Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08584
• Subject: NM_001367289.1
• Aligned Length: 1989
• Identities: 1672
• Gaps: 315

Alignment

Query    1  ATGCTGCAAATGCCGAAGTTAAATGAAATACCTCCGGGGAGGGCAGGCCGCAGGGAGGCTCGGGGGGAGGGAAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATGGCCTGGACAAACAGGTCCTGAAGCTGCGAGGCTGGAGTGGAGGGCGCAGGGGCAGGCGGGCGGCGCCAGAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTCCATGGGACAGCTGGGGAAGCTCCAGGCTACCTACACAACCTGGCCCAGGCTGGTCACGGTGTCCCCCGTCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTGCTCTGTGCCCTCTCCTTCCAGAAATCCACCATGGAGAGTAAGGATGAGGTCAGCGACACCGACAGTGGCAT  296
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------ATGGAGAGTAAGGATGAGGTCAGCGACACCGACAGTGGCAT  41

Query  297  CATCCTGCAGTCTGGCCCCGACAGCCCGGTCTCCCCAATGAAGGAGCTGACCCATGCAGTGCACAAGCAGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  CATCCTGCAGTCTGGCCCCGACAGCCCGGTCTCCCCAATGAAGGAGCTGACCCATGCAGTGCACAAGCAGCAGA  115

Query  371  GGGCCCTGGAAGCGAGGCTGGAGGCCTGCCTGGAGGAGCTGAGGAGACTCTGCCTTCGGGAAGCGGAGCTGACG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  GGGCCCTGGAAGCGAGGCTGGAGGCCTGCCTGGAGGAGCTGAGGAGACTCTGCCTTCGGGAAGCGGAGCTGACG  189

Query  445  GGCACCTTGCCAGCGGAGTATCCCCTCAAACCAGGGGAAAAGGCCCCCAAGGTTCGCCGCAGGATCGGAGCGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  GGCACCTTGCCAGCGGAGTATCCCCTCAAACCAGGGGAAAAGGCCCCCAAGGTTCGCCGCAGGATCGGAGCGGC  263

Query  519  TTACAAACTGGATGACTGGGCCTTGCACAGAGAGGACCCCCTAAGCAGCCTGGAGCGCCAGCTGGCCCTGCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  TTACAAACTGGATGACTGGGCCTTGCACAGAGAGGACCCCCTAAGCAGCCTGGAGCGCCAGCTGGCCCTGCAGC  337

Query  593  TGCAGATCACAGAGGCAGCCCGTCGGCTGTGCCTGGAGGAGAACCTCAGCAGGCAGGCTCGGCGGCAGCGGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  TGCAGATCACAGAGGCAGCCCGTCGGCTGTGCCTGGAGGAGAACCTCAGCAGGCAGGCTCGGCGGCAGCGGAAG  411

Query  667  CACTCCATGCTGCAGGAGGAGAAGAAGCTGCAGGAGCTCCAGCGCTGCCTGGTCGAGCGGCGGCGCAATAGCGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  CACTCCATGCTGCAGGAGGAGAAGAAGCTGCAGGAGCTCCAGCGCTGCCTGGTCGAGCGGCGGCGCAATAGCGA  485

Query  741  GCCACCTCCGGCTGCTGCTCTCCCCCTGGGCCGAGAGCTCAGTGCCTCTGATGACAGCTCCCTGTCAGATGGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  GCCACCTCCGGCTGCTGCTCTCCCCCTGGGCCGAGAGCTCAGTGCCTCTGATGACAGCTCCCTGTCAGATGGGC  559

Query  815  TCCTCCTGGAGGAAGAGGAATCCCAAGTGCCAAAACCTCCTCCAGAGTCTCCAGCCCCACCTTCTCGGCCTCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  TCCTCCTGGAGGAAGAGGAATCCCAAGTGCCAAAACCTCCTCCAGAGTCTCCAGCCCCACCTTCTCGGCCTCTC  633

Query  889  CCACCCCAAACCCTTGAGGGTCTGCAGCCAACAGGACCTGAGGCTGGGAGCCCAGAACGGGCTCCAGTCCAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  CCACCCCAAACCCTTGAGGGTCTGCAGCCAACAGGACCTGAGGCTGGGAGCCCAGAACGGGCTCCAGTCCAGAA  707

Query  963  CAGCCCCTGGAAGGAAACCAGCCTGGACCACCCCTATGAGAAGCCCAGGAAGTCTTCTGAGCCCTGGAGCGAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  CAGCCCCTGGAAGGAAACCAGCCTGGACCACCCCTATGAGAAGCCCAGGAAGTCTTCTGAGCCCTGGAGCGAGT  781

