Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08581
• Subject: NM_001172655.1
• Aligned Length: 1593
• Identities: 1391
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGATGGTCTCGAACTCCCGACATCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCACTCAGCCTCCCTGTTTTGAAGGATTGACTTCTAAAGACTTGG  148

Query    1  --------------------------------------------------ATGGCTCTTCCTCAGGGTCTACTG  24
                                                              ||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  149  TACGTGAGGAAAAAACACGGAAGAGGAAGAGGAAAGCAAAGGAGTCAGGGATGGCTCTTCTTCAGGGTCTACTG  222

Query   25  ACATTCAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTCAGGAGGAGTGGAAATGCCTGGACCCTGCTCAGAGGACTCTATA  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACATTCAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTCAGGAGGAGTGGAAATGCCTGGACCCTGCTCAGAGGACTCTATA  296

Query   99  CAGAGACGTGATGCTGGAGAATTATAGGAACCTGGTCTCCCTGGATACCTCTTCCAAATGCATGATGAAGATGT  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGAGACGTGATGCTGGAGAATTATAGGAACCTGGTCTCCCTGGATACCTCTTCCAAATGCATGATGAAGATGT  370

Query  173  TCTCATCAACAGGACAAGGCAATACAGAAGTGGTCCACACAGGGACATTGCAAATACATGCAAGTCATCACATT  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCATCAACAGGACAAGGCAATACAGAAGTGGTCCACACAGGGACATTGCAAATACATGCAAGTCATCACATT  444

Query  247  GGAGATACTTGCTTCCAGGAAATTGAGAAAGATATTCATGACTTTGTGTTTCAGTGGCAAGAAAATGAAACAAA  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAGATACTTGCTTCCAGGAAATTGAGAAAGATATTCATGACTTTGTGTTTCAGTGGCAAGAAAATGAAACAAA  518

Query  321  TGGCCATGAAGCACTCATGACAAAAATCAAAAAGTTGATGAGTAGTACAGAGCGACATGATCAAAGGCATGCTG  394
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGCCATGAAGCACTCATGACAAAAACCAAAAAGTTGATGAGTAGTACAGAGCGACATGATCAAAGGCATGCTG  592

Query  395  GAAACAAACCTATTAAAAATGAGCTTGGATCAAGCTTTCATTCGCATCTGCCTGAAGTGCACATATTTCACCCC  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAACAAACCTATTAAAAATGAGCTTGGATCAAGCTTTCATTCGCATCTGCCTGAAGTGCACATATTTCACCCC  666

Query  469  GAAGGGAAAATTGGTAATCAAGTTGAGAAGGCTATCAACGATGCTTTCTCAGTTTCAGCATCCCAACGAATTTC  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAGGGAAAATTGGTAATCAAGTTGAGAAGGCTATCAACGATGCTTTCTCAGTTTCAGCATCCCAACGAATTTC  740

Query  543  CTGTAGGCCAAAAACTCGTATTTCTAATAAGTATAGGAATAATTTCCTCCAGTCTTCATTACTCACACAAAAAC  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTAGGCCAAAAACTCGTATTTCTAATAAGTATAGGAATAATTTCCTCCAGTCTTCATTACTCACACAAAAAC  814

Query  617  GGGAAGTACACACAAGAGAAAAATCTTTCCAACGTAATGAGAGTGGCAAAGCCTTTAATGGTAGCTCACTCTTA  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGAAGTACACACAAGAGAAAAATCTTTCCAACGTAATGAGAGTGGCAAAGCCTTTAATGGTAGCTCACTCTTA  888

Query  691  AAAAAACATCAGATAATCCATTTAGGAGACAAACAGTATAAATGTGATGTATGCGGCAAGGACTTTCATCAGAA  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAAAACATCAGATAATCCATTTAGGAGACAAACAGTATAAATGTGATGTATGCGGCAAGGACTTTCATCAGAA  962

Query  765  GCGATACCTTGCATGCCATAGATGTCACACTGGTGAGAATCCTTACAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGACATTCA  838
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGATACCTTGCATGCCATAGATGTCACACTGGTGAGAATCCTTACACGTGTAATGAGTGTGGCAAGACATTCA  1036

Query  839  GTCACAATTCAGCCCTGTTAGTTCACAAGGCAATTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAGTGTAATGAATGTGGC  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTCACAATTCAGCCCTGTTAGTTCACAAGGCAATTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAGTGTAATGAATGTGGC  1110

Query  913  AAGGTTTTTAATCAACAATCAAACCTTGCACGTCATCATAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAATGTGA  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGGTTTTTAATCAACAATCAAACCTTGCACGTCATCATAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAATGTGA  1184

Query  987  AGAATGTGACAAAGTTTTCAGTCGCAAATCACACCTTGAAAGACATAGGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCAT  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAATGTGACAAAGTTTTCAGTCGCAAATCACACCTTGAAAGACATAGGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCAT  1258

Query 1061  ACAAATGTAAGGTTTGTGACAAGGCTTTCAGACGTGATTCACACCTGGCACAACATACTGTAATTCACACTGGA  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAAATGTAAGGTTTGTGACAAGGCTTTCAGACGTGATTCACACCTGGCACAACATACTGTAATTCACACTGGA  1332

Query 1135  GAGAAACCTTACAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGACCTTCGTTCAAAATTCATCTCTTGTAATGCATAAGGTCAT  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGAAACCTTACAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGACCTTTGTTCAAAATTCATCTCTTGTAATGCATAAGGTCAT  1406

Query 1209  TCATACTGGAGAGAAACGTTACAAGTGTAATGAATGTGGCAAGGTTTTTAATCACAAATCAAACCTTGCATGTC  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCATACTGGAGAGAAACGTTACAAGTGTAATGAATGTGGCAAGGTTTTTAATCACAAATCAAACCTTGCATGTC  1480

Query 1283  ATCGTAGACTTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAGTGTAATGAATGTGGCAAGGTTTTTAATCGAAAATCAAAC  1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCGTAGACTTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAGTGTAATGAATGTGGCAAGGTTTTTAATCGAAAATCAAAC  1554

Query 1357  CTTGAACGTCATCATAGACTTCATACTGGAAAGAAATCT  1395
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTTGAACGTCATCATAGACTTCATACTGGAAAGAAATCT  1593