCCACTGTACCGGGCCGGACACCTCATTCTGCAGGACAGGGCCAGCTGTCTCCCAGCCATGCTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAACACCCACTGTACCGGGCCGGACACCTCATTCTGCAGGACAGGGCCAGCTGTCTCCCAGCCATGCTGCTG  666

Query  667  GACCCCCCGCCAGGCTCCCATGTCATCGATGCCTGTGCCGCCCCAGGCAATAAGACCAGTCACTTGGCTGCTCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCCCCCGCCAGGCTCCCATGTCATCGATGCCTGTGCCGCCCCAGGCAATAAGACCAGTCACTTGGCTGCTCT  740

Query  741  TCTGAAGAACCAAGGGAAGATCTTTGCCTTTGACCTGGATGCCAAGCGGCTGGCATCCATGGCCACGCTGCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTGAAGAACCAAGGGAAGATCTTTGCCTTTGACCTGGATGCCAAGCGGCTGGCATCCATGGCCACGCTGCTGG  814

Query  815  CCCGGGCTGGCGTCTCTTGCTGTGAACTGGCTGAGGAGGACTTCCTGGCGGTCTCCCCCTCGGATCCACGCTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCGGGCTGGCGTCTCTTGCTGTGAACTGGCTGAGGAGGACTTCCTGGCGGTCTCCCCCTCGGATCCACGCTAC  888

Query  889  CATGAGGTCCACTACATCCTGCTGGATCCTTCCTGCAGTGGCTCGGGTATGCCGAGCAGACAGCTGGAGGAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATGAGGTCCACTACATCCTGCTGGATCCTTCCTGCAGTGGCTCGGGTATGCCGAGCAGACAGCTGGAGGAGCC  962

Query  963  CGGGGCAGGCACACCTAGCCCGGTGCGTCTGCATGCCCTGGCAGGGTTCCAGCAGCGAGCCCTGTGCCACGCAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGGGCAGGCACACCTAGCCCGGTGCGTCTGCATGCCCTGGCAGGGTTCCAGCAGCGAGCCCTGTGCCACGCAC  1036

Query 1037  TCACTTTCCCTTCCCTGCAGCGGCTCGTCTACTCCACGTGCTCCCTCTGCCAGGAGGAGAATGAAGACGTGGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCACTTTCCCTTCCCTGCAGCGGCTCGTCTACTCCACGTGCTCCCTCTGCCAGGAGGAGAATGAAGACGTGGTG  1110

Query 1111  CGAGATGCGCTGCAGCAGAACCCGGGCGCCTTCAGGCTAGCTCCCGCCCTGCCTGCCTGGCCCCACCGAGGCCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGAGATGCGCTGCAGCAGAACCCGGGCGCCTTCAGGCTAGCTCCCGCCCTGCCTGCCTGGCCCCACCGAGGCCT  1184

Query 1185  GAGCACGTTCCCGGGTGCCGAGCACTGCCTCCGGGCCTCCCCTGAGACCACACTCAGCAGTGGCTTCTTCGTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGCACGTTCCCGGGTGCCGAGCACTGCCTCCGGGCCTCCCCTGAGACCACACTCAGCAGTGGCTTCTTCGTTG  1258

Query 1259  CTGTAATTGAACGGGTCGAGGTGCCAAGCTCAGCCTCACAGGCCAAAGCATCAGCACCAGAACGCACACCCAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||.                                             
Sbjct 1259  CTGTAATTGAACGGGTCGAGGTGCCAAGG---------------------------------------------  1287

Query 1333  CCAGCCCCAAAGAGAAAGAAGAGACAGCAAAGAGCCGCAGCCGGTGCTTGCACACCGCCTTGCACA  1398
                                                                              
Sbjct 1288  ------------------------------------------------------------------  1287