Query 1037  CCAGCAGCCCAGCCACCACACCACAGGATGGGCCCAGTGCCTCCAGCCTGTGGCTTCTGGAGCCTGCCTCCTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  CCAGCAGCCCAGCCACCACACCACAGGATGGGCCCAGTGCCTCCAGCCTGTGGCTTCTGGAGCCTGCCTCCTAC  855

Query 1111  CACGTGGTTCCCATCCGTGGTGTTCCTGGCCAGTGGCAGGGCCGCACCAGTGCCCCAGCCACCCCTGAGATACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  CACGTGGTTCCCATCCGTGGTGTTCCTGGCCAGTGGCAGGGCCGCACCAGTGCCCCAGCCACCCCTGAGATACA  929

Query 1185  GGGGAGGAGGGGCCAGTCGCAGTCTCTGAGGGTGGATTCCTTCCGGGCGGGTCCTGAGGGCCGAGGTCGCAGCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  GGGGAGGAGGGGCCAGTCGCAGTCTCTGAGGGTGGATTCCTTCCGGGCGGGTCCTGAGGGCCGAGGTCGCAGCG  1003

Query 1259  CCTTTCCCCGCCGCCGCCCCACTCACTACACGGTGACAGTGCCAGATTCCTGCTTTCCCGCGACCAAGCCCCCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  CCTTTCCCCGCCGCCGCCCCACTCACTACACGGTGACAGTGCCAGATTCCTGCTTTCCCGCGACCAAGCCCCCG  1077

Query 1333  CTGCCCCACGCCGCCTGCCACTCCTGCTCAGAAGACAGTGGCTCTGACGTCTCCAGCATCTCCCACCCCACTTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  CTGCCCCACGCCGCCTGCCACTCCTGCTCAGAAGACAGTGGCTCTGACGTCTCCAGCATCTCCCACCCCACTTC  1151

Query 1407  GCCGGGCAGCAGCAGCCCCGACATCTCCTTTCTGCAGCCTCTCTCCCCTCCCAAGACCCATCGTCACCGCGGGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  GCCGGGCAGCAGCAGCCCCGACATCTCCTTTCTGCAGCCTCTCTCCCCTCCCAAGACCCATCGTCACCGCGGGG  1225

Query 1481  CCTGGGTCCCAGCCGGCAGCAGAGAGCTGGTCGCCCACCACCCCAAGCTACTGCTGCCGCCTGGCTATTTCCCG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  CCTGGGTCCCAGCCGGCAGCAGAGAGCTGGTCGCCCACCACCCCAAGCTACTGCTGCCGCCTGGCTATTTCCCG  1299

Query 1555  GCGGGGCGGTACGTGGTGGTGGCTGAGAGCCCCCTGCCGCCTGGCGAGTGGGAGCTGTGCCGCGCAGCCCCGGG  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1300  GCGGGGCGGTACGTGGTGGTGGCTGAGAGCCCCCTGCCGCCTGGCGAGTGGGAGCTGCGCCGCGCAGCCCCGGG  1373

Query 1629  CCCTGCTTACGAGGAGGAGGGCACTCCCCTGCGCTACCAGCGTCTGGTGCCCTCCCGCAGCCGCATCGTGCGGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374  CCCTGCTTACGAGGAGGAGGGCACTCCCCTGCGCTACCAGCGTCTGGTGCCCTCCCGCAGCCGCATCGTGCGGA  1447

Query 1703  CGCCCTCCCTGAAGGACAGCCCGGCAGGCCGGGGGCTCAGCAAGGCCGCCGTGTCCGAGGAGCTCAAGTGGTGG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448  CGCCCTCCCTGAAGGACAGCCCGGCAGGCCGGGGGCTCAGCAAGGCCGCCGTGTCCGAGGAGCTCAAGTGGTGG  1521

Query 1777  CACGAGCGTGCACGCCTCCGGAGCACCCGACCCCACTCACTGGACCGCCAAGGAGCTTTCCGGGTCAGGAGCCT  1850
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 1522  CACGAGCGTGCACGCCTCCGGAGCACCCGCCCCCACTCACTGGACCGCCAAGGAGCTTTCCG------------  1583

Query 1851  GCCCCTTGGGAGAGAGGGCTTCGGACGAGCCCTGGGACCCCGGGCACAGGTGCCCACAGTTTGTGTGCTGCGGA  1924
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584  ------------------------------------------------GGTGCCCACAGTTTGTGTGCTGCGGA  1609

Query 1925  GATCGCCTGATGGGGCCCCTGTGCAAGTCTTTGTACCTGAAAAAGGAGAGATCATCAGCCAGGTG  1989
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610  GATCGCCTGATGGGGCCCCTGTGCAAGTCTTTGTACCTGAAAAAGGAGAGATCATCAGCCAGGTG  1674